白术根茎的总RNA提取方法的比较

探讨提取白术根茎总RNA的最优方案。以新鲜白术的根茎为实验材料,采用三种方法提取其根茎总RNA。用紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳检测RNA样品完整性,用RT-PCR方法验证RNA质量。用多糖多酚植物总RNA提取试剂盒的方法,获得了完整性最好、质量最高的总RNA样品。提取白术根茎总RNA的三种方法中,多糖多酚植物总RNA提取试剂盒的方法最理想。     

白芥叶片总RNA提取方法的比较研究

以白芥为材料,分别采用柱式植物总RNA抽提纯化试剂盒法、RNAisoPlus法和CTAB-异丙醇法3种方法提取白芥叶片总RNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计及RT-PCR反应进行检测,最后对3种方法得到的结果进行分析比较．结果表明,RNAisoPlus法提取出的总RNA条带与其他方法相比更为清晰,A260／A280比值介于1．9～2．1之间,该方法更适合用于白芥叶片总RNA的提取．     

香蕉不同组织中总RNA提取方法的研究

针对香蕉组织中多糖、多酚等次生物质含量高的特点，以香蕉根、茎、叶、果实为试材，对其总RNA提取进行研究．比较了SDS法、改良SDS法、改良CTAB法和Trizol试剂盒法提取总RNA的效果，结果分析表明：改良SDS法能从香蕉根、茎、叶中获得质量高、完整性较好的总RNA，而改良CTAB法对果实的提取效果较佳，所得A260／A280均高于1．8，A260／A230大于2，0，28 S rRNA带的亮度约是18 S rRNA的2倍．其产率在根、茎、叶中均在400μg·g^-1以上，果实中可达49．34μg·g-^1.以上2种方法所得的总RNA均能满足RTPCR、Northern blot和cDNA文库建立等分子生物学研究，且具有快速、简便易行、成本较低的特点，适合于富含多糖、多酚的植物材料．     

一种快速检测植物病毒RNA蓄积量的竞争PCR方法

用Oligo6.6软件在pUC18上设计1对比目的基因多100～200 bp的内参引物,摸索了目的基因和内参共同扩增的竞争PCR反应条件,测定了嘧肽霉素处理对烟草组织中烟草花叶病毒RNA相对含量的影响,同时用间接ELISA方法验证了该方法.试验结果表明:竞争PCR的方法能够快速、相对准确的测定植物组织中病毒RNA蓄积量的变化情况.     

两种球形棕囊藻细胞总RNA提取方法的比较

不同植物细胞RNA提取的适宜方法各不相同.本实验分析、比较了QIAGEN试剂盒法和西曲溴铵(CTAB)法用于赤潮藻细胞总RNA提取的情况.结果显示,两种方法均可获得高质量的总RNA.比较而言,CTAB法比QIAGEN试剂盒更可取,适合藻细胞RNA的大量提取.     

植物抗病毒基因工程的研究进展

本文对近年来植物抗病毒基因工程的发展作一简介,介绍了利用病毒外壳蛋白基因,病毒卫星RNA,弱病毒全长cDNA,反义RNA,核酶,抗体基因和干扰素基因,毒蛋白基因,病毒上基他基因以及植物上抗性基因等方法．     

植物AGO蛋白的结构预测分析

AGO蛋白家族(Argonaute protein family)是RNA诱导沉默复合物(RISC)的功能核心,参与小RNA介导的基因沉默.AGO蛋白由N末端、PAZ、MID和PIWI四个结构域组成.它和小RNA在植物中共同参与维持基因组的稳定、调控组织发育、DNA修复、对逆境的适应性应答以及在RNA层面对入侵核酸(转基因和植物病毒)的免疫.植物AGO蛋白在胚胎发育,细胞分化和转座子的沉默中具有重要作用.本文运用生物信息学的方法,结合生物信息学两大门户网站,对植物AGO蛋白的分类、平均疏水性、净电荷、不稳定系数等进行预测.     

