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基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦IPT(CqIPT)基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到12个可分为4个亚组的CqIPT基因,同亚组CqIPT基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;CqIPT基因家族所有成员的表达模式存在明显差异,CqIPT9仅在顶端分生组织和花序中显著表达,CqIPT5和CqIPT11在花和未成熟的种子及干种子中显著表达;非生物胁迫下的基因表达同样存在多种模式。本研究为深入研究藜麦CqIPT基因的功能提供了一定的理论基础。 相似文献
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利用生物信息学的方法从藜麦基因组中鉴定得到25个CqYUCCA基因,并对其蛋白信息、进化关系及表达模式进行了系统的分析。结果表明:25个CqYUCCA基因不均匀地分布在藜麦12条染色体上,基因家族亲缘关系显示其编码的蛋白被分成四个亚组,每组的基因结构及蛋白基序的位置、数量均具有较高的相似性。根据已发表转录组数据分析,部分CqYUCCA基因受到干旱、高温以及盐胁迫的诱导。这些结果为进一步研究CqYUCCAs蛋白的生物学功能奠定了基础。 相似文献
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