铁皮石斛试管苗的RAPD分析及其特异性鉴定引物设计

为了能方便快捷地鉴别出铁皮石斛试管苗和铁皮石斛,采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对铁皮石斛试管苗及石斛属23个种进行了基因组DNA多态性分析,从中找出铁皮石斛试管苗特征性条带进行克隆和测序,并根据测序结果设计了特异性引物.采用此特异性引物对铁皮石斛试管苗及石斛属其他一些种进行扩增,结果表明,铁皮石斛试管苗与各地产野生铁皮石斛出现同一特征条带,而石斛属其他种未出现该条带.     

晋产北柴胡试管植株的RAPD分析

以植物组织培养技术建立的9种晋产北柴胡(Bupleurum chinense DC.)试管植株为材料,用CTAB法提取北柴胡试管植株叶片的总DNA,以随机引物进行非特异性扩增,计算了遗传相似系数与遗传距离,并进行了聚类分析.从20条随机引物中挑选出3条扩增条带清晰、重复性好的引物OPC-8、OPD-8和OPE-10,共检测出22条DNA谱带,其中多态性条带18条(占82%).结果表明,9种北柴胡试管植株间均存在不同的遗传差异,根据绘制的聚类图可将9种不同类型的北柴胡聚类为4组.说明RAPD多态性分析从分子水平上一定程度反映出不同类型晋产北柴胡之间的遗传多态性.     

草鱼基因组随机扩增多态性引物及多态性位点的筛选

为了建立草鱼基因组DNA多态性分析的指标体系,应用RAPD技术,从180条10碱基随机引物中筛选出了31条能扩增出多态性DNA片段的引物。用这31条多态性引物共扩增出了327条重复性好、带型清晰、分辨率高的谱带。扩增产物的片段大小范围在400—2000bp之间。单一引物扩增条带为5—14条。用这些多态性引物在草鱼基因组DNA中检测到了93个多态性位点,并对这些多态性位点上的等位基因频率进行了统计分析。这31条多态性引物和所检测到的93个多态性位点初步为草鱼基因组的多态性分析提供了可靠的分析指标体系。     

河南产香茶菜属6种植物的RAPD分析

从70个随机引物中筛选出10个具有较高多态性检测能力的引物,用于RA PD扩增,共扩增出85个条带,其中多态性条带59条,占68.81%.对得出的结果用SPSS12.0进行聚类分析,结果表明:河南产香茶菜不同种、同一种的栽培和野生之间存在明显的遗传分化,其中种间的差异要大于种内.从DNA分子水平上探讨了香茶菜属6种植物之间的遗传关系,为中药材冬凌草的品种鉴别提供依据.     

辣木植物ISSR分子标记的初步研究

对从7个不同地方采集的7份辣木(Moringa)材料进行了ISSR 标记分析.结果表明,被测材料间ISSR标记多态性较高.从18个ISSR 引物中筛选出6个可扩增出清晰的且具多态性的条带的引物,共扩增出75条带,其中59条具有多态性, 占总扩增带数的78.67 %,其中每个引物可扩增出4～14条多态性带,平均10.17条.ISSR 标记遗传相似性系数(GS) 变异范围为0.557 0～0.836 7,平均值为0.687 6±0.080 9.聚类分析表明,7份辣木材料可以聚为四类,其中MS2为单独一类.ISSR 标记可以有效地评价辣木植物遗传分化并为辣木种类的鉴别提供一定的理论依据.     

利用RAPD标记技术对刺槐属（Robinia）种间亲缘关系的分析

用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对刺槐属(Robina)内5种植物进行基因组DNA多态性分析.共选用22个10 bp随机引物扩增出212个DNA片段,进行种间遗传关系分析.片段大小在100～2 200 bp之间,其中多态性谱带为183条,多态率为86.3%;利用UPGMA进行遗传距离计算的结果表明,刺槐、毛刺槐和香花槐分属刺槐属的三个种,红花刺槐和龙槐是刺槐的变型.首次在DNA水平上证明香花槐为刺槐属的一个独立种,且与毛刺槐的亲缘关系较近.为刺槐属植物亲缘关系和系统分类建立了新的分子学证据.     

