生物信息学的现状与展望

本文阐述了生物信息学产生的背景,生物学数据库,生物信息学的主要研究内容,与生物信息学关系密切的数学和计算机科学技术领域,生物信息学产业等内容,展望了其未来并提出了若干在我国发展生物信息学的建议。着重指出,理解大量生物学数据所包括的生物学意义已成为后基因组时代极其重要的课题。生物信息学的作用将日益重要。有理由认为,今日生物学数据的巨大积累将导致重大生物学规律的发现。生物信息学的发展在国内、外基本上都处在起步阶段。因此,这是我国生物学赶超世界先进水平的一个百年一遇的极好机会。     

DNA中的孤子

一、引言实验证实,DNA碱基中嘌呤和嘧啶环上的氢键质子,在室温下可与溶液中的氘核进行交换。这意味着DNA双螺旋的局部在室温下可自行打开或关闭。为了解释这一现象,1980年,美国学者恩格兰得(S. W. Englander)等     

人造生命与合成生物学

2010年5月,美国生物学家克雷格·文特尔(J.Craig Venler)等人在Science杂志发表了一篇论文,题目为:"实现由化学合成基因组控制的细菌细胞".工作由三部分组成:通过化学合成方法合成了簟状支原体亚种(M mycot.des sub.cap-GM12)基因组DNA序列片段.并利用酵母细胞将其装配成蕈状支原体完整基因组;将与其亲缘关系很近的山羊支原体(M.capricofum)的基因组去除;将人工合成的基因组植入去除了原基因组的山羊支原体细胞内.     

Z曲线,显示和分析DNA序列的直观工具

基于正四面体的对称性,我们将一DNA序列与三维空间中一条曲线,称为Z曲线,建立起一、一对应映射。对于任一给定DNA序列,可求出唯一的一条Z曲线与之对应,反之亦然。Z曲线一般是具有丰富的折叠结构的三维空间曲线,它反映了DNA序列中碱基分布的局部细节与总体特征。Z曲线的对称性、渐近性、回路性等性质被全面加以介绍。并探讨了Z曲线在分子生物学中可能的应用。Z曲线的提出,开创了一个利用几何学分析和研究DNA序列的崭新领域。我们深信,利用现代计算机图形学装备起来的Z曲线,将成为研究和分析DNA序列的新的强大工具。     

同位标量介子共振态的质量谱

目前实验上已经发现的同位标量的非奇异的介子共振态已达五种.它们的静质量M、自旋J、宇称P和同位宇称G,都列在表1中.     

人与其他生物基因组若干重要问题的生物信息学研究

Z曲线是表示DNA序列的一个等价的三维空间曲线.通过对Z曲线的研究来对基因组序列进行研究是一种几何学的途径.用这种思路研究了真核和原核基因组中若干重要问题,包括人与高等真核生物基因组的Isochore结构,微生物基因组的基因水平转移,古细菌基因组复制起始位点识别,酶母基因组基因识别,细菌与古细菌基因组的ab initio基因识别,SARS-CoV基因组基因识别,高G C含量微生物基因组的结构以及比较基因组学等的研究.文中综述了天津大学生物信息中心最近6年来在上述研究中所取得的进展.     

合成生物学:我国急需发展的前沿科学

一般认为"合成生物学"这一术语在1980年就正式提出了,但其开始快速发展是近几年的事。什么是合成生物学?可谓众说纷纭。因为研究人员来自不