六种蝗虫基因组DNA多态性的RAPD标记研究

运用随机扩增多态 DNA技术对斑翅蝗科 Oedipodidae中三属六种蝗虫基因组DNA进行了多态性比较 ,共扩增出 2 2条特异性片断 ,分子量大小为 650～ 1 990 bp之间 ,并根据各种间片段共享度构建了 UPG聚类关系图 .研究结果表明 ,大垫尖翅蝗和甘蒙尖翅蝗的片段共享度为 0 .375;红翅皱膝蝗和鼓翅皱膝蝗的片段共享度为 0 .2 86;亚洲小车蝗和黄胫小车蝗的片段共享度也为 0 .2 86     

基于rDNA部分序列的亚洲小车蝗遗传多样性分析

以核糖体DNA序列中一段基因为目的片段,对内蒙古地区15个地点的75个亚洲小车蝗样本进行了DNA序列的遗传多样性分析,通过与GenBank中已知蝗虫的核糖体DNA序列的对比、剪切得到288bp的目的片段序列.分析结果表明:在目的片段序列中共检测到19个变异位点,其中包括16个置换(11个颠换和5个转换)和3个碱基插入,占碱基总数的6.60%;目的序列显示出一定的GC偏好性.15个种群的FST在0.050 6~0.402 8之间,均值为0.149 5;基因流(Nm)在0.231 2~5.933 6之间,均值为1.988 0,表明15个小车蝗种群间存在遗传分化,基因交流处于中等水平.正镶白旗小车蝗种群的核苷酸多样性指数(Pi)和平均核苷酸差异数(K)在15个种群中最大,分别为0.028 0和8.000 0,表明正镶白旗种群相对于其他14个地理种群的种内变异度最高.在所测的75条序列中共有8种单倍型,其中正镶白旗和四子王旗小车蝗独享的两个单倍型与其他单倍型差异较大,表明正镶白旗和四子王旗的部分小车蝗个体的遗传变异度较大.Mantel检验表明,15个小车蝗种群的遗传距离与地理距离无显著的相关关系.     

贵州蝗总科5种蝗虫的核型

研究了贵州蝗总科(Acridoidca)的梭蝗(Tristriapisciforme),僧帽佛蝗(Phlaeobainfumata),花胫绿纹蝗(Alolopusthalassinustamulus),东方凸额蝗(Tranliaorientalisorientalis)和中华剑角蝗(中华蚱蜢)(Acridacinerea)等5种蝗虫的核型。结果显示:5种蝗虫的染色体数目均为2n(♂)=22 XO=23,全部是端部着丝粒染色体,核型公式:2n(♂)=2X=23t;NF=23;按相对长度都可分成L、M、S3组,梭蝗、僧帽佛蝗和花胫绿纹蝗为“4C“核型,东方凸额蝗和中华剑角蝗为“4B“核型。     

西安及附近地区农田索科Mermithidae线虫的种类及分布

据初步调查，西安及附近地区农田中有3目14种昆虫分别被索科Mermithidae的4种线虫寄生，这些寄主分别是直翅目的日本蚱Tetrix japonica(Bol.），长翅长背蚱Paratettic uvarovi Semenov，短额负蝗Atractomorpha sinensis Bol.,中华稻蝗Oxya chinensis (Thunberg），长翅素木蝗Shirakiacris shirakii(I.Bol.），黄胫小车蝗Oedaleus infernalis Saussure,疣蝗Trilophidia annulata (Thunberg），中华蚱蜢Acrida cinerea Thunberg，多伊棺头蟋Loxoblemmus doenitzi Stein，姬蟋Gryllus chinensis Weber；鳞翅目的小地老虎Agrotis ypsilon (Rottemberg）；同翅目的褐飞虱Nilaparvata lugens (Stal），白背飞属Sogatella furcifera (Horvath）和黑尾叶蝉Nephotettix cincticeps(Uhler)。寄生的索线虫分别是西安索线虫Mermis xianensis Xu et Bao，咸阳多索线虫Agamermis xianyangensis Xu et bao，地老虎六索线虫Hexamermis agerotis Wang et al和一种两索线虫Amphimermis sp.。这些索线虫对农田害虫有一定的自然控制作用。     

