西南地区金荞麦（Fagopyrum dibotrys（D.Don）Hara） …

采用等位酶电泳技术研究了云南省和四川省西南共５个县境内金荞麦５个天然居群的遗传多样性,金荞麦居群内维持有较高的遗传多样性,多态位点比率为５６．７％,预期杂合度和观察杂合度分别为０．２２１和０．３６３。并对金荞麦与栽培荞麦之间遗传变异作了比较。     

基于ISSR西北地区珍珠猪毛菜(Salsola passerina)的遗传多样性(英文)

运片JSSR分子标记的方法,对分布于中国北方7个居群的137个珍珠猪毛菜个体筛选出了15条引物,产生了196条带,其中153条为多态性条带,总的基因多态率为78.06%,多态性在种群水平上较低,平均多态率为45.60%.平均期望杂合度和Shannon信息指数在种间水平上分别为0.1759和0.2811,在居群水平上为0.125l和0.1977,种群内个体间的遗传分化较大,为70.96%,而种群间遗传分化较小,为29.04%,种群间的遗传一致度平均为0.9320.AMOVA分析得到了相似结果.基于Nei's遗传距离的UPGMA聚类分析将7个居群分为3组:德令哈、兰州和其余5个居群(中宁,乌海,民勤,金塔和安西).Mantel检验表明遗传距离与垂直地理分布显著相关(P相似文献   

基于SNP分子标记的波叶杜鹃遗传特征分析

利用ddRAD-seq测序技术研究波叶杜鹃居群的遗传多样性与遗传结构，探讨种群演化历史，为其种质资源的保护利用和回归引种提供科学依据.研究结果表明，波叶杜鹃在居群水平上具有丰富的遗传多样性（He=0.226 7±0.002；π=0.241 0±0.003 2），居群间的遗传分化处于中等水平（FST=0.062 6）. AMOVA分析表明，总遗传变异中有98.42%的变异来自居群内，居群间的变异仅占1.58%.观测杂合度和期望杂合度分别为0.163 6±0.002和0.226 7±0.002，居群内近交系数（FIS）为0.222 0±0.022 2，所有居群均表现出杂合子缺失.聚类分析表明，6个居群可归类为2个类群，大多数个体（98.8%）谱系清晰.在近期的进化过程中，波叶杜鹃的有效种群大小（Ne）在持续下降，直到约1000年前.波叶杜鹃在物种和居群水平上，具有丰富的遗传多样性，进一步选择和育种利用的潜力较好.遗传分化水平中等，遗传变异主要来源于居群内.由于近期冰期气候环境的变化，再加上人为活动（发展旅游、基础设施建设等）导致波叶杜鹃的生存环境逐步恶化，使得该物种面临极高的灭绝风险.从对...     

西南地区金荞麦(Fagopyrum dibotrys(D.Don) Hara)居群的等位酶变异

采用等位酶电泳研究了云南省和四川省西南共五县境内金荞麦（Ｆａｇｏｐｙｒｕｍ ｄｉｂｏｔｒｙｓ（Ｄ．Ｄｏｎ）Ｈａｒａ）５个天然居群间的遗传分化,金荞麦居群间遗传分化程度较低,ＦＳＴ值为０．２２５,居群间遗传一致度和遗传距离的均值分别为０．９０５３和０．１００５,并提出了保护建议。     

3种药用枸杞过氧化物同工酶遗传多样性研究

利用垂直板式聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,检测了中国产枸杞属(Lycium Linn. )3个药用种(枸杞、宁夏枸杞、新疆枸杞)6个居群过氧化物酶,对酶谱进行了分析,计算出基因频率、多态位点比例(P)、各位点等位基因平均数(A)、期望杂合度(He)、固定指数(F)、遗传一致度(I)并进行了聚类分析和遗传多样性分析.结果表明:枸杞过氧化物同工酶谱带显示5个位点,每个位点平均等位基因数量为1.4,1.6,1.25;3种枸杞多态位点比例分别为60%,80%,60%;平均杂合度分别为0.572 8,0.324 9,0.259 4.枸杞和宁夏枸杞之间遗传一致度较低(0.571 8～0.598 8);宁夏枸杞和新疆枸杞、河北枸杞的遗传一致度却比较高(0.681 5～-0.819 7).3种枸杞居群遗传变异类型为HT=0.655 5,GST=0.317 8,即总的基因变异的31.78%来自于居群间,68.22%来自于居群内.     

