磷酸化油菜秸秆纤维素吸附剂的制备和对牛血清白蛋白的吸附

以天然产物油菜秸秆纤维素粉为基质,二甲基甲酰胺为交联剂,磷酸为修饰剂,制备了新型磷酸化油菜秸秆纤维素生物吸附剂.用红外光谱、透射电子显微镜和X射线光电子能谱,对油菜秸秆纤维素粉和磷酸化油菜秸秆纤维素吸附剂进行了表征.研究了油菜秸秆纤维素粉改性前后溶液的pH、吸附时间、BSA的初始浓度、温度和离子强度等因素对牛血清白蛋白(BSA)的吸附的影响.结果表明:在25℃,pH 5.0、6.0,吸附20 h的条件下,磷酸化油菜秸秆纤维素粉微球对BSA的吸附容量为127.39 mg/g,而未修饰油菜秸秆纤维素粉微球对BSA的吸附容量只有68.98 mg/g,说明改性获得较好的性能.吸附剂的吸附等温线符合Langmuir方程,属单分子层吸附.     

决策树算法预测人类病毒的蛋白质磷酸化位点

本文基于决策树分类算法构建人类病毒蛋白质磷酸化修饰位点的预测模型。采用氨基酸物理化学性质对蛋白质序列进行特征提取,并分析丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点邻近序列的氨基酸性质。同时考察了不同分类算法对预测结果的影响。通过10倍交叉验证,利用决策树算法预测丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点的MCC分别达到77.31%、75.91%和71.94%,表明本文提出的方法能有效地预测人类病毒的磷酸化修饰位点。     

金属有机框架(MOFs)材料在生物富集中的应用

与传统无机多孔材料相比,金属-有机框架(Metal-organic frameworks,MOFs)材料孔径可调,具有更高的孔隙率,更大的比表面积,多样化的结构及功能等特点,因而已经被广泛应用于传感器、催化剂、气体吸附与分离、药物载体及控释等领域中。本文主要综述MOFs材料在生物富集中的应用,根据不同的富集机理,分别对低丰度肽、磷酸化肽和糖肽进行富集研究进展。在预富集过程中,总结了已应用的MOFs材料的种类和所具有的功能及其展现出的富集性能。     

喷洒低浓度亚硫酸氢钠可促进小麦叶片光合磷酸化和光合作用

用１～２ｍｍｏｌ／Ｌ ＮａＨＳＯ３喷施于小麦叶面，可以提高叶片的光合速率，并能持续３ｄ左右。左此条件下，光下叶片中的ＡＴＰ含量提高，叶片的毫秒延迟发光加强，反映与光合磷酸化活力有关的跨类囊体膜质子样度增加。将书知可促进循环光合磷酸化的辅助因子ＰＭＳ和ＮａＨＳＯ３分别和共同喷洒叶片，次日所有叶片的光合速率均比对照（喷水）提高２０％左右。共同自理未出现叠加效应，表明ＨａＨＳＯ３的主要作用和ＰＭＳ促进光     

植物脱落酸信号转导研究进展

本文从脱落酸(ABA)结合位点与受体、Ca~(2 )信号系统、蛋白质的可逆磷酸化、磷酸肌醇系统及 G 蛋白等几个方面介绍了脱落酸信号转导的研究进展。     

SGK和14-3-3蛋白与TPO/MPL信号传导的丝氨酸/苏氨酸磷酸化机制有关

血小板生成素(thrombopoietin, TPO)是调节血小板生成最主要的细胞因子, 它的生物学效应由其受体c-Mpl介导. 用酵母双杂合系统(two-hybrid system)筛选了与c-Mpl膜内部分相互作用的蛋白质. 在5×106个转化子中, 得到48个阳性克隆. 测序结果表明, 其中一个是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SGK (serum and glucocorticoid-inducible kinase)的部分编码序列(编码第246位氨基酸至C末端, 包括3′端非编码区); 另一个为14-3-3 theta亚型蛋白的部分编码序列(编码第67位氨基酸至C末端, 包括3′端非编码区). 体外GST-Pulldown分析和免疫共沉淀进一步证实了c-Mpl与它们的相互作用. 通过系列缺失研究发现两个蛋白与c-Mpl相互作用的区域都在523~554 aa范围内. 用酵母双杂合系统进一步研究SGK和14-3-3蛋白之间的关系, 发现两者可能直接相互作用. SGK和14-3-3蛋白可能与TPO/MPL信号传导过程中的丝氨酸/苏氨酸磷酸化有关.     

PDGF-BB活化PSCs的分子机制研究

血小板生长因子(PDGF)是诱导胰星状细胞(PSCs)活化的重要细胞因子，其分子机制尚不清楚。用PDGF-BB诱导体外培养的PSCs，旨在探讨PDGF信号转导通路在胰纤维化形成的分子发生机制中的可能作用。PSCs与不同刺量PDGF-BB(10ng／mL，25ng／mL和50ng／mL)共培养，24h后收集细胞，采用Western-blotting检测，PSC中磷酸化细胞外信号调节激酶-1(pERK1)蛋白水平和RT-PCR检测Colal(Ⅰ)mRNA的表达。结果表明，不同刺量PDGF-BB作用于PSCs后，各组pERK1蛋白表达比空白对照组有不同程度上调；Colal(Ⅰ)mRNA在PSCs中表达也明显上调，且在一定范围内与PDGF-BB刺量呈正相关。     

海洋病原细菌Enterobacter sp. EM28-2P -存在氯霉素磷酸化灭活机制

报道1例非氯霉素产生菌中发现的氯霉素磷酸化灭活机制.海洋病原细菌Enterobacter sp. EM28-2P -(Cm r,cat -,MIC=25 μg/mL)接种在含25 μg/mL标准品D-(-)-氯霉素LB培养基中培养24 h后,可生成磷酸化氯霉素.LC-MS分析检测出新生成3个离子峰m/z 400.9,402.8和404.9,都是典型[M PO 3 -H] -的特征指纹峰,对应于氯霉素的C3位羟基磷酸化产物.     

氨基酸代谢与抗阻训练对骨骼肌mTOR的调节作用研究

抗阻训练在一定程度上能刺激肌肉生长,肌肉收缩和恢复过程中刺激蛋白质分解、合成的分子机制.从氨基酸、抗阻训练对骨骼肌mTOR的调节角度出发,综述了mTOR对细胞生长的作用、mTOR下游靶分子的调节、氨基酸对mTOR的活化作用和抗阻训练对mTOR信号转导调节的研究现状,并探讨了氨基酸与运动对mTOR的调节作用及机制.     

基于多头注意力机制的磷酸化位点预测模型

计算预测蛋白质磷酸化位点的方法常用于位点识别的初筛阶段。为了提升位点初筛的准确率,本文提出一个深度学习模型MAPhos。该模型首先运用氨基酸向量与位置向量的和表示每一个氨基酸残基;随后使用双向GRU循环神经网络捕获各氨基酸残基的特征;接着引入多头注意力机制计算各注意力头的子上下文向量,并将它们连接起来构成肽段的上下文向量;最后通过一个全连接神经网络进行非线性变换和结果预测。真实数据集上的实验结果表明,MAPhos模型预测磷酸化位点在AUC值、灵敏度、正确率、精度和F₁分数统计度量上胜过基于特征提取的模型和基于卷积神经网络的模型,同时与基于卷积神经网络的模型相比具有更好的可解释性,这证明了MAPhos模型更加适用于磷酸化位点识别任务的初筛阶段。