我国东部六个鸭儿芹群体遗传多样性的ISSR分析*

基于ISSR分子标记,对采自浙江磐安大盘山、临安清凉峰、临安昌化、金华北山双龙洞附近、金华北山朝真洞附近和上海奉贤(栽培)的六个鸭儿芹(Cryptotaenia japonica)群体的 70个个本进行了遗传多样性分析。从9条筛选出的ISSR引物共扩增出149条带,其中136 条具有多态性,多态性条带百分率为91.28%。基于ISSR标记计算了六个鸭儿芹群体的遗传多样性指数,发现它们的Nei 的基因多样性指数(H)为 0.1971,Shannon信息多态性指数(I)为0.3086,Nm指数为0.3343。六个群体遗传分化系数Nm为0.5993,表明59.93%的遗传分化存在于群体间,40.07%的遗传分化存在于群体内,群体群体间的基因流为0.3237,表明供鸭儿芹群体之间基因流较小,遗传漂变已造成鸭儿芹群体之间较强的遗传分化。基于136个位点,构建了反映各样本间遗传亲缘关系的系统聚类图,结果表明,从70个样本中可以区分出5个类群,其中金华北山采的两个群体为一个灰群,与地理位置有很强的对应性。因此,在今后的鸭儿芹引种栽培时,注意从不产地的鸭儿芹种源中进行引种,以丰富栽培种的遗传多样性。     

野生和栽培紫丁香种群遗传多样性的比较研究

采用ISSR分子标记技术,对采自阜新丁香岭、海棠山和朝阳云蒙山、石洞沟村的4个紫丁香野生种群和大连英歌石植物园的1个栽培种群的153个个体进行了遗传多样性分析和比较.11个ISSR引物从紫丁香基因组总DNA中共扩增出82条带.分析结果表明:在物种水平上,紫丁香种群的多态性条带百分率(PPB)、Nei's基因多样性指数(h)、Shannon信息指数(I)分别为95.12%、0.360 1、0.530 4,其遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)分别为0.137 6和3.133 2.在种群水平上,4个野生种群HTS、SDG、DXL、YMS的多态性条带百分率分别为86.59%、73.17%、78.05%、73.17%,而栽培种群YGS的多态性条带百分率为69.51%,野生种群比栽培种群表现出较高的遗传多样性.     

厦门近海横带髭鲷野生群体遗传结构分析

采用RAPD和ISSR分子标记技术对厦门近海横带髭鲷野生群体46个个体进行遗传多样性分析.在RAPD分析中筛选出31个随机引物,共扩增产生235个可统计的条带,其中多态性条带106个,多态位点百分率为45.11%,Shannon's遗传多样性指数为0.243 0;在ISSR分析中筛选出16个ISSR引物,共扩增产生119个可统计的条带,其中多态性条带76个,多态位点百分率为63.78%,Shannon's遗传多样性指数为0.348 9.与其它鱼类横向对比显示,厦门近海横带髭鲷野生群体的遗传变异处于中上水平,具有较高的遗传多样性.     

基于ISSR标记的5个南京椴种群的遗传多样性分析

采用ISSR标记技术分析了5个南京椴种群共147单株的遗传多样性。从55条简单重复序列引物中筛选出11条多态性引物,共扩增出80条带,其中76条多态性带,多态性比率为95.00%,平均每条引物可扩增出7.0条带。南京椴Shannon多样性指数变化范围为0.211 7~0.322 7,物种水平多样性为0.407 7;Nei基因多样性为0.140 5~0.211 9,物种水平为0.264 3;有效等位基因数的变异范围为1.240 3~1.356 6,物种水平的有效等位基因数为1.432 6。AMOVA遗传变异巢式方差分析结果表明种群间变异占总变异的34.99%,种群内个体间的变异占总变异的65.01%,约为群体间变异的2倍,说明南京椴群体内个体间的变异在其遗传变异中占主导地位。遗传变异分析表明：种群内和种群间的变异系数分别为0.257 1和0.176 0;物种水平的基因分化系数为0.315 4,种群间的基因流Nm为1.085 5。基于遗传相似系数的UPGMA聚类分析将5个种群明显聚为3支。     