紫斑百合居群生物学研究

应用居群生物学原理和方法,以分布于云南境内的紫斑百合(LiliumnepalenseD.Don)3个居群为研究对象,从形态性状、常规染色体以及ISSR位点3个层次展开研究,旨在阐明紫斑百合的遗传体制和遗传多样性.紫斑百合为广布种,从滇西北到滇南都有分布.其居群内存在巨大的遗传变异,个体杂合程度较高,适应力强.杂合有利性以及环境的异质性是造成居群内多态现象的重要原因.丰富的遗传多样性不仅为紫斑百合的自然选择进化提供了保证,还为开发利用这一野生花卉资源提供了基础信息.     

基于ISSR数据探讨节茎曲柄藓(Campylopus umbellatus(Arn.) Paris)遗传多样性和居群遗传结构

选用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)分子标记,对分布于浙江清凉峰国家级自然保护区顺溪坞和凉源、浙江台州临海天台山、浙江舟山嵊泗列岛、江苏苏州天平山、广西上思十万大山、台湾宜兰县马告生态公园和云南西双版纳纳板河流域国家自然保护区8个自然居群的40份节茎曲柄藓(Campylopus umbellatus(Arn.) Par.)的遗传多样性进行了研究.应用筛选出的12条引物,共扩增出172条清晰、重复性高的条带.使用POPGENE 3.2分析发现:其中158条条带的多态性位点百分率(PPB)为91.86%,根井正利基因多样性指数(H)为0.292 2,香农-维纳多样性指数(I)为0.445 9,说明节茎曲柄藓居群遗传多样性水平较高.8个居群的遗传分化系数(G_(st))为0.634 6,居群间的基因流(N_m)为0.287 9,63.33%的遗传变异存在于居群间,36.67%的遗传变异存在于居群内,说明节茎曲柄藓居群间的遗传分化明显.基于ISSR数据的聚类分析表明:以遗传距离65为分组阈值,8个居群可被分为6组,节茎曲柄藓居群间的遗传分化主要由地理因素造成,居群内的遗传分化可能与生境的异质性有关.     

濒危植物华山新麦草(Psathyrostachys huashanica)的遗传多样性及其保护

筛选的12条ISSR引物，对采集于陕西华山3个自然居群、20个亚居群的150个华山新麦草(Psathyrostachys huashanica Keng ex Guo)个体的遗传多样性进行了分析．发现华山新麦草样本ISSR产物的多态位点比率(P)为96．8％；每个位点的平均有效等位基因数(Ae)为1．411；居群的预期杂合度(He)为0．251，大于一般风媒异交植物的平均值0．148；居群的香农多样性指数(I)为0．391；这些结果表明华山新麦草在居群水平上有相对较高的遗传多样性．亚居群间的基因分化系数(GST)为0．304，表明大部分(约为70％)的遗传变异均存在于亚居群内．同时亚居群间具有一定频率的基因流，其遗传相似性也较高，变化范围为0．796～0．974(平均为0．903)．根据上述结果推断，华山新麦草的濒危不是因为遗传多样性稀有，而是由于它对特殊生态环境的要求影响了它的扩散而仅分布于华山这一狭小范围．因此，只要能够保证目前华山的生态环境不被进一步破坏，华山新麦草就能得到很好的保护而不会因种内遗传多样性降低而灭绝．     

开口箭种质资源的SSR遗传多样性分析

为了分析开口箭的遗传多样性和遗传分化,应用7对微卫星引物对15个产地72份开口箭样本以及4个弯蕊开口箭样本进行了遗传多样性和遗传分化分析,并对这些样本进行UPGMA聚类分析和主相关性分析。结果表明:开口箭15个居群的遗传多样性指数h的变化范围为0.082 1~0.303 5、Nei’s遗传杂合度HE的变化范围0.139 8~0.170 2,弯蕊开口箭4个居群的遗传多样性指数h的变化范围为0.162 9~0.369 1、Nei’s遗传杂合度HE的变化范围为0.112 4~0.128 1。7对SSR引物表现出了较高的多态性,可以区分19个居群的开口箭属植物样本;开口箭和弯蕊开口箭在物种水平上的遗传多样性高,遗传分化显著,聚类分析和主相关性结果表明地理位置相近的种群亲缘关系较为相近。     

