| 菜豆根瘤菌CFN42全基因组非经典分泌蛋白的预测与分析 |
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| 引用本文： | 张武,潘伟,马金田,郭涛.菜豆根瘤菌CFN42全基因组非经典分泌蛋白的预测与分析[J].大理学院学报,2015(6). |
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| 作者姓名： | 张武 潘伟 马金田 郭涛 |
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| 作者单位： | 大理学院农学与生物科学学院,云南大理,671003 |
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| 基金项目： | 大理学院青年教师科研基金资助项目(KYQN201217)；云南省高校滇西生物多样性科技创新团队基金资助项目(云教函〔2011〕93号)；大理学院质量工程项目 |
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| 摘 要： | 为了深入了解生物固氮的分子机理，利用SecretomeP2.0和SignalP4.1对菜豆根瘤菌CFN42全基因组进行预测，结果发现，在5963个蛋白质中，非经典分泌蛋白596个，约占总数的10%，主要涉及底物转运，毒力侵染，物质代谢等方面。在有功能描述的215个分泌蛋白中，识别了I、III、IV型分泌系统，这些蛋白质在侵染和根瘤发育方面发挥了重要作用；在381个假定蛋白中，通过结构域分析，发现了Tad、Cupin、OmPA和CsbD结构域，含有这些结构域的非经典分泌蛋白可能参与了根瘤菌的宿主专一性。在豆科植物-根瘤菌固氮体系中，非经典分泌蛋白发挥了重要作用。
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| 关 键 词： | 菜豆根瘤菌 全基因组 非经典分泌蛋白 生物信息学 |
Genome-wide Prediction and Analysis of the Non-classical Secreted Proteins of Rhizobium etli CFN42 |
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| Zhang Wu,Pan Wei,Ma Jintian,Guo Tao.Genome-wide Prediction and Analysis of the Non-classical Secreted Proteins of Rhizobium etli CFN42[J].Journal of Dali University,2015(6). |
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| Authors: | Zhang Wu Pan Wei Ma Jintian Guo Tao |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Rhizobium etli genome-wide non-classical secreted protein bioinformatics |
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