进化速率的研究与进化理论的统一

不同进化学说之间的争论大多与进化速率问题有关。在生物组织的不同层次上的进化速率研究得出了截然不同的结论,并导致相关的进化学说之间的互不相容。恒速的、匀速的、随机的分子进化(中性说)与非匀速的、适应的表型进化相矛盾;在自然选择作用下的渐进的适应进化(综合论)难以解释古生物记录所揭示的停滞与跳跃相间的、有时是爆发式的大进化现象。这些矛盾大多源于对进化速率的度量的不同,各层次的进化速率的含义也不同,各学说之间缺乏统一语言。生命史的重大进化事件发生的时间表显示出明显的非匀速特征：绝大多数重大进化事件发生在生命史的早期(40至35亿年前)和晚期(7亿年以近)。前生命的化学进化、生命起源、细胞生命的基本结构和代谢途径、以及生物进化和地球生物圈赖以建立的基础早在生命史开始后的几亿年内就已完成或确立了;复杂的高级生命和生物多样性的产生与重要的结构的进化革新发生在生命史末端的数亿年间。本文将宏进化的这种非匀速现象解释为地球生命与地球环境协进化的结果。当前进化理论的分裂是由生命科学及相关科学的发展所引起的,进化理论也必将随着各学科领域研究的深入而走向统一,走向新的综合。     

自然选择质疑

当代对达尔文进化 论的争论几乎是全方位的,尽管当今达尔文主义者的立场和论调与原先的达尔文的进化论已有很大出入,比如：现代综合进化论对自然选择的创造性作用的突出强调、间断平衡论对达尔文随机渐变理论的重新解释,等等,但现代达尔文主义者对作为达尔文进化论核心的自然选择理论一般都是坚持的。本文试图立足于现代自然科学发展的前沿,对这一理论做出再反思。一、人工类比之误与“创造性”虚设达尔文的进化机制实质上可以概括为两个过程,第一步是随机的遗传变异。即进化根源于个体中随机的遗传性变异（突变）的积累。这些随机突…     

自然选择和中性说

自然选择学说是达尔文进化论的核心理论,也是现代达尔文主义的主要依据。达尔文认为：自然选择即指适者生存,不适者被淘汰的现象。自然选择是通过积累微小的有利变异而促进生物进化。本世纪三、四十年代兴起的现代达尔文主义,将群体遗传学研究成果运用于进化理论,重申了达尔文自然选择学说在生物进化中的主导地位,并用选择的新概念解释了达尔文进化理论中的许多难点。他们认为,生物在进化过程中会产生许多有害的突变,自然选择淘汰对生存有害突变,而一些对生存有利的突变则在自然选择过程中得到扩散,增加了基因频率,促进了物种分化…     

从动物的杂交发育谈生物的遗传与进化

自达尔文于1859年发表了他的《物种起源》一书后,人们在物种起源的论战上才有了一个正确的认识,即物种的形成,在起源上有其统一性,在形成过程中,有着进化的历程.这样一来,传统的"特创论",就不得不让位于"进化论"了.达尔文在《物种起源》一书中,非常重视生物的生殖——尤其是杂交繁育问题.原因不外有二:     

试论达尔文进化论在生态学发展中的地位

介绍了现代生态学发展的特点和达尔文的进化论及完善过程，认为达尔文提出的生态思想是朴素的生态观，其进化论是种—种群的进化，从本质上并未涉及到其他生态学等级的进化；必须以普遍联系的系统观和时空观评价生态学发展现状，生态学研究也必须注重局部各因子之间、整体与局部之间的作用关系。初步探讨了能否象牛顿力学那样将自然选择力作为推动生物进化的“万有引力”的生态学研究问题。     

一种基于等位基因原理的NSGA-Ⅱ算法

NSGA-Ⅱ算法是通过模拟达尔文进化原理,采用选择、交叉和变异等操作算子,对个体种群进行繁殖和进化,以实现多目标优化.在NSGA-Ⅱ算法进化过程中,变异或交叉操作应用于个体的所有基因.但在真实的自然变异过程中,生物体根据等位基因频率的原理,不会整个基因发生变异,而只有少数基因会发生变异.同时,在交叉操作中该生物体仍有变异的机会.为了完全模拟自然变异过程,笔者提出了一种基于等位基因原理的NSGA-Ⅱ算法,该算法允许个体在变异过程中保持某些基因不变,在交叉操作中却仍有变异的机会.实验结果表明,与其他多目标进化算法相比,该算法显著提高了搜索性能,且具有收敛性强和不易陷入局部极小的特点.     

