体外培养瘤胃微生物总DNA的提取与纯化

主要目的是寻找一种能最大限度获取所有类型的瘤胃微生物大片段DNA的提取方法,为后期分子生物学技术研究瘤胃微生物奠定基础。采用液氮冻融+溶菌酶+CTAB和SDS相结合的方法处理瘤胃样品并充分破壁,再采用酚/氯仿/异戊醇抽提、异丙醇沉淀获得DNA粗提物,经过试剂盒纯化后得到瘤胃微生物DNA样品。经特异性引物PCR检测,本方法所提取的DNA包含细菌、古细菌、真菌及原虫四类微生物信息。因此,采用该方法提取的DNA可用于后期实时定量PCR或DGGE等研究。     

土壤细菌DNA的抽提及分析

应用不同的方法从土壤中分离细菌DNA，以紫外分光光度法及琼脂糖凝胶电泳法分析所得细菌DNA的纯度与得率，比较不同的细菌收集缓冲液、细菌裂解缓冲液、细菌裂解过程及不同的抽提修饰步骤对土壤细菌DNA抽提结果的影响，确定了最佳的土壤细菌DNA抽提方案，以该方案对土壤细菌DNA进行了大规模的抽提，所得产物的A260／A280为1．68，A260／A230为0．87，得率ω(DNA／干土)为1.90μg／g。在土壤细菌中加入1μg标准λDNA进行了3次回收实验，平均回收率为82．33％。     

生命之美丽螺旋

在基因遗传过程中，细胞就像封闭的发动机一样发挥着作用。在这个发动机里，DNA不断复制自身，并修复受到损伤的DNA。这样，经过反复复制和修复，每个生物体活着的细胞内都包含着同样的DNA这个庞大的数据库。几十亿年来，DNA一直为生命的繁殖和变异而忙碌着。DNA分子不断地复制，使得细胞能够自身繁殖，使父母能有了子女，使生命能免延续。     

混合动力汽车故障数据记录系统设计

以某ISG(integrated starter and generater)型混合动力电动汽车为研究对象,开展混合动力电动汽车故障诊断数据记录系统的研究.通过CAN总线和K线的应用,建立混合动力汽车故障诊断信息数据采集的通讯网络.设计了包括CPU处理模块、通信模块、USB存储模块等故障诊断数据记录系统的硬件结构.针对系统要求和特点,在系统硬件方案设计、软件设计的基础上,对USB在系统中实现数据的海量信息存储应用进行了具体的电路设计和分析.在车辆行驶信息记录实验过程中,该故障信息记录系统运行稳定,数据记录完整、准确,在线显示的参数也能较好地反映车辆行驶状态.     

危险致病细菌的基因组面纱被揭开

中世纪以来，严重的食物中毒、伤寒、鼠疫等一直侵害着人的健康。科学家们经过长期的研究，经于揭开了这些致病细菌的基因组的面纱。来自加拿大、英国、越南、丹麦和美国的科学家们对两株沙门氏菌的DNA进行了测序：其中一株为引起致死性食物中毒的沙门氏菌，这种致病细菌危害着全球成千上万人的健康；     

原核CRISPR-Cas系统的结构功能及应用

CRISPR-Cas系统是新近在原核生物中发现的一种抵御外来DNA入侵的免疫机制,由一个成簇规则间隔的短回文重复序列(CRISPR)和附属的蛋白质(Cas)组成,广泛分布于真细菌和古菌中.CRISPR由重复序列及其间隔序列组成,间隔序列来自于过去的入侵DNA,并插入到细菌的CRISPR排列中.一旦出现新的入侵,CRISPR转录,其RNA经过加工后与Cas蛋白质组成一个核蛋白复合体,该复合体通过RNA与入侵DNA序列之间的互补配对,结合目标序列,最后Cas蛋白质将入侵DNA降解.此外,基于CRISPR系统中的Cas9蛋白,发展了一种新的基因组编辑技术,在不同的细胞中均能获得高效的基因定点打靶,展现出巨大的潜力.     

