用于样本聚类和网络分析的整合鲁棒结构化NMF模型

为了更好地保留数据之间的同质性，提出了一种整合鲁棒结构化非负矩阵分解（integrated robust structured non-negative matrix factorization，iRSNMF）模型，并在该模型中引入一个结构化项.将该模型用于癌症样本聚类实验和基因共表达网络分析，以验证其有效性.根据现有文献对相关基因和通路进行生物学解释.实验结果表明，iRSNMF模型聚类性能较好并且能够挖掘到的关键基因更多.用iRSNMF模型获得的基因和通路在癌症的发病机制中起着重要作用，并为癌症诊断、治疗和预后提供了新的思路.     

生物课程的信息技术资源开发与利用

随着信息技术的迅猛发展,计算机和网络技术在各个教育领域被广泛应用,信息技术资源在生物学教学中的作用越来越大.如何充分开发和利用这些信息技术课程资源,提高生物教学质量,扩大教学规模,实现教学效果的最大化、最优化,已成为当前课程改革研究的一大热点.     

表皮生长因子及其作用机制

表皮生长因子及其受体的研究成为近年来生物化学研究的热点之一,其具有多种生物学活性和丰富的临床应用前景.重点综述了表皮生长因子分子结构、生物学作用及其作用机制,为更深入地探索开发表皮生长因子的应用价值提供理论基础和参考.     

基于随机生存森林与网络拓扑信息的食管癌风险预测

为精确预测食管癌病人的存活风险,通过构建食管癌编码基因(mRNA)和非编码基因(ncRNA)共表达网络,利用随机游走挖掘网络节点的拓扑权重,并与随机生存森林(RSF)整合,构建食管癌风险预测模型.结合5倍交叉证实和独立数据集验证,利用C-index评估算法预测性能.识别出了用于构建风险预测模型的最优lnc RNA分子标签,并实现了食管癌生存风险的精确预测.     

图形聚类算法的代谢网络模块化分析

代谢网络的研究是当今生物学研究中的新热点,使用图形聚类算法对代谢网络进行分析研究是一个有力的手段.文中提出了用图形聚类方法挖掘复杂代谢网络中蕴含的功能信息并进行模块相似性分析的方法,从系统生物学角度揭示光合作用的进化.介绍了马尔可夫聚类算法和模拟退火聚类算法两种图形聚类方法;给出了两种方法对叶绿体和蓝细菌的代谢网络进行聚类的结果;定义了模块相似度评价指标,挖掘叶绿体和蓝细菌间保守的功能模块,并对其网络结构进行了比较分析.     

生物课程的信息技术资源开发与利用

<正>随着信息技术的迅猛发展,计算机和网络技术在各个教育领域被广泛应用,信息技术资源在生物学教学中的作用越来越大。如何充分开发和利用这些信息技术课程资源,提高生物教学质量,扩大教学规模,实现教学效果的最大化、最优化,已成为     

长期运动对一氧化氮的影响

NO作为一种新型的信息分子,具有广泛的生物学作用,在机体的生理和病理过程中都起着非常重要的作用.本文就长期的体育运动对NO及其合酶的影响进行了探讨,以发现不同运动对NO含量变化影响的规律,并展望未来研究的方向.     

油菜素内酯合成途径相关基因的研究进展

油菜素内酯是一种甾类化合物,广泛存在于各类植物中,对植物生长发育起积极作用,有助于植物有机物的积累,并且能够显著提高植物抗旱性、抗盐性.植物中油菜素内酯合成途径的研究在一定程度上已较为完善,其途径中相关基因的功能也在逐步研究中,发现这些基因也能够起到一些重要的生物学作用.将近年发现的油菜素内酯合成途径中各基因的生化功能进行介绍,并对这些基因在不同生物学过程中各自的功能进行综述,旨在为后续的研究中在更多植物中对这些基因进行更好地分析和利用提供可行性帮助和理论参考.     

RNA干扰技术及其应用

RNA干扰(RNA in terference,RNA i)技术是抑制和逆转基因表达的新型生物学研究工具.论述了RNA i的作用机制及其在基因组学、基因治疗、药物探查等方面的应用情况.d sRNA在酶切作用下产生siRNA,后者与RNA诱导沉默复合物R ISC结合,共同降解靶mRNA,从而达到阻断特异基因表达的目的.该技术已对基因功能、基因治疗和药物筛选等方面的体外实验产生了深刻的影响,但由于存在一些尚未解决的问题,这项技术尚未进行大规模临床应用.     

轮网络的直径和平均距离研究

轮网络是由Cayley图模型设计出来的一种新型互连网络模型.在研究互连网络性能中,直径和平均距离起了重要作用,为网络的传输延迟提供了度量参数.研究了轮网络的直径和平均距离,证明了当N=4,5,6时,d(Wn)=[3(n-1)/2]-1;当n≥7时,d(Wn)=[3(n-1)/2],得到轮网络的平均距离的上界:■(Wn)≤n-4-4/(n-1)+4/n+4/(n!)+∑i/1 from i=1 to n.