进化的新视角——基因量变质变方向理论

达尔文的进化论叙说了生物的进化方式是通过基因突变引起的,通过"物竞天择,适者生存"来保存变异后更能适应环境的基因,从而实现生物的进化。生物的进化是通过基因的改变这点毋庸置疑,然而达尔文这种突变理论无法解释。     

分子进化中性理论的进展

中性理论与达尔文的自然选择进化论有明显的差别。中性论认为在分子水平上覆盖着多数的进化改变，是在连续产生突变时，由于选择中性（即选择相等），使突变得到随机的固定（即小群体内，样本的随机漂变）。还认为在分子水平上，大多数的种内变异（如蛋白质和ＤＮＡ多态）是选择中性或近于中性，它们能够保持在种内是由于突变的产生和随机消失之间的平衡引起的。近年来，ＤＮＡ顺序的研究资料，都有力地支持中性论，如鼠的拟球蛋白基因、鼹鼠的αＡ－晶状体蛋白、流行性感冒Ａ病毒基因，果蝇的核和线粒体基因等。所以，从地球上生命的历史来看，中性进化的改变至少在数量上已超过达尔文自然选择进化的改变。     

自然选择质疑

 当代对达尔文进化 论的争论几乎是全方位的,尽管当今达尔文主义者的立场和论调与原先的达尔文的进化论已有很大出入,比如：现代综合进化论对自然选择的创造性作用的突出强调、间断平衡论对达尔文随机渐变理论的重新解释,等等,但现代达尔文主义者对作为达尔文进化论核心的自然选择理论一般都是坚持的。本文试图立足于现代自然科学发展的前沿,对这一理论做出再反思。一、人工类比之误与“创造性”虚设达尔文的进化机制实质上可以概括为两个过程,第一步是随机的遗传变异。即进化根源于个体中随机的遗传性变异（突变）的积累。这些随机突变被看作是左右生物存在的生命的物理决定因素,也被看作是所有进化新特性的源泉。     

语言模因与文化进化

模因论是建立在达尔文进化理论基础上的解释文化进化规律的新理论.模因被认为是连接生物进化和文化进化的桥梁,既有生物基础,也有文化表象.语言模因在传承传统文化、促进文化进步、发展多元文化和吸纳外国文化等方面都有着积极的影响.     

有脑动物的CBASE进化假说

本文首先定义了动物知识、动物文化等概念。又通过分析当某种生态位因素发生变化时所引起的动物种群的反应过程，指出动物文化、动物行为．动物躯体因素是相互促进的关系，有着多条正反馈促进环路，因此动物文化－动物行为－动物躯体因素的同步进化是可能的。文中据此提出了有脑动物的同步进化（CBASE）假说及多态进化观。与达尔文式进化相比较，CBASE是一种在效率上要高得多的定向进化，它很可能是寒武纪生物大爆发的内在动因。     

进化规划和进化策略中变异算子的若干研究

介绍了进化规则和进化策略中使用的三种变异算子及其性质，应用概率论方法比较了它们的局部搜索和局部逃逸性能。结果表明，柯西变异算子和正态变异算子分别具有良好的局部逃逸和局部搜索能力，而平均变异算子在一维时同时具有良好的局部逃逸和局部搜索能力，但在高维时它的性态和柯西变异算子基本一样，这些结果为设计和使用变异算子提供了指导和启发。     