狭边大叶藓(Rhodobryum ontariense)遗传多样性的ISSR分析

狭边大叶藓[Rhodobryum ontariense(Kindb.)Paris]为真藓科大叶藓属植物,具有治疗心血管疾病的功效。本研究选用ISSR分子标记对分布于河北、河南、四川和陕西四省的9个狭边大叶藓自然居群的遗传多样性进行研究,目的在于揭示狭边大叶藓居群的遗传结构和遗传多样性水平,为其保护和合理开发利用提供科学依据。用8个ISSR引物对9个居群共58个样品进行扩增,共获得47条清晰的扩增位点。POPGENE分析表明,狭边大叶藓居群遗传多样性水平较低(多态性位点比率为37.75%,Nei’s基因多样性为0.153 0,Shannon’信息指数为0.222 8,遗传分化指数Gst为0.299 7,居群间的基因流为1.168 2)。AMOVA分析表明,大多数遗传变异(84.07%)存在于居群内,15.93%的遗传变异存在于居群间(Φst=0.159 3)。UPGMA聚类分析表明,狭边大叶藓居群遗传距离和地理距离没有相关性(r=0.404 95,p=0.979 1)。     

西南地区硬枝野荞麦(Fagopyrum urophyllum(Bur.et Franch.) H. Gross)天然居群的等位酶变异

采用等位酶电泳技术研究了云南省中北部昆明、富民、宾川3县（市）及四川省西南布拖县境内的硬枝野荞麦（Fagopyrum urophyllum(Bur.et.Franch.)H.Gross）6个天然居群的遗传分化。硬枝野荞麦居群间遗传分化程度较低，Fst值为0.161，居群间遗传一致度（I)和遗传距离（D)的均值分别为0.927和0.0776，并提出了保护建议。     

基于CR及Cytb基因序列的大泷六线鱼野生群体遗传多样性分析

为进一步了解山东省内大泷六线鱼(Hexagrammos otakii)群体遗传背景和分化情况,合理保护与开发利用渔业资源,选取线粒体控制区(CR)和细胞色素b基因(Cytb)对分布于山东省近海沿岸的3个大泷六线鱼野生群体以及北黄海1个离岸大泷六线鱼野生群体的线粒体基因序列进行对比,分析它们的序列特征、遗传多样性和种群历史动态情况。经PCR扩增得到大泷六线鱼野生群体的CR和Cytb基因序列,全长分别为485bp和651bp。基于CR基因序列共检测到40个多态位点,单倍型多样性平均值为0.908,核苷酸多样性平均值为0.006,定义了53种单倍型。基于Cytb基因序列检测到56个多态位点,转换颠换比值为19.04,种内单倍型多样性平均值为0.934,核苷酸多样性平均值为0.005,定义了38种单倍型。对比分析表明,4个大泷六线鱼野生群体均具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性。NJ系统进化树、群体间/内平均遗传距离、Fst值、基因流及AMOVA分析结果显示:山东省内近海沿岸大泷六线鱼野生群体和北黄海离岸野生群体遗传差异不显著,群体间存在频繁的基因交流,未形成显著的遗传分化。种群动态结果表明大泷六线鱼于更新世晚期经历了快速扩张,并形成了现有遗传格局。山东省内近海沿岸大泷六线鱼野生群体和北黄海离岸野生群体遗传结构之间不存在显著的地理隔离,这可能与人为增殖放流和秋冬季节黄海沿岸流及暖流有关,从而使得群体之间基因交流广泛。     

Geographical genetic diversity and divergence of common wild rice （O. rufipogon Griff.） in China

Using 36 SSR markers and 889 accessions of common wild rice in China, the genetic diversity and the divergence among different geographical populations are investigated. Guangdong Province has the largest number of alleles, which account for 84% of the total alleles detected in the study, followed by Guangxi Province. The Nei＇s gene diversity indices, from high to low, are in the sequence of Hainan, Guangdong, Guangxi, Fujian, Hunan, Jiangxi, and Yunnan provinces. Two genetic diversity centers of Chinese common wild rice are detected on the basis of geographic analysis, i.e., the region covering Boluo, Zijin, Lufeng, Haifeng, Huidong and Huiyang counties of Guangdong Province and the region covering Yongning, Longan, Laibin and Guigang counties of Guangxi Province. The common wild rice in Yunnan, Hunan, Jiangxi, and Fujian provinces are diverged into respectively independent populations with relatively large genetic distances, whereas, those in Hainan, Guangdong and Guangxi provinces have relatively low genetic divergence. Under the condition of geographic separation, natural selection is considered as one of the primary forces contributing to the divergence of common wild rice in China.     