紫茉莉不同花色植株遗传变异的ISSR分析

采用简单序列重复区间扩增ISSR分子标记技术对分布于四川省成都市的紫茉莉(Mirabilis jalapaL.)3种不同花色群体进行了遗传变异分析.从100条引物筛选出5条引物进行PCR扩增,共扩增出67条清晰条带,其中62条条带具多态性.紫茉莉的等位多态性位点百分数(PPB)为92.54%,观测等位基因数(Na)为1.9254,有效等位基因数(Ne)为1.2354,Nei的基因多样性指数(H)为0.1562,Shannon指数(I)为0.2633.3种花色的遗传一致度在0.9054~0.9620之间,遗传距离在0.0388~0.0994之间,其中白色与黄色的遗传距离最小(0.0388),表现出最近的亲缘关系,黄色与紫色的遗传距离稍大(0.0994),亲缘关系稍远.紫茉莉的遗传变异主要存在于群体内,不同花色群体间的基因流(Nm)为1.279.     

内蒙古西部地区砂珍棘豆(Oxytropis racemosa Turcz.)遗传多样性分析

用ISSR分子标记对内蒙古西部地区砂珍棘豆（Oxytropis racemosa Turcz．）3个不同生境的地理种群进行了种群遗传多样性分析．结果表明：砂珍棘豆种群具有较高的遗传多样性，14个ISSR引物扩增出284条带，Shannon多样性指数，一0．3630，Nei’s多样性指数H=0．2234，物种总基因多样性（HT）为0．2236，种群内基因多样性（Hs）为0．2085，大部分遗传变异（93．27％）存在于种群内，6．73％的遗传变异存在于种群间．遗传分化系数（Gst）为0．0673，基因流（Nm）为6．9318，说明种群间有很强的基因交流，遗传漂变不会引起遗传分化．UPGMA遗传距离聚类结果表明，3个地理种群中，乌审旗和伊金霍洛种群先聚在一起，然后与鄂托克种群聚在一起，遗传距离与地理距离相关，     

不同地区桐花树种群的分子遗传变异分析

利用RAPD和ISSR两种分子标记,对4个不同纬度桐花树种群的遗传多样性和遗传分化进行探讨,根据RAPD和ISSR数据计算遗传距离并进行聚类分析.结果表明,4个种群桐花树遗传变异性低,4个纬度桐花树种群分为南北两个类群,海南和广西为1个类群,广东和福建为1个类群.利用Shannon's指数计算4个种群的遗传多样性,广西种群多样性指数最高,福建种群最低.大部分的遗传变异存在于种群内(64%),小部分的遗传变异存在种群间(36%).本文同时探讨了种群遗传保护和引种策略.     

鱇浪白鱼野生与养殖群体遗传多样性的ISSR分析

采用ISSR(inter-simple sequence repeat)标记对鱇浪白鱼野生与养殖群体的遗传多样性和遗传结构进行分析.从40条引物中筛选出了13条用于扩增,共检测到97个位点,其中多态性位点72个.鱇浪白鱼野生群体的遗传多样性(PPB=62.89%;H=0.2490;I=0.3636)高于养殖群体的遗传多样性(PPB=58.76%;H=0.2267;I=0.3314).结果表明,鱇浪白鱼总体遗传多样性水平较高.基于Neis遗传多样性分析得出的野生与养殖群体间的遗传分化系数Gst=0.0826,分子变异分析(AMOVA)结果显示Fst=0.0796,2种方法揭示的鱇浪白鱼群体间的遗传分化的趋势基本一致,表明约8%遗传变异存在于群体间,遗传变异大多存在于群体内.UPMGA聚类树中,野生与养殖群体大多各自相聚,再相互混杂,群体间的基因流Nm(5.55)比较高,说明野生群体和养殖群体间有一定程度的遗传分化,但没有达到种群遗传分化的水平,在遗传上有一定的交流空间.     