极端嗜热纤维素分解菌分子特征

从云南邦拿掌温泉中采集样品，经过多次富集、筛选，最后分离出6株高温严格厌氧纤维素分解细菌，通过随机扩增多态性DNA(RAPD)分析，研究了这6株形态、生理、代谢特性相似的高温严格厌氧纤维素分解茵的遗传多样性，并根据实验统计数据作出6株茵的亲缘关系图，同时对产酶活性较高的B7细菌进行16SrDNA序列分析，确定了其系统分类地位。     

自来水中细菌宏基因组DNA的浓度与细菌菌落总数的相关性分析

分析自来水中细菌宏基因组DNA浓度与细菌菌落总数之间的相关性,探索新的自来水细菌菌落总数检测方法。采用国标法检测自来水中的细菌菌落总数约为(165±5)CFU/m L,高于国标限值(100 CFU/m L)。通过计算得出,检测600 m L本实验水样中的细菌菌落总数相当于检测1 000 m L(1 L)100 CFU/m L的自来水。首先将600 m L及低于和高于该体积不同体积梯度的自来水经滤膜过滤收集菌体;然后使用细菌基因组提取试剂盒提取滤膜上的细菌宏基因组DNA,电泳分析提取的宏基因组质量;最后检测各个体积自来水宏基因组DNA浓度,根据检测结果分析自来水中宏基因组DNA含量与细菌菌落总数之间的相关性。提取的自来水宏基因组DNA主条带清晰,可以进行基因组DNA含量测定分析;自来水中细菌宏基因组DNA浓度与细菌菌落总数之间呈正相关的线性关系。建立一种通过检测自来水中细菌宏基因组DNA浓度来反映细菌菌落总数的检测方法,检测灵敏度可达7 CFU/m L,且省时、重复性好。     

济南市护城河代表性区段底泥中细菌菌群分析

对济南市护城河(解放阁)水质及底泥沉积物中细菌菌群进行检测分析。水质理化指标的检测按照国家标准进行;用平板计数法检测河底淤泥中的细菌数量;用MPN法检测肠道菌群及硝化细菌、亚硝化细菌和反硝化细菌的数量;用16S r DNA部分测序技术对可培养细菌进行分类分析;用高通量测序技术(V4区)对细菌菌群的多样性进行分析。水质理化指标的检测结果表明:护城河水质整体良好。基于微生物培养技术的细菌菌群分析结果表明:底泥中存在较低数量的大肠菌群,硝化细菌和亚硝化细菌数量接近,反硝化细菌数量较高。可培养细菌中还存在多种水生细菌和其它土壤细菌,其中芽孢菌是最常见的分离菌。高通量分析结果表明:护城河底泥中的细菌具很高的多样性,如在属的分类水平上有548个单元,在科的分类水平上有392个单元。研究结果表明:高通量测序技术能提供在不同分类水平上菌群多样性的全貌,信息丰富,但难以提供细菌类群的详细信息,如不能得到种的信息,也不能得到大部分属的信息(因为大部分属至今还没有被正式命名)。而传统的培养方法可以简便地分析特定菌群的数量,还能给出像大肠菌群数量、硝化细菌数量、病原菌的种类及数量等重要信息。因此,高通量测序技术和传统细菌培养方法相结合可弥补各自的局限性,为环境样本中微生物多样性分析提供更加全面和详尽的信息。     

生物膜和生物膜形成菌的研究

细菌生物膜是一个复杂的微生物群落,生物膜巾除了水和细菌以外,还含有细菌分泌的胞外聚合物、吸附的营养物质、代谢产物及DNA等细菌裂解产物.介绍细菌生物膜的形成过程,并综述了近年来医学领域以几种成膜力强的条件致病菌为研究对象,从基因水平上证实了细菌细胞表面结构鞭毛、纤毛、胞外聚合物和群体感应信号分子等细胞因子对生物膜形成的影响.     

在细菌上寄生的细菌——介绍一种弧菌(Bdellovibrio)

前言弧菌(Bdellovibrio)是寄生于植物病原细菌或一般土壤细菌体内引起溶菌的细菌。1962年首先在德国发现,被称为吞食细菌的细菌。此后许多国家都进行了分离和研究。明确了这种细菌不仅能在别的细菌上寄生,而且也能在人工培养基上繁殖。在生理、生态、寄主——寄生者间的相互关系等方面进行了广泛的研究。最近还对这种细菌的遗传物质 DNA 作了分析,对它的均一性等作了详细的研究,确定了其分类学位置。     

DNA电脑

科学家研究发现，脱氧核糖核酸（DNA）有一种特性，能够携带生物体各种细胞拥有的大量基因物质。数学家、生物学家、化学主U万计包机专家从中得到启迪，正在合作研制未来的的液体DNA电脑。这种DNA电脑的工作原理是以瞬间发生的化学反应为基础，通过和酶的相互作用，将反应过程进行分子编码，对问题以新的DNA编码形式加以解答。和普通的电脑相比，DNA电脑的优点首先是体积小，但存储的信息量却超过现代世界上所有的电脑。它用于存储信息的空间仅为普通计算机的几兆分之一。其信息可存储在数以兆计的DNA链中。一升的DNA电脑只需几天…     