南京椴群体遗传多样性和遗传结构分析

【目的】 南京椴(Tilia miqueliana)为江苏省重要的乡土树种,野外资源稀缺。南京椴野外群体遗传多样性和遗传结构的探索,可为资源保护、品种选育及遗传改良提供依据。【方法】 以南京椴5个天然群体[江苏宝华山(P1)、牛首山(P2)、安徽皇藏峪(P3)、安徽蜀山(P4)和浙江天台山(P5)]93个体为实验材料,选用15对多态性EST-SSR引物,进行遗传多样性及群体遗传结构分析。【结果】 ①用15对引物共检测等位基因数(A)总和为96,平均值为6.4,四倍体基因型(G)和四倍体特异基因型(G_i)总和分别为441和251,特异基因型比率(R₁)和种质鉴别率(R₂)均值分别为45.73%和17.99%。②在5个群体中,每个位点等位基因数(A_loc)和四倍体基因型丰富度均值(G_loc)分别为5.50±2.43和9.41±4.29;平均观测杂合度(H_o)和平均期望杂合度(H_e)为0.61±1.43和0.62±0.14。参考各群体G_loc和H_e值,确定遗传多样性较高的群体为P1和P3。③群体间遗传分化较小,遗传分化系数(G_st)仅为0.030;AMOVA分子变异分析显示,群体多样性水平变异来自于群体内(96%)。④聚类和遗传结构Structure分析显示,5个群体可划分为2组(组1包括P1、P2和P5;组2包括P3和P4)。Mental检验结果表明遗传距离与地理距离之间无显著相关。【结论】 南京椴群体均具有丰富的遗传多样性,其中宝华山群体和皇藏峪群体多样性较高,群体扩张可能是以这两个种群为中心,经人类活动迁移至其他区域。但南京椴群体间未形成明显分化,主要是由于植株寿命长,群体缺乏自然更新,加之群体间存在人为种子传播。因此,本研究提出通过建立隔离区,明确优先保护群体、加大植株异交,并采用人工繁育及种质回迁的方式保护南京椴野外群体。     

The genetic diversity of Gaozhou wild rice analyzed by SSR

LOCATED AT 21°42′34″―22°18′48″N AND 110°36′48″― 111°22′45″E IN THE TRANSITION REGION FROM SOUTH SUB- TROPICS TO NORTH SUBTROPICS, GAOZHOU WILD RICE (GWR) IS COMMON WILD RICE (ORYZA RUFIPOGON GRIFF.) AND THE WIDEST WILD RICE POPULATION IN GUA     

基于遗传多样性和空间遗传结构的野生大豆居群采样策略

筛选了17对SSR引物对山东省垦利黄河口自然保护区野生大豆(G.sojaSieb.etZucc.)居群892份材料的遗传多样性及其随样本量变化而变化的规律进行了分析,同时以SSR的多态性为参照对该居群内的小尺度空间遗传结构进行了研究.发现该种群的平均每位点的等位基因数(A)为2.88,预期杂合度(He)为0.431,Shannon多样性指数(I)为0.699,多态位点比率(P)为100%.以计算机模拟方法随机抽取该居群不同个体组成的抽样样本,并计算各样本的多样性指数与样本量变化的回归关系,发现27~52个样本即可达到居群总体多样性水平的95%.通过空间自相关分析,得出该居群遗传结构的斑块大小约为18 m.该研究为野生大豆居群的合理取样提供了科学依据.     

鸡公山和桐柏山连翘遗传多样性分析

利用核基因片段,对鸡公山和桐柏山连翘野生种群20个个体进行了遗传多样性分析.核基因数据得到6个单倍型(A～F),单倍型多样,性指数为0.479±0.083,核酸多样性指数为0.001 47±0.000 37.桐柏山种群遗传多样性水平较高,为0.516±0.132,核酸多样性指数为0.00205±0.00067,鸡公山种...     

