| 木糖还原酶定点突变设计的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杜红丽,王靖方,曾琦锴,凌飞,魏冬青,林影,王小宁.木糖还原酶定点突变设计的生物信息学分析[J].华南理工大学学报(自然科学版),2008,36(12). |
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| 作者姓名： | 杜红丽 王靖方 曾琦锴 凌飞 魏冬青 林影 王小宁 |
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| 作者单位： | 1. 华南理工大学,生物科学与工程学院,广东广州,510006
2. 上海交通大学生命科学与工程学院,上海,200240 |
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| 摘 要： | 木糖代谢过程中,木糖还原酶（XR）和木糖醇脱氢酶（XDH）的氧化还原不平衡是利用纤维素生成酒精的关键问题之一.文中借助生物信息学手段（同源建模、酶和辅酶分子对接）,通过分析数据库资源,找到了一些影响XR活性或辅酶依赖性的关键氨基酸.结果表明：树干毕赤氏酵母XR与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸（NADP）之间形成氢键的氨基酸有Lys21、Val222、Glu223、Phe236和Thr273,与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）之间形成氢键的氨基酸有Val222、Glu223、Phe236、Glu237和Thr273;突变Lys21（完全保守）使树干毕赤氏酵母XR只与辅酶NAD结合,突变Glu237（不完全保守）使树干毕赤氏酵母XR只与辅酶NADP结合;热带假丝酵母XR与NADP之间形成氢键的氨基酸有Asn278和Arg282（两者都不完全保守）,要改变其NADP依赖性,可以替代Asn278和/或Arg282.
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| 关 键 词： | 木糖还原酶 定点突变 同源建模 分子对接 辅酶 生物信息学 |
Bioinformatic Analysis of Xylose Reductase for Site-Directed Mutagenesis |
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| Du Hong-li,Wang Jing-fang,Zeng Qi-kai,Ling Fei,Wei Dong-qing,Lin Ying,Wang Xiao-ning.Bioinformatic Analysis of Xylose Reductase for Site-Directed Mutagenesis[J].Journal of South China University of Technology(Natural Science Edition),2008,36(12). |
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| Authors: | Du Hong-li Wang Jing-fang Zeng Qi-kai Ling Fei Wei Dong-qing Lin Ying Wang Xiao-ning |
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