酿酒酵母中一种新的反义snoRNA分子的鉴定

核仁小分子ＲＮＡ（ｓｎｏＲＮＡ）是一类在真核生物核糖体生物合成过程中起重要作用的小分子ＲＮＡ．通过计算机直接分析国际分子生物学数据库及ＲＮＡ杂交分析、ｃＤＮＡ序列测定等方法,在酿酒酵母（Ｓａｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）中发现和鉴定了１个新的ｓｎｏＲＮＡ－Ｚ６ｓｎｏＲＮＡ．该ｓｎｏＲＮＡ长１０９个核苷酸,由位于酿酒酵母第１３号染色体上的１个独立基因编码．Ｚ６ｓｎｏＲＮＡ含有ｂｏｘＣ（ＵＧＡＵＧＡ）、ｂｏｘＤ（ＣＵＧＡ）等保守的结构元素,属于反义ｓｎｏＲＮＡ家族,即分子中有１段１１个核苷酸的片段与２５ＳｒＲＮＡ中１段保守核心序列互补,该ｓｎｏＲＮＡ片段连同其下游的ｂｏｘＤ共同指导与其互补的ｒＲＮＡ序列第２１９５位胞苷酸的２’－氧－核糖的甲基化．     

C1 SnoRNA，水稻中一种新的核仁小分子RNA

通过计算机分析国际分子生物学数据库和ｃＤＮＡ序列分析等方法，在水稻（Ｏｒｙｚａｓａｔｉｖａ）中发现了一种新的核仁小分子ＲＮＡ：Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ．该ＲＮＡ具有ｂｏｘＣ，ｂｏｘＤ和末端碱基配对区等典型的核仁小分子ＲＮＡ结构特征；并有１４个核苷酸与水稻１８ｓｒＲＮＡ中一段保守序列互补．推测Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ可能在１８ｓｒＲＮＡ甲基化过程中起重要作用．编码Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ的基因位于水稻Ｈｓｐ７０基因的第一个内含子中．这是在水稻中发现的第一个由基因内含子编码的ＳｎｏＲＮＡ．     

粟酒裂殖酵母Z15 snoRNA的鉴定及结构与功能分析

运用计算机及实验的方法,在粟酒裂酵母（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ）中发现和鉴定了一个新的,结构特殊的ｓｎｏＲＮＡ－Ｚ１５。该ｓｎｏＲＮＡ由一个独立转录的基因编码,位于酵母２号染色体上,Ｚ１５长达９２个核苷酸,属于反义ｓｎｏＲＮＡ家族,它除了具有典型的ｂｏｘＣ／Ｄ结构元素和末端配对区外,还含有分别与酿酒酵母Ｚ１５和Ｚ２相同的两个反义序列,反映了粟酒裂残酵母Ｚ１５ｓｎｏＲＮＡ基     

ClSnoRNA,水稻中的一种新的核仁小分子RNA

通过计算机分析国际分子生物学数据库和ｃＤＮＡ序列分析等方法，在水稻中发现一种新的核仁小分子ＲＮＡ：ＣｌＳｎｏＲＮＡ。该ＲＮＡ具有ｂｏｘＣ，ｂｏｘＤ和末端碱基配对区等典型的核仁小分子ＲＮＡ结构特征；并有１４个核苷酸与水稻１８ｓｒＲＮＡ中一段保守序列互补。     

酵母snoRNA基因簇启动子的比较分析

报道对酿酒酵母ｓｎｏＲＮＡ基因簇启动子序列的研究结果．通过计算机分析,发现酿酒酵母中Ｚ２Ｚ８和ＳｎＲ１９０Ｕ１４ｓｎｏＲＮＡ基因簇有相似的启动子结构．这两个ｓｎｏＲＮＡ基因簇都是由一个上游的启动子负责整个基因簇的转录,产生多个顺反子ｓｎｏＲＮＡ的前体,然后再加工成熟为各个独立的ｓｎｏＲＮＡ．在启动子保守序列ＴＡＴＡｂｏｘ的上游还发现２个ＲＡＰ１序列,表明ｓｎｏＲＮＡ基因簇的表达可以通过ＲＡＰ１元素与核糖体蛋白基因的表达协同调控．这是在ｓｎｏＲＮＡ基因的启动子中首次发现ＲＡＰ１调控元素．对ｓｎｏＲＮＡ基因簇的进化特点也进行了讨论．     

拟南芥U59 snoRNA基因簇的结构与功能研究

在拟南芥（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ｔｈａｌｉａｎａ）中发现和鉴定了具有以义序列的ｓｎｏＲＮＡ组成的一个基因簇，该基因族由两个相同的ｓｎｏＲＮＡ基因组成。位于ｂｏｘＤ′上游的反义序列与人Ｕ５９ｓｎｏＲＮＡ的反义序列相同。因此命名为拟南芥Ｕ％９ａ和Ｕ５９ｂ。位于ｂｏｘＤ上游的反义序列在所有哺乳动物和酵母ｓｎｏＲＮＡ基因的反义序列中未找到同源拷贝，经低浓度的ｄＮＴＰ逆转录检验证实此反义序列并不指导拟南芥     