十一种重楼属植物的RAPD分析

作者利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术，对重楼属植物11个种的遗传多样性进行了分析．12个引物共扩增出86条带，其中有82条(95．3％)表现出多态性，说明重楼属植物有很高的遗传多样性．用UPGMA法则构建分子系统树，并把11个种划分为6组．     

杜氏藻种间关系RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对7株杜氏藻,即：D.salina、D.bardawil、D.minuta、D.bioculata、D.parva、D.peircei和D.primolecta进行了遗传多态性分析。用30个10聚随机引物进行多态性扩增和筛选,其中23个引物（76.67%)可获得清晰的多态性条带。选择其中能够得到清晰、重复性良好的18个引物共扩增产生150条可区分的DNA条带。根据种间Nei遗传相似系数计算分析,构建杜氏藻属部分种的聚类分析图。分析结果表明：D.salina、D.bardawil和D.minuta聚为一类,D.bioculata、D.parva、D.peircei和D.primolecta聚为另一类。由于两类之间存在较远的亲缘关系,把这两类杜氏藻称为两个种可能更合适。     

东方百合杂交系部分栽培品种的遗传多样性分析

利用125条多态性随机引物对市场上具有代表性的10个东方百合杂交系栽培品种的遗传多样性进行了分析.结果表明：在125条引物中，30条引物能够扩增出多态性片段，引物多态性比例为24%.引物扩增片段数目从3到13条，其中S223可以完全区分10个供试品种.UPGMA法聚类结果表明，10个供试品种之间遗传距离为0.0930～05349，10个供试品种在相似系数0.57处可以分为3类，品种之间遗传变异比较丰富.其中Bernini和Tiber的遗传距离是0.0930，推测两者杂交亲本十分相近；而Aktiva与其它     

金佛山特有杜鹃花遗传多样性分析

利用ISSR分子标记初步分析了重庆金佛山特有的4种杜鹃花的亲缘关系,从100个引物中筛选出13个能扩增出清晰条带并具有多态性的引物.共扩增出了239条DNA片段,分子量约为200~1500bp.其中多态性片段约为171条,平均每条引物扩增出18.38条DNA片段.同时采用DPS软件计算出4种杜鹃花的Nei’S遗传距离,并用NTSYSpc2.1中的UPGMA法构建了系统树.结果表明4种杜鹃花之间既有相同的遗传背景,又存在一定的差异.4种杜鹃花明显分为两类:树枫杜鹃为一类,疏花美容杜鹃,金佛山美容杜鹃与阔柄杜鹃为一类.     

鳙鱼人工繁殖群体遗传多样性的研究

运用40个随机引物对湖北荆州和广西昭平的两个鳙鱼（Aristchthys nobilis)人工繁殖群体进行了随机扩增多态DNA（RAPD）分析。结果表明，两个鳙鱼人工繁殖群体内个体间的遗传相似度分别为0．9755和0．9797，Shanonn表型多样性指数分别为5．541和4．954；以所得RAPD数据分析为基础，对鳙鱼人工繁殖群体的遗传多样性进行了分析，对鳙鱼人工繁殖过程中的一些问题进行了讨论。     

苔藓植物RAPD应体系的建立及遗传多样性分析

以多枝青藓为材料优化RAPD反应条件,在此基础上对11种苔藓植物进行遗传多样性分析.结果表明:苔藓植物RAPD反应(25μl体系)的最佳条件为,Taq酶,1.0U;Mg2+浓度,2.0 mmol/L;dNTP浓度,0.2 mmol/L;模板DNA,60 ng;引物浓度,10 pmol.用40条引物进行扩增筛选,有6条引物扩增条带清晰,重复性好,共扩增出77条带.通过SPSS11.5分析软件对扩增结果进行聚类分析,结果与形态学分类基本一致,说明RAPD技术可用于苔藓植物的遗传多样性研究.     

金华地区野生大豆小种群的分子生态学研究

为了阐明小地区范围内野生大豆种群的遗传分化情况,应用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）方法,对浙江金华地区５个一年生野生大豆种群,进行了分子生态学研究。用根据ＲＡＰＤ数据计算得 Ｓｈａｎｎｏｎ指数估计了５个野生大豆种群的遗传多样性。发现大部分的遗传变异存在于野生大豆种群间,只有少部分的遗传变异存在于种群内。     

杉木DNA提取方法的研究

在杉木新鲜针叶和干叶ＤＮＡ提取过程中，应用ｐＨ值较低，无机盐浓度较高的提取缓冲液可沉淀蛋白质，其中加入２％的β－羟基乙醇可有效地防止酚类物质使变色，提出２出的ＤＮＡ样品产率在６０～２００ｎｍ／ｍｇ．ＦＷ，ＤＡＮ质量和纯度较高，２６０ｎｍ／２８０ｎｍ光密度比值在１．８～１．９，所得ＤＮＡ可直接用于限制性内切酶酶切，并可用于随机引物ＰＣＲ扩增，该方法为杉木分子生物学研究提供基础。     