进化设计思维与进化设计系统

结合思维的瞬间达尔文进行化机制和遗传程序设计的思想,阐述了设计思维的进化过程,在此基础上,提出了进化设计系统的结构,并对其特征和构在键进行了分析,设计是复杂而富创造性的活动,是演化方法和逻辑推理的结合,一方面体现出设计思维的诸多特征;另一方面为形象思维和创造性思维的计算机实现提供了一定程度上的可能性,拓展了设计方法学和设计自动化的研究思路。     

从进化论的进化到科学的进化

进化论是生物科学的核心理论,它历经拉马克、达尔文、魏斯曼、现代综合进化论者及中性论者等无数人的努力,已经取得了巨大成就,从它的发展中可以看出进化论也经历了一个进化过程,进化思想的意义是可以向不同方向延伸的。科学的发展也经历了一个类似生物进化的过程,它具有渐进性和连续性、复杂性和综合性、曲折性和斗争性、有机性和无穷性四个方面的特征。     

进化计算的创发性模型

提出了一种新的进化计算创发性模型，该模型以２维个体空间形式和混沌动力学机制有机地构造了进化计算的自适应过程，并有丰富的非线性特性和较强的创发计算能力。该模型和相应计算方法有助于复杂系统的自适应建模和线性信号处理。     

从进化论的进化到科学的进化

进化论是生物科学的核心理论,它历经拉马克、达尔文、魏斯曼、现代综合进化论者及中性论者等无数人的努力,已经取得了巨大成就,从它的发展中可以看出进化论也经历了一个进化过程,进化思想的意义是可以向不同方向延伸的.科学的发展也经历了一个类似生物进化的过程,它具有渐进性和连续性、复杂性和综合性、曲折性和斗争性、有机性和无穷性四个方面的特征.     

细菌水平基因转移所面临的现实与挑战

水平基因转移对细菌遗传物质进化的影响是存在争议的.本文着重从水平基因转移的进化思想和水平基因转移在进化方面的重要性,特别是在原核细胞进化方面作一综述.首先,阐述水平基因转移在细菌物种进化中的进程;其次,阐述水平基因在不同的进化阶段的范围或广度,此外,讨论重建（或改造）旧的系统发育树关系在面临水平基因转移的可行性;最后,讨论水平基因转移是如何适应新的达尔文进化论学说的,而且需要一种新的进化论去诠释细菌物种的进化机制,水平基因转移就是其中一个很重要的原因.     

语用模因现象溯源

模因论是一种基于达尔文进化论的观点解释文化进化规律的新理论,现被借用到语用学研究中,为揭示语言发展规律提供了全新的视角。语用模因现象有着悠久的历史渊源,研究者普遍认为,模因通过模仿而传播,是文化的基本单位,同时根据语用功能,研究者将模因分为强模因与弱模因、利模因与弊模因等类别。     

人类未来的进化问题

人类过去几百万年的进化史,已经充分说明人类作为生物的一分子,同样遵循达尔文的进化理论:物竞天择、适者生存。这种适应环境的自然选择进化在未来的人类进化中还会起作用吗?达尔文的进化理论是否适用于未来的人类?本文将通过详细的分析试图回答这个问题。现在的人类已经知晓设计人类自身生命的蓝图:DNA,并必然会在未来的几百万年中充分利用基因技术服务和改造人类自身,所以适应环境的自然选择进化还会在多大程度上影响人类的进化是一个值得研究的问题。本文中分析了自然进化和人为进化的区别,以及它们各自在人类未来进化中的作用,同时给出了一种未来文明分类标准,提出了智慧文明的局域同步发展说,用这样的学说可以解释为什么人类至今还没有发现外星人。     

动态环境下基于可变记忆的进化算法

常规基于记忆的进化算法在动态环境中往往达不到期望的效果,这主要是由于记忆体大小的限制.为此提出了动态环境下基于可变记忆的进化算法(IMEEA),其核心思想是算法中拥有两个种群,即搜索种群和记忆种群,同时采用过度变异策略来增加种群的多样性.算法中的两个种群有最小和最大的允许长度,并且种群的大小根据进化过程的进行而不断变化...