植物病毒编码的RNA沉默抑制因子

RNA沉默广泛存在于真核生物中,是一种发生于RNA水平的基因表达调节机制。寄主植物利用RNA沉默防御病毒的入侵,而病毒编码抑制因子以抵御这种防卫反应,从而达到在植物体内扩增、形成侵染的目的。近几年越来越多的沉默抑制因子被鉴定出来。本文就已鉴定出的沉默抑制因子的特点进行了系统介绍。     

植物病毒RNA提取方法的研究

病毒RNA提取技术是分子生物学中经常应用的重要技术,是对RNA病毒在分子水平进行研究的必要手段.介绍了一种从染病植物组织中提取病毒RNA的方法,利用此方法提取了马铃薯x病毒(PVX)的RNA基因组,并通过RT-PCR得到其外壳蛋白基因,提取的病毒RNA在纯度和产量上都可满足反转录和PCR扩增等基本分子生物学操作.     

RNAi在植物中的作用机理及其应用研究进展

本文综述了近年来有关RNA干扰的发现、作用过程及其作用机理,并介绍了RNA干扰在植物基因功能、植物抗病毒、作物品种改良等方面的应用.     

汽轮机小容积流量变工况近似估算

本文针对汽轮机末几级在小容积流量工况下产生脱流的特点，结合工程实例推导出一种简单近似的变工况核算方法。经实测数据初步验证，计算精度可满足工程实用要求，具有一定推广价值。     

A Novel Structural Measure Separating Non-Coding RNAs from Genomic Backgrounds

RNA secondary structure has become the most exploitable feature for ab initio detection of non-coding RNA(nc RNA) genes from genome sequences. Previous work has used Minimum Free Energy(MFE) based methods developed to identify nc RNAs by measuring sequence fold stability and certainty. However, these methods yielded variable performances across different nc RNA species. Designing novel reliable structural measures will help to develop effective nc RNA gene finding tools. This paper introduces a new RNA structural measure based on a novel RNA secondary structure ensemble constrained by characteristics of native RNA tertiary structures. The new method makes it possible to achieve a performance leap from the previous structure-based methods. Test results on standard nc RNA datasets(benchmarks) demonstrate that this method can effectively separate most nc RNAs families from genome backgrounds.     

Analysis of Pyrolysates for Polysulphoneamide Fiber by Py-GC/MS

Pyrolysis of polysulphoneamide fiber has been investigated using pyrolysis gas chromatography-mass spectroscopy at the different temperatures from 420℃ to 750℃. Its compositions of pyrolysates have been analyzed. At 420℃,pyrolysis of molecular chain could not completdy take place, 12 compounds of pyrolysis have only been identified. When the temperature increases, the compositions of pyrolysate increase sharply. Several compounds, especially sulfur dioxide, benzene, aniline, benzoic acid, 1,4-benzene dicaronitrile, N-phenyl-acetamide, diphenylamine, benzc[g] isoquinoline, N-phenyl-benzamide, hi-（ 4-cyanophenyl ）benzamide, could be formed. The degradation mechanisms which are determined by structure and amount of the thermal decomposition products are described. During pyrolysis, for polysulphoneamide, polymeric chain scissions take place as a successive removal of the monomer units from the polymeric chain. The chain scissions are followed by secondary reactions, which lead to a variety of compounds. Additional reactions can also take place during pyrolysis.     

2酰胺基树脂的合成及其对茶多酚的吸附热力学

用大孔交联氯甲基化聚苯乙烯分别与己内酰胺和尿素发生功能基化反应,合成大孔交联聚（N-对乙烯基苄基己内酰胺）和大孔交联聚（N-对乙烯基苄基脲）2种树脂.通过静态吸附试验,测定了这2种酰胺基树脂对水溶液中茶多酚的吸附等温线,发现所有的吸附等温线都符合Freundlich吸附等温方程.结果表明：聚（N-对乙烯基苄基脲）对水溶液中茶多酚的吸附亲和性相对聚（N-对乙烯基苄基己内酰胺）更大.根据热力学函数关系计算等量吸附焓、Gibbs吸附自由能和吸附熵,表明2种酰胺基树脂对水溶液中茶多酚的吸附均为吸热、熵增的物理吸附过程;同时,聚（N-对乙烯基苄基脲）对水溶液中茶多酚的吸附相对聚（N-对乙烯基苄基己内酰胺）有更低的吸附自由能变,较高的吸附焓变和熵变.     

