基于网络药理学预测双莲方对肝细胞癌作用的机制

文章通过GEO数据库获取肝细胞癌样本差异表达基因,利用中药系统药理学数据库及 在线分析平台TCMSP收集双莲方的主要成分及作用靶点,通过Cytoscape构建双莲方中主要成分 的作用靶点与肝细胞癌相关基因的关系网络,预测双莲方治疗肝细胞癌的关键靶点基因,并利用 DAVID进行GO和KEGG富集分析,探讨双莲方治疗肝细胞癌的可能机制。结果表明,从双莲方中 筛选出225种活性成分,与肝细胞癌重合的靶点有28个,主要与肝细胞癌细胞中的激素代谢过程、 蛋白激酶复合物、细胞因子活性等关联,可能通过参与TNF信号通路、P53信号通路、Toll样受体信 号通路等发挥治疗肝细胞癌的潜在作用。研究结果为更深入地研究双莲方对肝细胞癌的作用提 供了理论依据。     

基于网络药理学与分子对接技术预测艾叶抗动脉粥样硬化的分子机制

为探讨艾叶抗动脉粥样硬化的作用机制,运用网络药理学与分子对接方法,通过 PharmMapper、Swiss Target Prediction 平台预测艾叶有效成分及潜在靶标,检索 DisGeNET 和 Genecards数据库获取动脉粥样硬化相关靶点,利用STRING构建靶标PPI网络,利用Cytoscape软件 进行可视化分析,利用DAVID进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,最后应用分子对接相关软 件对核心靶点与有效成分的结合情况进行对接验证。结果发现,共筛选出9个艾叶活性成分、274 个潜在的活性成分靶点、1 504个动脉粥样硬化相关靶点和120个成分靶点和疾病靶点的共同靶 点,提示艾叶可通过SRC、AKT1、VEGFA、HSP90AA1和RXRA等多靶点,PPAR、MAPK、Wnt、VEGF 等癌症通路和PIK3-Akt、Rapl、RAS、黏着连接等多个信号通路发挥抗动脉粥样硬化的作用,分子对 接验证结果显示主要活性成分与核心靶点亲和力良好。