基于ISA-ECI参数的肽高效液相色谱保留时间支持向量机预测模型

基于氨基酸描述子ISA-ECI,利用加和法构建了101个混杂肽高效液相色谱保留时间的支持向量回归(SVR)预测模型(ε=0.001、σ=4和C=100),并与多元线性回归和投影寻踪回归作了比较研究,结果表明SVR要好于其它方法,SVR方法对数据集留一法交叉检验和拟合的预测复相关系数分别为0.8822和0.9530,其预测结果与实验值一致.且提出了一个简单的方法并指出保留时间与描述肽的分子结构信息的ISA-ECI参数存在着非线性关系.     

小肽融合蛋白通过阻断VEGF与KDR结合抑制血管生成与肿瘤生长

血管内皮细胞生长因子（VEGF）结合酪氨酸激酶受体KDR／FLK1能促进血管生成。筛选能封闭VEGF与KDR相互作用的小肽可以通过阻断血管形成而抑制实体瘤生长。将从噬菌体12肽库中筛选而获得的能与KDR结合的123肽K237DNA克隆到表达载体p QE42中，在大肠杆菌M15中稳定表达二氢叶酸还原酶融合蛋白DHFJR－K237，经变性、复性后得到纯度达90％的可溶性蛋白。体外实验显示，DHFR－K237能竞争抑制VEGF结合KDR，显著抑制由VEGF刺激而引起的人脐静脉内皮细胞增殖；体内实验表明，DHFR－K237能显著抑制鸡胚尿囊膜血管形成和荷瘤裸鼠中肿瘤的生长。结果表明，12肽K237是VEGF结合KDR的有效拮抗剂，具有抗肿瘤生长和转移的潜在应用前景。     

固相合成促性腺激素释放激素GhRH及其类似物

采用Merrifield多肽固相合成法，合成了促性腺激素释放激GhRH，即PGlu.His.Try.Ser.Tyr.Gly.Leu.Agr.Pro.Gly.NH2以及类似物[D-Ala^6][去Gly.NH2^10]GhRH乙基酰胺，即PGlu.His.Try.Ser.Tyr,D-Ala.Leu.Arg.Pro.NH-C2H5和[Arg^2]GhRH，即PGlu,Arg,Try.Ser.Tyr.Gly.Leu.Arg.Pro.Gly.NH2并得到纯品。     

基于免疫学的入侵检测系统模型

随着网络安全问题日益突出 ,入侵检测越来越受到关注 ,针对目前各种类型的防火墙和防病毒软件都存在一定的缺陷 ,该文基于仿生学的免疫原理 ,将肽链定义为在网络操作系统中由授权程序执行的系统调用短序列 ,提出了一种新型的入侵检测系统———基于免疫学的入侵检测系统 ,并对其主要功能模块 :免疫计算机和监控器进行了分析。该系统可有效地提高系统实时检测和响应入侵的能力     

Cu2+对日本沼虾幼虾的急性致毒研究

Cu2+浓度为0.000 5 mg/L、0.005 mg/L、0.05 mg/L时,日本沼虾幼体在54 h内均能够正常存活;Cu2+浓度为0.1 mg/L时,只有部分沼虾幼体中毒致死.而当Cu2+浓度超过0.25 mg/L时,日本沼虾幼虾在48 h内致死,并出现鳃变兰、肝脏变黑的现象.随着Cu2+浓度增大,日本沼虾幼虾存活的时间变短,肝脏和鳃的中毒颜色变深.日本沼虾幼虾48 h的半致死浓度为0.268 mg/L,其安全浓度为0.026 8 mg/L.     

猪颌下腺活性肽对大鼠应激性溃疡形成的影响

实验选用体重200—250g S.D.系健康大鼠27只.雌雄不拘。浸水应激6小时后致大鼠产生应激性胃溃疡,并观察猪颌下腺活性肽在其中的作用。结果如下:对照组动物胃溃疡面积密度为17.9±1.43%(平均值±标准误.下同);应激前30分钟腹腔注射颌下腺活性肽0.1mg 组溃疡面积密度为19.1±2.62%;0.2mg 组溃疡面积密度为10.7±1.78%,较对照组减少40.2%(P<0.01);0.5mg 组溃疡面积密度为5.3±0.96%。分别较对照组和0.2mg 组减少70.4%(P<0.001)和50.5%(P<0.01)。统计表明,大鼠胃溃疡面积密度与活性肽注射剂量呈明显的负相关(r=-0.9302,P<0.05)。本工作提示,猪颌下腺活性肽具有阻止或减轻大鼠应激性溃疡形成的作用。     