酵母snR72￣78snoRNA基因簇的研究

通过ＰＣＲ分析发现ｋｌｕｙｕｅｒｏｍｙｃｅｓ ｄｅｌｐｈｅｎｓｉｓ中存在与酿酒酵母相似的ｓｎＲ７２～７８ｓｏｎＲＮＡ基因簇。对该基因簇进行序列测定并与酿酒酵母比较分析,发现基因簇中各个ｓｎｏＲＮＡ编码区具有一定的保守性,但是基因间隔区却有完全不同的序列,这表明ＲＮａｓｅⅢ对ｓｎｏＲＮＡ前体加工的识别信号存在于各ｓｎｏＲＮＡ基因间隔的高级区的高级结构中。进一步对另外４种酵母进行ＰＣＲ分析,结果表明ｓ     

水稻花发育相关MADS-box基因的克隆

以水稻幼穗总ＲＮＡ为模板,利用３′－ＲＡＣＥ克隆了８个接近于全长的水稻ＭＡＤＳ－ｂｏｘ 基因的ｃＤＮＡ．在ＧｅｎＢａｎｋ 的数据库中查询表明,其中２个ＦＤＲＭＡＤＳ１,ＦＤＲＭＡＤＳ２分别与已报道的水稻ＭＡＤＳ－ｂｏｘ 基因Ｏｓ－ＭＡＤＳ５和ＯｓＭＡＤＳ４５有极高的同源性,另外６个为新的尚未见报道的水稻ＭＡＤＳ－ｂｏｘ 基因．系统进化树分析表明ＦＤＲＭＡＤＳ１,ＦＤＲＭＡＤＳ２和ＦＤＲＭＡＤＳ４可能与Ｃ组基因的功能相关;ＦＤＲＭＡＤＳ３,ＦＤＲＭＡＤＳ６和ＦＤＲ－ＭＡＤＳ７可能与Ａ 组基因的功能相关     

核仁小分子RNA基因的起源初探

通过分析、比较含ＢｏｘＣ／Ｄ和含ＢｏｘＨ／ＡＣＡ这两类ｓｎｏＲＮＡ的一些代表与几种剪接体ｓｎＲＮＡ的序列和二级结构特征，研究它们的进化关系，并探讨ｓｎｏＲＮＡ是起源于内含子还是后来才插入到内含子中这一与ｓｎｏＲＮＡ的起源密切相关的问题．结合对剪接体ｓｎＲＮＡ起源的有关研究，提出两类ｓｎｏＲＮＡ最初是起源于原始Ⅱ类内含子中的不同部分的观点．     

一种从基因数据库中识别反义snoRNA基因的新方法

报道一种从国际分子生物学数据库中识别反义ｓｎｏＲＮＡ基因的计算机新方法．介绍新方法的生物学原理及在反义ＳｎｏＲＮＡ新基因发现中的应用．     

水稻花发育相关MADS—box基因的克隆

以水稻幼穗总ＲＮＡ为模板,利用３’－ＲＡＣＥ克隆了８个接近于全长的水稻ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因ｃＤＮＡ。在ＧｅｎＢａｎｋ的数据库中查询表明,其中２个ＦＤＲＭＡＤＳ１,ＦＤＲＭＡＤ＃２分别与已报道的水稻ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因ＯＳＭＡＤＳ５和ＯｓＭＡＤ４５有极高的同源性。另外６个为新的未见报道的的水稻ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因。     

哺乳动物核仁蛋白基因编码多个内含子snoRNA

核仁小分子ＲＮＡ（ｓｎｏＲＮＡ）是真核生物核糖体合成中一类重要的调控分子,广泛地存在于酵母和哺乳动物中．ｓｎｏＲＮＡ基因组织具有高度的多样性．在哺乳动物中,除Ｕ３、Ｕ８、Ｕ１３和７－２／ＭＲＰＲＮＡ是独立转录之外,其它ｓｎｏＲＮＡ都是由宿主基因（ｈｏｓｔｇｅｎｅ）内含子编码的［１］．目前已发现多种类型的宿主基因如核糖体蛋白基因,热激蛋白基因（ｈｓｃ７０）,细胞周期调控蛋白基因（ＲＣＣ１）以及一些转录和翻译起始因子基因等．本文报道通过对人、小白鼠（Ｍｕｓｍｕｓｃｕｌｕｓ）和大鼠（Ｒａｔｔｕｓｎｏｒ…     

线粒体DNA在龟鳖目中的进化速率与古生物分化事件

基于龟鳖目的化石资料与线粒体ＤＮＡ序列数据的综合分析，估测了龟鳖类线粒体ＤＮＡ的进化速率，并采用相对速率ｓｗｃｗｉｆ （ｒｅｌａｔｉｖｅｒａｔｅｔｅｓｔ）分析了研究基因（１２ＳｒＲＮＡ和细色素ｂ）的进化速率的稳定性；结果显示，１２ＳｒＲＮＡ基因的进化速率在不同谱系中近乎恒定，而细胞色素ｂ基因的进化速率测未能通过相对速率检验。根据１２ＳｒＲＮＡ基因的颠换进化速率，分别用内推法和外推法推测曲颈龟亚目和     