假单胞菌ND6菌株水杨酸羟化酶基因(nahG)的核苷酸序列分析和酶鉴定

水杨酸羟化酶是细菌萘降解途径中的关键酶，它能催化水杨酸脱羟和羟化，生成儿茶酚．假单胞菌(Pseudomonas)DN6菌株的萘降解基因位于102kb的质粒pND6-1上，以pUC18质粒为载体，制备了含有1～3kb pND6-1 DNA随机片段的基因库，通过DNA测序和DNA序列同源性分析，从基因库中筛选出含有水杨酸羟化酶基因nahG的克隆．nahG基因的大小为1305bp，编码的水杨酸羟化酶(NahG)由434个氨基酸组成，与Pseudomonas putida NCIB 9816-4菌株的水杨酸羟化酶基因相比，核苷酸序列的同源性为100％，与其它10种细菌的水杨酸羟化酶基因相比，核苷酸序列的同源性为32％～99％．酶学实验表明，ND6菌株的水杨酸羟化酶具有广泛的底物特异性，它不仅能代谢水杨酸，还能代谢多种水杨酸的衍生物，如乙酰水杨酸、黄基水杨酸、3-甲基水杨酸、5-甲基水杨酸和5-氯水杨酸等．     

基因计算机研究充满希望

正如人类基因组计划提醒我们的，遗传化学物质DNA(脱氧核糖核酸)具有令人生畏的信息储存能力。我们体内每一个细胞的小小细胞核中包含着构成整个人体的编码指令。计算机科学家现在正设法仿效自然，利用DNA建立一种完整的信息技术形式。神奇DNA计算技术的希望首先依赖于分子个体与硅芯片或其他电子存储器相比远为高效的信息存储能力。原则上，l毫克的DNA可以存储相当于100万张激光唱片的信息。它还能提供终极的关行处理速度，在同一时间进行数万亿次运算。DNA计算技术的研究是6年前才开始的。当时，美国南加州大学的伦纳德·艾德尔曼利…     

一种冰川微生物总DNA的提取方法

利用SDS高盐法对冰川微生物总DNA进行了提取,实验结果表明这种方法对不同区域的冰川都可以提取到长度大于15kb的DNA片段,所得DNA应用细菌16S rRNA基因的引物进行PCR扩增,均能获得目的片段。因此,SDS高盐法是一种高效、简单的从小量冰川样品中直接提取DNA的理想方法。     

苔藓植物总DNA提取方法和条件的研究

通过CTAB法和高盐低pH法对几种苔藓植物组织DNA的提取进行了比较，结果表明高盐低pH法操作简单、快捷，无需DNA的纯化步骤。且提取DNA的含量和纯度都很高，经过紫外吸收法检测，A^260A^280的比值在1．7—2．0之间。同时实验也研究了提取材料、β-巯基乙醇以及处理方法对DNA的影响，结果表明实验材料对DNA的含量和纯度的影响不大，而在提取缓冲液中加入l％β-巯基乙醇可以有效的抑制酚类物质使DNA褐变，在提取过程中增加回收步骤可以提高DNA产量。这些结果为今后进一步开展苔藓植物的分子生物学研究奠定了基础。     

基于AIS信息融合的船载航行数据记录再现

研究VDR与AIS信息融合的信息再现,分析VDR和AIS播发的信息及其系统结构,设计了基于AIS信息融合的船载航行数据记录再现系统,并介绍了系统的构成、技术以及功能.     

天麻DNA分子的克隆与鉴定及其生物信息学分析

运用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术测定天麻DNA指纹图谱,从中选择需要的特异DNA片段．经过DNA回收、克隆与鉴定,获得目的DNA阳性克隆．通过DNA测序和生物信息学分析确定目的DNA的新颖性及其所含的生物信息．应用PCR技术研究了该DNA序列在天麻种群中的分布．结果表明,该DNA序列是新发现的,而且含有丰富的生物学信息,值得进一步研究．本研究成果为天麻基因组DNA的开发与利用提供了科学依据,可应用于天麻种群的遗传分类,对其他经济植物包括药用植物的相关研究具有借鉴意义．     

DNA损伤和修复的生物标记物的探讨

某些物理化学因子，如紫外线，电离辐射和化学诱变剂等，都有引起生物突变和致死的作用。这些物理化学因子均能作用于DNA，造成其结构和功能的破坏。熙而在一定条件下，生物泪L体能使其DNA的损伤得到修复。本文主要介绍几种修复系统和生物标记物。     

基于光学小波系统的DNA序列编码区预测

针对理论预测DNA序列编码区问题，引人信息值对DNA序列进行统计信息编码，把统计信息值输入到光学小波变换系统中，进行光学小波分析，分析结果作为预测DNA序列编码区的主要依据．