一种蛋白质三维结构中残基重心的计算方法

基于蛋白质三维结构数据PDB,给出一种蛋白质残基重心的计算方法,同时阐述该方法的python语言的实现过程.该方法不需要知道残基侧链原子的坐标,只需知道主链上原子的坐标即可计算蛋白质残基间的距离.     

广西发展有机农业的优势和存在问题分析

介绍国内外有机农业的发展概况,分析广西发展机农业的优势及存在的问题。认为广西发展有机农业具有自然条件优越,区位良好,技术雄厚,名、特、优产品转换容易等优势,但是却面临着宣传力度不够,认识不足;生产规模小,品种单一;实施费用高,投资风险大;生产者科技素质低,科学技术到位率低;认证费用高,有机产品的质优价未优等问题。建议采取加大宣传力度,提高人们的认识水平;用政策扶持,科学规范的经营方式,加强信息服务,进行有机农业的相关研究与技术开发等措施来发展广西的有机农业。     

Red重组系统介导下大肠杆菌改造体系的优化

对Red重组系统介导下大肠杆菌进行遗传改造的转化条件、诱导条件、复苏条件三方面实验参数进行优化研究。结果表明:电转化加入的DNA为20ng,Red重组系统感受态细胞培养浓度为OD600=0.60,所需的电击感受态细胞数为3×108;对大肠杆菌基因做双敲除时,突变第2个基因的阿拉伯糖诱导最适时间比突变首个基因延长,诱导浓度为40μm,复苏时间变化对体系影响不显著。     

支链淀粉水解酶水解支链淀粉的特异氨基酸分析

【目的】通过对具有支链淀粉水解能力的环糊精水解酶的结构进行分析,探寻决定酶与支链淀粉水解相关的关键氨基酸残基。【方法】对底物特异性发生改变的环糊精水解酶cds1-3进行功能鉴定,并利用分子模拟方法对其底物作用特异氨基酸序列和空间结构进行分析。【结果】环糊精水解酶cds1-3具有特殊的底物作用方式,它水解支链淀粉的能力强于水解环糊精。cds1-3和ThMA的蛋白质序列只有30个氨基酸的差异,主要位于远离底物结合区域的蛋白质中段,与环糊精水解酶的底物通道聚集位置相近。【结论】环糊精水解酶cds1-3的功能鉴定及对其关键氨基酸进行序列和空间结构分析,为揭示大分子底物,特别是支链淀粉底物的水解方式提供新的切入点。