基于AFLP分子标记探讨福建近海竹荚鱼群体遗传多样性

为研究福建近海竹荚鱼群体的遗传分化,对竹荚鱼闽东(30尾)和闽南(30尾)群体进行了扩增片段长度多态性(AFLP)分析,8对选择性引物在2个群体60个个体中,共扩增出433条条带,其中多态位点286个.闽东和闽南群体的多态位点比例分别为63.28%、61.89%,Nei遗传多样性指数分别为0.171 8、0.172 2,Shannon多样性指数分别为0.267 3、0.267 3.与其他鱼类对比显示,福建近海竹荚鱼群体的遗传多样性水平较高,说明其种质资源尚未遭到明显破坏;遗传分化系数(Gst)和分子生物学方差分析(AMOVA)均显示竹荚鱼的遗传变异主要来源于群体内,而群体间无明显的遗传分化.基因流(Nm)显示2个群体间基因交流频繁,无明显独立的遗传结构.群体的位点差异数分布和显性基因型频率分布显示2个群体有相似的群体遗传结构.结果表明,竹荚鱼闽东和闽南群体间无明显的遗传差异,可将福建近海的竹荚鱼划归同一个管理保护单元.近期扩张、较强的扩散能力和洋流可能是造成福建近海竹荚鱼群体间遗传同质性较高的原因.     

冶勒自然保护区垂枝香柏的ISSR遗传多样性研究

利用ISSR分子标记对冶勒自然保护区垂枝香柏（Sabina pingii（Cheng ex Ferré）的6个居群共65个个体进行了遗传多样性的比较分析. 10个引物共扩增出121个多态性位点,物种水平多态性位点百分率（PPB）为98.37%,居群水平的多态性位点百分率相对较低,在37.40%～51.22%间. 居群间遗传分化系数Gst为0.4959,即总遗传变异中有50.41%的变异发生在居群内,49.59%的变异发生在居群间,基因流Nm为0.5083. 居群间及居群内分化均较明显,可能是由于地理隔离     

分子标记在杨树育种上的应用

本文概述了分子标记在杨树指纹图谱构建、遗传图谱构建、QTLs定位、分子标记辅助选择、遗传多样性分析、杂种鉴定等方面的研究进展,同时指明了分子标记在林木研究上的发展趋势。     

上海市11种常规粳稻抗稻瘟病基因分子标记检测

利用分子标记检测技术,对9种参加2020年上海市水稻区域试验的品种和2种本课题组新培育的新品系的共10个抗稻瘟病基因位点进行了检测.结果显示,Pi37,Pi41,Pi-d23个基因在11种水稻中出现的频率达100％,Pi2,Pi5,Pi9,Pi36,Pikm和Pib抗性基因在11种水稻中出现的频率分别为18.18％,9...     

遗传多样性与植物的遗传标记

随着研究方法和实验技术不断的发展,植物遗传多样性的研究工作从形态学水平、细胞学 (染色体)水平、生化水平逐渐发展到了DNA分子水平．形态、细胞、生化及DNA等各水平的分析方法,为研究植物的遗传多样性提供了有效的工具．从以上几个方面介绍了植物遗传标记的发展和应用现状．     

DNA分子标记在猫科动物系统发生关系研究中的应用

DNA分子标记的广泛应用,使得系统进化、生物地理、群体遗传及人类学等领域的研究得到前所未有的发展.猫科动物分子系统发育关系的重建是目前猫科动物DNA研究的主要方向,进而可以从DNA分子水平上研究猫科动物的进化过程及系统发育关系的本质.本文对DNA分子标记在猫科动物分子系统学中的部分研究成果做了概括.     

基于EST-SSR分子标记的广西海伦兜兰遗传多样性研究

海伦兜兰（Paphiopedilum helenae）具有极高的观赏价值,为国家一级重点保护野生植物。本研究利用EST-SSR分子标记技术对广西海伦兜兰的5个居群（71个样品）的遗传多样性和遗传结构进行分析,旨在为该种质资源的有效保护与利用提供参考依据。结果表明：海伦兜兰具有中等遗传多样性,多态位点百分比（PPB）为90%-100%,期望杂合度（H_e）平均值为0.451,香农信息指数（I）平均值为0.801。海伦兜兰绝大多数（93%）遗传变异存在于居群内,仅有7%遗传变异存在于居群间,居群内的遗传变异大于居群间的变异,基因流（N_m）平均值为4.916。非加权组平均法（UPGMA）、主坐标分析（PCoA）和Structure分析结果表明,聚类并未严格按照地理位置划分,广西邦亮长臂猿国家级自然保护区靖西市（JX）和龙州县下冻镇春秀村（LZ）居群的遗传多样性较高,应作为海伦兜兰重点保护单元进行保护。     