TGS晶体中取代基元的作用

硫酸三甘肽([NH_2CH_2COOH]_3·H_2SO_4)简称TGS,从TGS的过饱和溶液中可生长,出优质完整的TGS晶体。TGS晶体是一种较典型的铁电体,居里温度(T_c)为49℃左右,在室温下,它具有优良的热释电性能,但当温度高于T_c时,晶体的自发极化消失,变为无极性晶体。 TGS晶体结构沿c轴方向的投影,如图1所示。 TGS晶胞是由三种构型不同的甘氨酸     

3种沼虾的16S rRNA基因序列分析

为从分子角度理解3种沼虾,即罗氏沼虾、日本沼虾和祁连沼虾的遗传差异,为沼虾资源的管理、保护和合理开发利用提供理论基础,采集了每种沼虾各2尾样本,采用PCR的方法扩增了其线粒体16S rRNA基因片断并测序。比对后共获得了3种沼虾的297 bp的16S rRNA片断序列,共检测到47个变异位点,总变异率为15.8%。3种沼虾的平均碱基含量分别为T(37.7%)、C(10.9%)、A(29.8%)和G(21.6%)。罗氏沼虾种内个体间序列差异为3%。祁连沼虾和日本沼虾种内个体间差异均为0.7%,且两者种间差异很小,为0～0.7%。罗氏沼虾与祁连沼虾、日本沼虾之间的序列差异在13.1%～14.8%之间,种间差异明显。系统进化树显示罗氏沼虾自成一枝,而日本沼虾和祁连沼虾共同构成另一枝,日本沼虾和祁连沼虾的遗传距离小于5%,结果提示日本沼虾和祁连沼虾有很近的亲缘关系,两者也许是亚种关系。     

新城疫病毒F 蛋白七肽重复序列（HR）三螺旋HR212蛋白的抗体抑制病毒和细胞融合

膜融合是囊膜病毒侵染过程中的一个关键步骤,新城疫病毒(NDV)融合蛋白(F)中两个高度保守的七肽重复序列—HR1和HR2是病毒膜融合过程中的重要功能结构域,在膜融合不同时期表现出不同的构象,因此可能是产生中和抗体反应的潜在的靶目标．作者曾发现HR2多肽和稳定的三螺旋蛋白HR2-HR1-HR2(HR212)能够抑制新城疫病毒(NDV)与细胞的融合．文中证实HR212蛋白在家兔中能引发很强的免疫反应,所产生的抗体可识别HR1和HR2多肽序列,并能抑制NDV和鸡红细胞的血凝反应,以及抑制病毒和细胞的融合．研究结果说明NDV HR212复合体在作为病毒和细胞融合的抑制物的同时,所产生的抗体也可以阻断病毒的侵染．     

Study on peptide-peptide interaction using high-performance affinity chromatography and quartz crystal microbalance biosensor

The specific interaction between sense and antisense peptides was studied by high-performance affinity chromatography （HPAC） and quartz crystal microbalance （QCM） biosensor. Fragment 1-14 of human interferon-β （hlFN-βwas chosen as sense peptide and its three antisense peptides （AS-IFN 1, AS-IFN 2, and AS-IFN 3） were designed according to the degeneracy of genetic codes. The affinity column was prepared with sense peptide as ligand and the affinity chromatographic behavior was evaluated. Glu-substituted antisense peptide （AS-IFN 3） showed the strongest binding to immobilized sense peptide at pH 7.5. A quartz crystal microbalance-flow injection analysis （QCM-FIA） system was introduced to investigate the recognition process in real-time. The equilibrium dissociation constants between sense peptide and AS-IFN 1, AS-IFN 2 and AS-IFN 3 measured 2.08×10^-4, 1.31×10^-4 and 2.22×10^-5 mol/L, respectively. The mechanism study indicated that the specific recognition between sense peptide and AS-IFN 3 was due to sequence-dependent and multi-modal affinity interaction.