中国斑翅蝗科(直翅目:蝗总科)11属的系统发育关系支序分析

在比较形态学研究的基础上，本文选择了25个性状，利用Hennig86程序包，以支序分析探讨了中国斑翅蝗科11属昆虫间的系统发育关系，结果表明：斑翅蝗科11属昆虫可分为3支：由小车蝗属(11)与车蝗属(4)和飞蝗属(5)这一对姐妹群组成第1支，相互间关系不明确的尖翅蝗属(9)和绿纹蝗属(10)组成第2支，剩余的赤翅蝗属(12)、束颈蝗属(14)、疣蝗属(13)、异痴蝗属(6)、痴蝗属(7)及皱膝蝗属(8)6属构成第3支，其中痴蝗属与皱膝蝗属为1对姐妹群，它俩的最近共同祖先与异痴蝗属构成姐妹群关系，然后依次与疣蝗属、束颈蝗属、赤翅蝗属分别构成关系上渐远的单系群，它们的亲缘关系可表示为：((11(4，5))(9，10(12(14(13(6(7，8)))))))。     

台湾蝗虫物种多样性研究

为丰富台湾蝗虫研究资料,通过对采自台湾的1079头蝗虫标本进行整理、鉴定和统计,并计算Shannon Wiener多样性指数、Pielou均匀度指数及丰富度指数,从不同层次进行多样性分析。结果表明,台湾蝗虫共有4科、10亚科、17属,其中斑腿蝗科8属,斑翅蝗科6属,剑角蝗科2属,锥头蝗科1属。属级水平上,佛蝗的多样性(0.1357)、均匀度(0.1103)最高,小车蝗的多样性(0.0028)和均匀度(0.0023)最低;亚科水平上,飞蝗亚科多样性(0.1596)、均匀度(0.1297)最高;科级水平上,剑角蝗科的多样性(0.1398)最高,而斑腿蝗科的丰富度(1.7648)最高。综合分析表明斑腿蝗科的多样性最高。     

山西省雏蝗属部分种类的遗传关系分析

采用RAPD和SSRP-PCR技术分析雏蝗属(Chorth ippus F ieber)白纹雏蝗(C.a lbonem us Cheng et T u)、夏氏雏蝗(C.hsia i Cheng et T u)、小翅雏蝗(C.f a llax(Zub.))和北方雏蝗(C.hamm arstroem i(M ir.))的遗传关系,9条引物对98头个体产生131条清晰、稳定的谱带.Shannon信息指数表明,小翅雏蝗遗传多样性水平较高(0.2542),白纹雏蝗遗传多样性水平较低(0.1911).N e i's遗传距离显示,种群间遗传距离小于种间遗传距离.用N J法对N e i's遗传距离作聚类分析,构建分子系统树,结果显示:白纹雏蝗与夏氏雏蝗聚为一支,小翅雏蝗与北方雏蝗聚为一支,两支再相聚.聚类图所显示的种间亲缘关系的远近程度与形态分类学结果相一致,说明RAPD和SSRP-PCR技术在雏蝗属种间分子系统学研究中具有很好的适用性.     

日本囊对虾野生群体杂合性的研究

运用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术研究了日本囊对虾9个野生群体10种等位酶的杂合子缺失及过量状况.在所研究的22个位点中有5个位点(Sod-1、Est-1、Est-2、Amy-3、Mdh-1)是多态位点.汕头群体的Est-2,北海群体的Mdh-1和Sod-1,湄洲群体的Mdh-1,连江群体的Sod-1和漳浦群体的Mdh-1位点符合H-W平衡标准(P＞0.05);其余的多态位点均显著或极其显著地偏离H-W平衡标准(0.01＜P＜0.05或P＜0.01).另外,日本囊对虾9个群体的Est-2位点均表现出杂合子缺失(F＞0);Amy-3和Est-1(除了泉州群体的Est-1)位点均表现出杂合子过量(F＜0).研究表明日本囊对虾野生资源杂合性状况较好.     