分子标记技术在作物育种中的应用与展望

回顾分子标记的发展,介绍了一些有代表性的分子标记在生态学,聚类分析,品种差异性分析以及分子育种中等多方面的应用,并总结了它们的优缺点.随着深度测序技术的发展和多种序列信息库的完善,预测了未来分子标记的发展方向——功能性分子标记(Functional molecular marker),这种新型的分子标记技术利用了基因中的一些功能元件或者重要的单碱基多态性(SNP)位点,提高了在应用中的分辨率和灵敏度.     

菟丝子鉴定方法的研究进展

本文从形态标记、细胞标记、生化标记、分子标记等技术的研究状况方面；概述了菟丝子属近年来的研究进展；分析比较了各鉴定技术的特点；探讨了分子标记在菟丝子近缘种鉴定中的应用前景，并对菟丝子快速检疫鉴定技术作了展望。     

分子标记辅助选育香型软米水稻“上师大18号”

以香型软米水稻"青香软粳"作为软米基因供体亲本,以香型非软米水稻"光明粳2号"作为转育亲本,结合软米基因分子标记辅助筛选,成功培育出香型软米水稻"上师大18号"."上师大18号"水稻全生育期约148 d,早于"青香软粳"水稻约5 d."上师大18号"水稻主要农艺性状和产量性状都与"光明粳2号"接近."上师大18号"稻米直链淀粉质量分数为8. 2%,符合软米特征."上师大18号"水稻的成功选育有助于上海地区推广生育期相对较短的香型软米水稻.     

Mapping of two new brown planthopper resistance genes from wild rice

A brown planthopper (BPH) resistance line, B5, derived its resistance genes from the wild riceOryza officinalis Wall exwatt, was hybridized with Taichung Native 1, a cultivar highly susceptible to BPH. A mapping population composed of randomly selected 167 F₂ individuals was used for determining the BPH resistance genes by the restriction fragment length polymorphism analysis (RFLP). Bulked segregant analysis was conducted to identify RFLP makers linked to the BPH resistance genes in B5. The results indicated that the markers linked to BPH resistance are located at two genomic regions on the long arm of chromosome 3 and the short arm of chromosome 4, respectively. The existence of the two loci was further assessed by the quantitative trait locus (QTL) analysis. We located the two loci at a 3.2 cM interval between G1318 and R1925 on chromosome 3 and a 1.2 cM interval between C820 and S11182 on chromosome 4. Comparison with the BPH genes that have been reported indicated that the BPH resistance genes in B5 are novel. These two genes may be useful BPH resistance resource for rice breeding. Furthermore, the mapping of the two genes is useful for cloning the BPH resistance genes.     

St染色体组ISSR分子标记的建立和应用

以中国春(CS)、绵阳11(MY11)等小麦为对照,以拟鹅观草(Pseudoroegneria spicata)、中间偃麦草(Thinopyrum intermedium)、中国春茸毛偃麦草双二倍体(TE)为材料筛选100条ISSR引物,筛选到引物811能在拟鹅观草扩增出一条758 bp的特异DNA片段(GenBank登录号为EU368734),记为p811758.利用该引物对一系列含有St染色体组的二倍体或多倍体进行PCR扩增,结果显示含有St染色体的材料均可以扩增出p811758,小麦属的其他不含St染色体的物种不能扩增出p811758.以两套中国春-中间偃麦草二体附加系为材料进行初步染色体定位,结果表明所有材料均扩增出了这条特异带.进一步对中国春中间偃麦草后代进行扩增,结果表明p811758可以作为分子标记用来检测小麦背景中含St的染色质.