三维树木的计算机模拟

对树木等非规则自然景物进行计算机模拟方法中具有较强影响力的是由Barnsley提出的迭代函数系统IFS方法。在此基础上介绍了生成三维分形树木的基本方法,并将树干、分叶分别进行阐述,根据对效果要求的不同,提出了绘制树叶的不同方法。该方法既可以绘制出树木自然形态的特征,又可利用以几何多边形为基本的构形单位,运用各种成熟的光照、纹理方法对树体进行渲染,产生光照的效果,生成具有高度真实感的三维分形树木。     

不同pH值的酸处理溶菌酶溶液的拉曼光谱分析

分析了pH 5.0到pH 1.0的溶菌酶溶液的激光拉曼谱,酰胺Ⅰ振动谱带分别出现在1660、1656、1657、1660和1655 cm^-1,酰胺Ⅲ振动谱带分别出现在1255、1257、1263、1261、1260 cm^-1和1301、1302、1302、1302、1301 cm^-1,并计算了它们相对强度的变化.由此定性可知,该蛋白质分子的肽链主要由α-螺旋和无规则卷曲组成.在酸化的过程中,溶菌酶的构象基本一直保持稳定,但当pH＜2.0时,该溶菌酶开始变性.在pH=5.0时酪氨酸为“暴露式”,当pH=4.0-2.0时为“埋藏式”,而到了pH=1.0时酪氨酸的双峰已基本消失了.色氨酸的1361 cm^-1的强度随酸性的增强而减弱,由“埋藏式”逐渐转化为“暴露式”.硫-硫桥键的振动谱带按pH5.0到pH1.0的顺序分别在508、508、507、507和509cm^-1,且强度基本不变,表明在酸环境中,硫-硫键部位的几何构型都是扭曲-扭曲-扭曲,pH值的改变对几何构型无影响.     

利用ABEEM/MM模型对气态丝氨酸和苏氨酸残基二肽分子构象的研究

应用ABEEM／MM浮动电荷模型（原子一键电负性均衡方法融合进分子力场）对气态丝氨酸和苏氨酸残基二肽分子构象进行了初步的研究，与经典的力场模型相比，该方法中的静电势包含了分子内和分子间的静电极化作用，以及分子内电荷转移影响，同时加入了化学键等非原子中心电荷位点，合理的体现了分子中的电荷分布。相对其他极化力场模型，该模型具有计算量较小的特点。结果表明：我们模型计算的两种二肽分子的构象能和关键二面角结构与从头计算结果符合得很好，优于其他力场模型。     

Subunit Structure and Conformation of Bombyx Mori Silk Proteins

Molecular weights of the silk fibroin were determined by polyacrylamide gel electrophoresis in the presence of so-didium dodecyl sulfate (SDS - PAGE): The silk fibroin molecule consisted of subunits a, b and c with molecular weights of 280 kD, 230 kD and 25 kD respectively, of which the b subunit was composed of two subunits e and f with molecular weights of 130 kD and 125 kD, respec-tively, connected by disulfide bonds. The conformation of silk fibroin and subunits was determinated by Raman spectroscopy and Large angle X - ray diffraction) LAXS. The native silk fibroin only contained a - helix and random coil, but there were three conformation such as random - coil.a - helix and β - sheet in the silk fibroin dissolved in KSCN solution and frozen at - 20 °C. This suggested that KSCN solution and - 20°C freezing action could lead to the conformational transi-tion from random - coil and a - helix to P - sheet. The a subunit mainly existed in β - sheet conformation, in con-trast, the c subunit was chie     

Activation of Calf Intestinal Alkaline Phosphatase by Trifluoroethanol

IntroductionAlkaline phosphatase(EC3 .1 .3 .1 ) is a nonspecificphosphomonoesterase that is found in bothprocaryotes and eucaryotes as a dimer withidentical subunits[1] .It belongs to the group ofenzymes attached to the lipid bilayer of membranesby a glycosylphosphatidylinositol anchor[2 4] .Itis ametalloprotein that has two Zn2 +ions and oneMg2 +ion in each active site.Both its catalyticmechanism and structure have been thoroughlystudied and reviewed[5,6 ] .In mammals,alkalinephosphatase is…     