水稻颖果总RNA提取方法的研究

利用TRIZOL试剂快速提取法、异硫氰酸胍法和改良的SDS法提取不同发育时期水稻颖果的总RNA,并通过凝胶电泳、紫外分光光度法检测提取获得的RNA样品的品质.研究结果表明,改良的SDS法提取的RNA具有28SrRNA和18S rRNA 2条清晰的条带,且无降解.其D260/D280为1.84～1.97,具有较高的纯度.其他2种方法获得的RNA品质较差,有降解和弥散现象.将改良的SDS法提取的RNA逆转录成cDNA,作为PCR扩增的模板,可获得清晰的约1.7kb的目的条带.该法提取的RNA用于Northern杂交,可产生特异的杂交信号.这些结果进一步证明了改良的SDS法提取的RNA具有很高的品质与纯度,可以满足下一步分子生物学研究的需要.     

4种提取水稻基因级DNA方法的比较

对于含有大量硅质及多糖如酚、酯、萜等其它次生代谢产物的水稻,要从其组织中提取高质量的基因组DNA,一般比较困难,作者以水稻叶片为材料,分别采取了简易提取法,CTAB法,QIAGEN公司Dneasy Plant Mini Kits法,Shanghai Sangon公司Genomic DNA Isolation Kits法4种方法提取水稻基因组DNA;并通过质量分数为0．8％琼脂糖凝胶电泳和PCR扩增的方法所提取的DNA样品进行检测,将它们在DNA的产量、质量和耗费等方面进行简要比较,并根据分子生物学研究工作的实际特点,确定了CTAB沉淀法为最佳方法。     

基于改进适应度函数的RNA结构预测

RNA二级结构预测是生物信息学的重要研究内容。本文提出了一个新的启发式算法进行带假节的RNA结构预测。本文首先通过对RNA序列的若干特征和RNA二级结构进行相关性分析,从中选择跟RNA结构有较大相关性的特征,然后依据遗传算法、综合自由能、被选择茎区的条数以及被选择茎区的平均长度等特征来构造打分函数预测RNA的结构。本文对该方法进行了测试,结果表明本文所采用的从特征分析中得出的打分函数以及通过启发式算法来叠加茎的方法是有效的,在对tRNA以及5SrRNA等序列的预测上相比单纯的自由能最小方法有更高的准确性。并且该方法进一步推广到预测含假结的RNA的二级结构时也有较好的结果。     

基于云理论的数据预处理方法

讨论了数据预处理的基本方法，运用这些方法处理了昆明市部分排水管线的GIS数据和管线疏通记录数据，用基于云理论的数据泛化方法对数据库中相关属性进行量到概念的泛化处理．生成目标数据表，从而有效地提高了挖掘效率，并确保了结果更接近自然语言的概念。     

两种火炭母基因组 DNA 提取方法的对比研究

火炭母富含有多酚、多糖等次生代谢产物．这些次生代谢产物对火炭母基因组DNA提取的质量与产量有较大影响．以火炭母的成熟叶片,幼嫩叶片、幼嫩茎尖为实验材料,采用改良SDS法和CTAB法,对火炭母进行基因组DNA提取,并通过琼脂糖凝胶电泳检测其完整性,紫外分光光度计法测定其浓度和纯度,对提取效果进行比较．以期得到提取火炭母基因组DNA的最佳方法．     

沙葱总RNA的提取与质量分析

以沙葱种子和沙葱幼叶为材料,分别用RNAiso Plus试剂法、RNAiso Plus醋酸钠改进法、CTAB-异丙醇法、CTAB-LiCl法4种不同的方法提取沙葱总RNA,经琼脂糖凝胶电泳,采用紫外分光光度法测定总RNA纯度并进行RT-PCR检测.结果表明,沙葱不同组织总RNA提取的最优方法有所不同.采用CTAB-LiCl法能有效地提取出沙葱种子高质量、完整性好而且无胶状不溶物的RNA,没有明显的蛋白和基因组DNA的污染.采用RNAiso Plus醋酸钠改进法能有效地去除沙葱幼叶中多糖的干扰,所提取的RNA条带清晰,完整性好,是沙葱幼叶总RNA提取的有效方法.