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Bacillus sp.XJ1-05菌株GbsA基因的克隆及其生物信息学分析
引用本文:赵建朋,顾立军,胡文革,康壮丽,郝凤霞.Bacillus sp.XJ1-05菌株GbsA基因的克隆及其生物信息学分析[J].石河子大学学报,2008,26(2):220-223.
作者姓名:赵建朋  顾立军  胡文革  康壮丽  郝凤霞
作者单位:石河子大学生命科学学院,新疆石河子832003
摘    要:根据地衣芽孢杆菌Bacillus licheniformis ATCC 14580的GbsA基因(GeneID:3027576)的核甘酸序列设计1对特异性引物.通过PCR的方法扩增由本实验室分离的中度嗜盐菌Bacillus sp.XJ1-05的GbsA基因,经T/A克隆,插入到pBS-T载体上进行序列测序,结果表明得到的GbsA基因的开放阅读框(ORF)全长为1473bp.在Genbank数据库中进行同源性检索,结果表明:其与Bacillus licheniformis ATCC 14580的GbsA基因的氨基酸序列同源性高达97%.生物信息学分析表明:该GbsA基因编码蛋白无信号肽,无跨膜区域,高亲水性,有2个醛脱氢酶作用位点.

关 键 词:中度嗜盐菌  甜菜碱醛脱氢酶基因  克隆  生物信息学分析  Bacillus  sp  菌株  基因  克隆  生物信息学分析  Bacterium  Analysis  Bioinformatics  作用位点  醛脱氢酶  亲水性  区域  跨膜  信号肽  编码蛋白  分析表  序列同源性  氨基酸  同源性检索  数据库

Cloning and Bioinformatics Analysis of GbsA of A Moderate Halophilic Bacterium Bacillus sp.XJ1-05
ZHAO Jian-peng,GU Li-jun,HU Wen-ge,KANG Zhang-li,HAO Feng-xia.Cloning and Bioinformatics Analysis of GbsA of A Moderate Halophilic Bacterium Bacillus sp.XJ1-05[J].Journal of Shihezi University(Natural Science),2008,26(2):220-223.
Authors:ZHAO Jian-peng  GU Li-jun  HU Wen-ge  KANG Zhang-li  HAO Feng-xia
Abstract:
Keywords:
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