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抗HIF-1αmRNA锤头状核酶的计算机设计
引用本文:岳军,金玉.抗HIF-1αmRNA锤头状核酶的计算机设计[J].实验室科学,2007(6):96-98.
作者姓名:岳军  金玉
作者单位:徐州医学院生物化学与分子生物学研究中心、附属医院检验科,江苏徐州,221002
摘    要:设计一个抗缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)mRNA的锤头状核酶为构建它的基因表达载体选择靶点,以便用于肿瘤的基因治疗。从GenBank寻找缺氧诱导因子-1αmRNA的全序列,用RNA结构分析软件预测HIF—1αmRNA的二级结构并选择合适的核酶作用靶点,从而设计相应的锤头状核酶。HIF-1αmRNA的577位含有GUC三联体,可以作为核酶的切割靶点,设计的核酶包括22nt的催化活性中心和16nt的侧翼序列。计算机辅助预测证明此位点为合适的靶点,用Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)筛选以确定的靶点序列的唯一性。成功设计抗HIF—1αmRNA锤头状核酶基因表达载体,为进一步运用核酶切割HIF—1αmRNA基因来抑制肿瘤生长铺平了道路。

关 键 词:锤头状核酶  缺氧诱导因子-1α  基因治疗
收稿时间:2007-05-24
修稿时间:2007年5月24日

Computerized Design of a Hammerhead Ribozyme Targeting HIF - 1 αmRNA
YUE Jun.Computerized Design of a Hammerhead Ribozyme Targeting HIF - 1 αmRNA[J].Laboratory Science,2007(6):96-98.
Authors:YUE Jun
Abstract:
Keywords:
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