‘鸭梨’及其自交亲和性芽变‘金坠梨’花粉ABC转运蛋白家族分析

自交亲和性的‘金坠梨’是由自交不亲和性的‘鸭梨’芽变而来,为探究‘金坠梨’突变机理,综合分析了二者花粉蛋白质组差异表达蛋白质。在489个差异表达蛋白质中,发现了参与自交不亲和识别机制的ABC转运家族蛋白;KEGG富集分析发现,ABC转运蛋白被显著富集,其中PyABCB9-1,PyABCB9-2,PyABCC2,PyABCC3,PyABCD1,PyABCG31等6个蛋白显著下调;生物信息学分析表明,6个ABC转运蛋白不同家族在物种间具有很高的保守性;这6个显著下调蛋白可能影响了‘金坠梨’花柱S-RNase进入‘自己’花粉管的运输过程而导致其亲和性突变。     

山楂Actin基因片段克隆及序列分析

依据GenBank中已知的蔷薇科梨属Actin基因的保守序列设计1对特异性引物,以山楂叶片总DNA和总RNA为模板,分别利用PCR和RT-PCR技术从山楂中克隆得到Actin基因的DNA片段和cDNA片段,测序得到山楂Actin基因DNA片段长度为1 578 bp,cDNA片段长度为1 005 bp,编码334个氨基酸。生物信息学软件分析表明,该核苷酸序列与苹果、梨、桃的Actin基因同源性较高,分别为98%,97%,95%,而编码的氨基酸序列与苹果、梨、桃则完全相同,属间具有很好的保守性。试验克隆得到的基因为山楂Actin基因,命名为CpActin。进化树分析结果进一步表明,该Actin序列与苹果、梨、桃和草莓等亲缘关系最近;半定量RT-PCR结果显示,CpActin在山楂的叶片、花柱和花粉中能够稳定表达,可作为山楂的内参基因。