变性剂和缓冲系统对适冷蛋白酶MCP-01和中温蛋白酶BP-01构象影响的圆二色光谱分析何海伦， 陈秀兰*

运用圆二色（CD）光谱分析了适冷蛋白酶MCP-01和中温蛋白酶BP-的二级结构。与BP-01相比,MCP-01具有较低的α螺旋含量和较高的无规则卷曲,表明适冷蛋白酶MCP 01的结构可能具有较高的柔性和较低的稳定性。测定MCP-01和BP-01的变性温度表明,MCP-01的变性温度比BP 01 低10.7℃。测定了变性剂盐酸胍（GuHCl）、2,2,2 三氟乙醇（TFE）对MCP-01和BP-01结构的影响。盐酸胍使MCP-01和BP 01变构的浓度分别为1.0mol/L和3.0mol/L,TFE造成MCP 01和BP 01开始变构的含量分别为20%和30%。这表明,与中温酶相比,变性剂在较低浓度下就可使适冷酶变构,从而造成活性的丧失。检测了两种蛋白酶在保温过程中构象的变化情况。不同缓冲系统明显影响MCP 01的构象稳定性,MCP 01在不同缓冲液中构象稳定性为：碳酸缓冲液相似文献   

应用SDSL-EPR技术研究溶液中牛血清白蛋白的运动性及构象变化

应用位置定向自旋标记-电子顺磁共振(SDSL-EPR)技术研究牛血清白蛋白(BSA)的运动性、构象特征及其加入芹菜素(Apigenin)后的变化.采用MTSL对BSA的第34位半胱氨酸(Cys)进行标记;通过EPR检测计算旋转相关时间τc及强弱固定化之比S/W研究运动性的变化;通过功率饱和实验检测该位点的易趋性,研究构象特点及其变化.在BSA溶液中加入Apigenin后,τc及S/W值明显降低,说明其Cys位点运动性变快;易趋性检测结果显示,34位Cys位点位于蛋白质表面,加入Apigenin后,该位点构象发生改变,且微环境由亲水性变为疏水性.实验揭示BSA同Apigenin能够相互结合,且引起BSA自由Cys位点的运动性和构象的改变.     

蛋白亚基局部相互作用模拟构筑二十面体病毒衣壳

二十面体病毒衣壳结构蛋白具有不同的构象。装配过程中,正在附着的蛋白亚基构象与位置在先前蛋白亚基构象的指令下,发生相应的调整后装配到衣壳骨架上。局部相互作用指导下的装配反复进行,最终形成规整的二十面体病毒衣壳的立体结构。对T=1、3、4、7的病毒衣壳,分别建立了蛋白亚基构象局部相互作用的连接方式与增长方式,并构筑了T=4、7的立体模型。     

马来海松酸二酰亚胺的合成及其构象

以一级松香与马来酸酐的Diels-Alder加成产物马来海松酸及其进一步甲酯化产物马来海松酸甲酯为反应原料,制备了1个新型N-芳香基马来海松酸二酰亚胺.化合物的结构均经元素分析、NMR和MS表征,用COSY,HMQC和HMBC进一步对新型N-芳香基马来海松酸二酰亚胺进行结构分析,首次发现松香背景的衍生物在溶剂中能够进行构型的动力学翻转,并利用2D NMR确定了其trans和cis在溶液中的构象.     

不同分子量PVP对PCR扩增反应效率的影响

以人为设计的110bp单链DNA为模板,研究不同分子量聚乙烯基吡咯烷酮(Polyvinyl-pyrrolidone,PVP)对聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)的影响。实验结果表明:0.5%的PVP K-30、PVP 8000、PVP 58000和PVP 630000均可显著提高PCR效率,并且这4种化合物提高PCR效率的能力,依次为PVP 630000>PVP 58000>PVP K-30和PVP 8000;然而,在相同浓度时,PVP K-40却显著抑制PCR扩增反应;另外,溶解曲线的实验结果显示,0.5%PVP 630000可显著降低PCR产物的Tm值,表明PVP 630000可通过与DNA相互作用,降低DNA结构稳定性,使得模板更易在PCR的变性阶段解链,最终提高PCR效率。上述研究结果表明,不同分子量的PVP对PCR扩增效率的影响不同,与其分子量大小密切相关。