濒危植物连香树遗传多样性研究

以我国特有的濒危被子植物连香树为材料,采用RAPD标记对分布于浙江、安徽、湖南、湖北、四川、陕西、河南的11 个天然居群进行了检测。以20个引物共扩增出691条DNA片段,其中多态性条带328条,占总条带数的475 %。AMOVA分析表明,连香树的基因分化系数为0479 7,居群内变异占总变异的5203 %。由Nei基因分化系数估计的基因流仅为0542 4,表明居群间基因交流困难。UPGMA聚类分析表明,安徽歙县居群与河南济源居群的关系最远。遗传漂变等因素可能是连香树目前遗传结构的主要成因。保护现有生境、通过培育实生苗并扩大繁殖栽培的范围是目前对连香树比较好的保护措施。     

利用RAPD技术研究方形臂尾轮虫(Brachionus quadridentatus)种群遗传结构

尝试利用RAPD技术对武汉东湖水果湖区和郭郑湖区中的方形臂尾轮虫的DNA进行种群遗传结构分析,结果显示其群体内遗传多样性所占的比例要远远高于群体间遗传多样性所占的比例,2个湖区之间形成了由遗传分化较大的基因型个体组成的随机分布的种群遗传结构.     

丁鱼岁遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析

利用RAPD分子标记技术对15个丁鱼岁养殖个体的遗传多样性进行分析.选用20个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增,有16个引物可以扩增出稳定且清晰的条带,其中S103、S104和S105为多态引物.16个引物共扩增出65个DNA位点,片段大小在200~3 000 bp之间,其中多态性位点6个,多态位点比例为9.23%.个体间遗传距离在0~0.067 4之间,平均遗传距离为0.028 6.结果显示,丁鱼岁养殖群体的遗传多样性水平较低.     

引物对甘薯品种聚类分析结果的影响

应用RAPD技术对10个供试甘薯品种的遗传关系进行了研究，探讨引物数量，多态性率和所用引物带型丰富度对聚类分析结果的影响。结果表明：聚类分析准确度与引物数量，引物的带型数有关，多态性率不是选用引物的主要标志。因此，在利用RAPD技术研究物种间遗传关系时，有必要保证一定数量的引物，且此物具有较多的带型。     

Influence of long-period pesticide force on genetic polymorphism of wolf spider Pardosa pseudoannulata (Lycosidae: Araneae)

Wolf spiders are predators in large quantities in the fields. How wolf spiders keep their dominant species status under long-period pesticide force? To answer this question, eight geographical populations of Pardosa pseudoannulata were used as materials to test the influence of geographical habitats on their genomic DNA polymorphism. The RAPD pattern showed polymorphic variations among and within different populations. Total 84 bands amplified by 10 random primers, of which 62 (73.81%) are polymorphic, were generated from 55 individuals of eight geographical populations. Meanwhile, Shannon’s index (Ho= 0.5177) showed a rich genetic diversity of P. pseudoannulata, and most of the genetic variation (64.24%) was found within populations. Multiple regression analysis suggested that it is the climatic variation (such as annual average temperature etc.) that results in adaptive eco-geographic differentiation, and it is the long-period pesticide force that speeds up the genetic differentiation of P. pseudoannulata which changed the genetic diversity of the population.     

几种中国栽培灵芝品种的RAPD及rDNA分子标记鉴定

以常见几种中国栽培灵芝菌株为研究材料,运用RAPD、18SrDNA和ITS 3种分子标记来分析各灵芝菌株之间的亲缘关系,同时比较3种分析结果,探索适于灵芝属研究的技术方法。RAPD分析结果表明,6种菌株在相似性系数为0.584的水平上聚为3类:Ganodermaluidun、GanodermaluidumHG、Ganodermasinenses和Ganodermaatrum为一类;Xuezhi和Coriolusversicolor各单归为一类。ITS分析结果显示,灵芝菌株间相似性较低(43.8%～88.0%),其中Ganodermasinenses和Xuezhi的相似性为43.8%,在较低相似性水平上,Ganodermaluidun和Ganodermasinenses归为一类,Coriolusversicolor和Xuezhi各单归为一类,这与RAPD分析结果一致,也与传统分类结果基本一致。18SrDNA分子标记显示的结果与前两种分析结果有很大差异,说明18SrDNA分子标记并不适合灵芝属的分类研究。