FD—TRT耐热逆转录酶的特性分析

从嗜热细菌ＦＤ３００９中克隆并分离纯化得到的耐热逆转录酶,逆转录反应在６５℃高温下进行,可克服常温逆转录酶的许多缺点,以酵母核糖体ｒＲＮＡ为模板,以与２５Ｓ和１８ＳｒＲＮＡ匹配的寡聚脱氧核苷酸为引物探明了ＦＤ－ＴＲＴ的最适反应条件：２５ｍｍｏｌ／ＬＴｒｉｓ－ＨＣｌ,２５ｍｍｏｌ／Ｌ（ＮＨ４）２ＳＯ４,２ｍｍｏｌ／ＬＭｎＣｌ２,１００μｇ／ｍｌ明胶,５ｕｎｉｔ ＲＮａｓｉｎ ２５０ｍｍｏｌ／Ｌ４种ｄ     

水稻Hsp70基因第一个内含子中snoRNA基因簇的保守性及分布特点

对水稻、野生稻和茭白Ｈｓｐ７０基因第一个内含子进行ＰＣＲ分析及部分序列测定，分析结果表明植物Ｈｓｐ７０基因内含子编码多个ｓｎｏＲＮＡ的基因组织具有一定的保守性和分布范围，揭示了植物内含子编码的ｓｎｏＲＮＡ在进化过程中具有比脊椎动物和酵母更加丰富的多样性和移动性．     

电镜原位杂交对淡水三角头涡虫中期染色体RNA的研究

本文用ＲＮａｓｅ－ｇｏｌｄ标记法定位了淡水三角头涡虫中期染色体内ＲＮＡ，发现ＲＮＡ在染色单体切面内部及边缘均有分布。此外，以玉米１８ｓｒＲＮＡ的ｃＤＮＡ和水稻５ｓｒＲＮＡ的ＤＮＡ为探针，经电镜原位杂交后观察了涡虫１８ｓｒＲＮＡ（也包括４５ｓｐｒｅ－ｒＲＮＡ）及５ｓｒＲＮＡ在中期染色单体切面上的分布特点，证明涡虫染色单体边缘及内部ＲＮＡ的两个来源是核仁核糖体ＲＮＡ和核基质内的５ｓｒＲＮＡ。     

水稻Hsp70基因第一个内含子中snoRNA基因簇的保守性及分布 …

对水稻,野生稻和茭白Ｈｓｐ７０基因第一个内含子进行ＰＣＲ分析及部分序列测定,分析结果表明植物Ｈｓｐ７０基因内含子编码多个ｓｎｏＲＮＡ的基因组织具有一定的保守性和分布范围,揭示了植物内含子编码的ｓｎｏＲＮＡ在进化过程中具有比脊椎动物和酵母更加丰富的多样性和移动性。     

锥虫Ls—rRNA序列分析与锥虫rDNA探针群

用大分子ＲＮＡ快速测序法测定刚果锥虫（Ｔｒｙｐａｎｏｓｏｍａｃｏｎｇｏｌｅｎｓｅ）ＬｓｒＲＮＡ５′端６９４个核苷酸序列．比较分析揭示伊氏锥虫、布氏锥虫和刚果锥虫之间以及它们与其它鞭毛虫和哺乳动物宿主的分子差异；表明ＬｓｒＲＮＡ高变区可以作为一个灵敏的分子指标研究锥虫属内的系统进化关系；并为研制属、种不同专一性的锥虫ｒＤＮＡ探针奠定了基础．人工合成锥虫亚属ｒＤＮＡ探针Ｄ１ｔｅ与ＰＣＲ方法联用，可以检测相当于单个伊氏锥虫的微量ＤＮＡ．     

有效制备核糖核酸的方法研究

核糖核酸的制备和分析受多种因素的影响．因此，在特定条件下制备高纯度和完整性好的ＲＮＡ的方法研究至关重要．本文以大白鼠肝为材料，研究ＲＮＡ的制备方法，建立了有效的ＲＮＡ制备方法．用紫外分光光度计和变性电泳分析所制备的ＲＮＡ，发现其纯度Ａ２６０Ａ２８０＝１．７～２．０，２８ＳｒＲＮＡ与１８ＳｒＲＮＡ的带宽比为２１．本方法具有节约节时，重复性好，产量较高，无ＤＮＡ污染等优点．这为ｃＤＮＡ合成，基因表达和调控等研究奠定了基础．     

啤酒酵母菌株V25T线粒体15SrRNA基因的一级结构分析

报道啤酒酵母菌株Ｖ２５Ｔ线粒体１５ＳｒＲＮＡ基因全长１６５１ｂｐ核苷酸序列，并与已发表的啤酒酵母其他四株菌株的线粒体基因一级结构进行了比较。