野生和人工选育黄河鲤遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术,对采集于长垣天然文岩渠(野生群体)、河南省水产科学研究院(黄河品系Ⅰ群体)、小浪底水库(野生群体)、河南黄河鲤鱼良种场(豫选黄河鲤群体)的4个群体黄河鲤的120个个体的遗传多样性进行了分析.8个ISSR引物共获得64个扩增位点,其中多态位点31个,多态位点比例为48.44%.4个群体的多态位点比例分别为14.06%,32.81%,34.38%和20.31%,遗传距离分别为0.0576、0.1657、0.1674和0.0800,Nei基因多样性分别为0.0538、0.1099、0.1308和0.0723,Shannon信息指数分别为0.0784、0.1669、0.1923和0.1072.文岩渠群体与黄河品系Ⅰ群体遗传距离最远(0.1717),与小浪底水库群体遗传距离最近(0.0558).表明这些群体间发生了较弱的遗传分化.UPGMA聚类结果为文岩渠群体与小浪底群体先聚在一起,其次是与豫选黄河鲤,最后与黄河鲤品系Ⅰ相聚.用AMOVA进行遗传变异方差分析得到遗传变异固定指数(Φst=0.0179,P0.05),显示黄河鲤大部分变异(98.21%)发生在群体内,群体间变异较小(1.79%).说明人工选育群体的遗传结构尚未发生明显变化.     

基于线粒体基因的云南省烟田烟蚜茧蜂的种群遗传多样性研究

选取了云南省11州市主要烟区的6个烟田种群、13个工厂繁育种群以及1个野生种群,基于线粒体atp6、cox1、cob和nad2 4个蛋白质编码基因开展了种群遗传多样性研究.解析云南省主要烟区烟田烟蚜茧蜂种群的遗传多样性特点,为烟蚜茧蜂的科学释放和蜂种复壮提供理论依据.结果发现,在105个个体中共检测到158个多态性位点和4种单倍型;20个种群中只有8个,具有遗传多样性,核苷酸多样性在0.000 46～0.008 08之间;除了保山的工厂繁育种群和普洱的野生种群与其他种群的遗传分化系数较大外,各地烟田和工厂繁育种群之间无明显分化.可见,云南省主要烟区烟田的烟蚜茧蜂种群遗传多样性较低,且与工厂繁育种群的遗传背景高度一致,在一定程度上说明了人工释放的烟蚜茧蜂能够在烟田有效定殖,但目前大规模繁育和释放的烟蚜茧蜂种群遗传多样性水平较低,可能存在种群衰退的风险,导致烟蚜茧蜂田间控害能力下降,应及时引入野生种群对工厂繁育种群进行合理复壮.     

西藏石榴野生群体的SSR遗传多样性分析

【目的】调查西藏地区野生石榴种质资源,分析西藏野生石榴群体的遗传多样性和遗传结构,为野生石榴资源的保护和利用提供理论依据。【方法】使用13对SSR引物对3个自然群体共42份西藏地区野生石榴种质资源材料DNA进行PCR扩增,毛细管电泳检测扩增片段长度,使用GenAlEx和Arlequin等软件对SSR数据进行分析。【结果】13对引物共检测到44个等位基因,平均3.385个,引物的平均有效等位基因数(N_e)、香农信息指数(I)、期望杂合度(H_e)和多态信息量(PIC)分别为1.971、0.771、0.481和0.393。3个野生群体的平均有效等位基因数(N_e)、平均香农信息指数(I)和平均期望杂合度(H_e)分别为1.867、0.646和0.421,林芝b(LZb)群体的遗传多样性水平高于其他2个群体。AMOVA分析表明,群体内遗传变异高达88.43%,3个群体间的遗传分化系数(F_st)为0.116。种质聚类分析将供试种质划分为3个亚群,结果与种质地理来源具有一定关联性。遗传结构分析显示西藏野生石榴有4个可能的基因库来源。【结论】13对SSR引物可用于西藏野生石榴种质的遗传多样性等研究。西藏野生石榴种质的遗传变异主要存在于群体内;林芝b(LZb)群体遗传多样性最高,遗传结构复杂,且含有最多的野生种质采样点,可予以优先保护。