| 一种基于三维原子场相互作用矢量的新型氨基酸结构信息描述子 |
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| 引用本文： | 周鹏,周原,吴世容,李波,田菲菲,李志良.一种基于三维原子场相互作用矢量的新型氨基酸结构信息描述子[J].科学通报,2006,51(1):34-39. |
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| 作者姓名： | 周鹏 周原 吴世容 李波 田菲菲 李志良 |
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| 作者单位： | 重庆大学化学化工学院,重庆400044;生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆400044;生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆400044;重庆大学生物工程学院,重庆400044 |
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| 基金项目： | 谨以此文献给恩师黄里河和张秀英老师七十寿辰.李真、李晟和、李声时、黄莺、杨善彬、梅虎、梁桂兆等提供协助.本工作为霍英东基金（批准号：98-7-6）、国家“春晖计划”教育部启动基金（批准号：99-4-4＋37）、重庆应用基础研究基金（批准号：01-3-6）及重庆大学创新基金（批准号：03-5-6＋04-10-10）资助项目. |
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| 摘 要： | 从分子的三维空间结构出发, 按照不同类型原子之间静电和立体作用得到一种新的分子结构表达方法——三维原子场相互作用矢量(3D-VAIF). 利用该矢量对20种天然氨基酸空间结构性质进行计算, 通过主成分分析获得单个氨基酸的特征描述子——氨基酸结构信息得分(SSIA). 分别使用58个血管紧张素转化酶抑制剂、48个苦味二肽以及31个缓激肽对SSIA的性能进行了测试, 所得模型的复相关系数R2cum和交互检验复相关系数Q2LOO分别为0.789, 0.773; 0.856, 0.837和0.838, 0.815. 结果表明将SSIA用于肽类似物定量序列活性建模(定量序效建模, QSAM)效果优于传统氨基酸描述子.
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| 关 键 词： | 三维原子场相互作用矢量 氨基酸结构信息得分 定量构效关系 定量序效建模 量子化学计算 |
| 收稿时间： | 2005-04-09 |
| 修稿时间： | 2005-04-092005-07-02 |
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