基于核磁共振的代谢组学数据预处理

数据归一化是预处理中的重要组成部分,本文采用正常大鼠与I型糖尿病模型大鼠的尿液核磁共振谱图作为测试数据,研究了线归一、面归一和模归一3种数据预处理方法对代谢组学数据PCA分析结果的影响.分析结果表明,面归一预处理方法能够更好地在PC得分图上将对照组和糖尿病组的样本分开.此外,为了有选择性的去除代谢组学数据组中的噪声变量,本文引入新的参数R来评估PC得分图的分类效果,并把它引入适应度函数,设计相应的遗传算法,对代谢组学数据进行变量选择.经过变量选择后,主成分得分图上不同类别样本的可分性提高了,而且变量数大大地减少,更有利于特征代谢物的标记与识别.     

双过氧钒化合物NH4[OV(O2)2(C8H7N3)]·4H2O抗肿瘤活性研究

在细胞和动物实验水平上,研究了双过氧钒化合物NH4[OV(O2)2(C8H7N3)]×4H2O(简写bpV(Imi-Py))对癌细胞的增殖作用,碱性磷酸酶的活性抑制和体内抗肿瘤作用.研究结果显示bpV(Imi-Py)对胃癌细胞株MGC-803、肺癌细胞株95D和L342的IC50值分别为8.27、26.37和9.54μmol/L,而对人正常肾胚胎细胞HEK293的IC50值达6 642μmol/L,表明该化合物对肿瘤细胞具有特异杀伤作用.研究还表明bpV(Imi-Py)对MGC-803细胞提取液的碱性磷酸酶(ALP)也有明显抑制作用,呈现量效关系.动物体内抗肿瘤实验发现bpV(Imi-Py)能抑制肝癌细胞生长,肿瘤体积实验组较对照组下降35.6%,表明bpV(Imi-Py)有较好的抗肿瘤活性.另外,小鼠急性毒性实验的LD50为147.2mg.kg-1,说明bpV(Imi-Py)是一种中等毒性的抗肿瘤化合物.图4,表1,参15.     

基于NMR代谢组学的脉冲序列优化

基于NMR的代谢组学的直接研究对象是样品的NMR谱,因此基于NMR的代谢组学与制谱方法息息相关,有效的水峰压制、良好的谱图相位和平整的基线对代谢组学的后续统计处理至关重要.本文分析了1HNMR制谱中的3种常用脉冲序列(NOEPR,NOEPR-CPMG,ES-CPMG)的原理及性能,并以14个Ⅱ型糖尿病患者和14个正常人的血清样品为对象,分别利用这3种脉冲序列获取样品的1H-NMR高分辨谱,结合多元统计分析方法对这3种脉冲序列进行深入的研究和比较.结果表明,ES-CPMG序列在稳定性、可重复性等方面比其它2个序列更好,更适合血清样品的制谱和分析.