贵州蝗总科5种蝗虫的核型和C—带

研究了贵州斑腿蝗科(Catantopidae)的云贵希蝗(Shirakiacris yunkweiensis),中华越北蝗(Tonkinacris sinen-sis),中华板胸蝗(Spathosternum prasiniferum sinense)和网翅蝗科(Areypteridae)的青脊竹蝗(Ceracris nigricornis nig-ricornis)以及斑翅蝗科(O edipodidae)的疣蝗(Trilophida annulata)等5种蝗虫的核型和C—带。结果显示:5种蝗虫的染色体数目均为2n(♂)=22+x0=23,全部是端部着丝粒染色体;核型公式:2n(♂)=2x=23 t:NF=23;按相对长度,除中华越北蝗分为L、M两组外,其余4种都可分为L、M、S3组;都具着丝粒C—带,但端带和居间带不是每种每条染色体都有;异染色质总量是中华越北蝗的(27.48%)最多,青脊竹蝗的(19.13%)最少。     

山西三个地区短额负蝗的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对山西短额负蝗3个种群(繁峙、原平和太原)45个个体进行扩增，10条随机引物扩增共产生了125条带，多态性片段为121条，种间共有片段为5条．Nei’s基因多样性指数对RAPD数据的分析表明：种群间的遗传分化系数为0．2206，22．06％的遗传变异存在于种群间，用NJ法和UPGMA法对这三个种群的Nei’s遗传距离作聚类分析，结果显示：原平种群和繁峙种群遗传分化较小，太原种群与它们的遗传分化较大，由Nei’s遗传一致度和遗传距离可以看出，繁峙种群和原平种群的遗传距离最小为0．0852，它们与太原种群的遗传距离较远，结果表明短额负蝗不同种群的遗传分化程度与遗传距离和地理距离呈正相关。     

济南市郊直翅目群落（ORTHOPTERENCOMMUNITIES）的调查研究

作者依据环境湿度条件将济南市郊区分为干旱、中生偏干、中生偏湿及湿润四类生境，并对各类生境中直翅目群落进行系统的调查研究．结果表明：济南市郊不同类型生境中直翅目群落明显有利，干旱和中生偏干生境较湿润及中生偏湿生境的群落组成更为丰富。疣蝗Ｔｒｉｌｏｐｈｉｄｉａａｎｎｕｌａｔａ、黄胫小车蝗Ｏｅｄａｌｅｕｓｉｎｆｅｒｎａｌｉｓ、短星翅蝗Ｃａｌｌｉｐｔａｍｉｔｓａｂｂｒｅｖｉａｔｕｓ和蒙古束颈蝗Ｓｐｈｉｎｇｏｎｏｔｕｓｍｏｎｇｏｌｉｃｕｓ局限栖息于干旱生境，为该生境群落的特征种；中华稻蝗Ｏｘｙａ．ｃｈｉｎｅｎｓｉｓ、长翅稻蝗Ｏｖｅｌｏｘ小稻蝗Ｏｈｙｌａｉｎｔｒｉｃａｔａ、长翅素木蝗Ｓｈｉｒａｋｉａｃｒｉｓｓｈｉｒａｋｉｉ和大垫尖翅蝗Ｅｐａｃｒｏｍｉｕｓｃｏｅｒｕｌｉｐｅｓ局限生活于湿润生境，是该生境群落的特征种．短额负蝗Ａｔｒａｃｔｏｍｏｒｐｈａｓｉｎｅｎｉｓｉ、中华剑角蝗Ａｃｒｉｄａｃｉｎｅｒｅａ是典型广栖性种，中华稻蝗在低洼潮湿生境中优势明显，对这些种类有必要进一步深入研究．散生型东亚飞蝗Ｌｏｃｕｓｔａｍｉｇｒａｔｏｒｉａｍａｎｉｔｅｎｓｉｓ在调查区内时有所见，应引起足够重视．     

飞蝗五个自然种群的遗传分化研究

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术检测飞蝗Locusta migratoria（Linnaeus）2个亚种5个种群的遗传多样性，11个随机引物扩增共产生了163条带，其中多态性片段为156条．Shannon信息指数和Nei’S指数对RAPD数据的分析表明：东亚飞蝗Locusta migratoria manilensis（Meyen）不同种群存在较高的遗传多样性；同时，东亚飞蝗种群间出现一定程度的遗传分化，遗传分化系数分别为36．09％和33．85％．用UPGMA对Nei’S遗传距离作聚类分析，结果表明：东亚飞蝗不同种群的亲缘关系较近，而它们与亚洲飞蝗Locusta migratoria migratoria（Linnaeus）关系较远．由Nei’S遗传一致度和遗传距离可以看出，东亚飞蝗不同种群间的遗传距离均小于东亚飞蝗与亚洲飞蝗之间的遗传距离．由Mantel软件检验得出地理距离和遗传距离的相关性系数r〈0．7，表明这5个种群亲缘关系的远近与地理距离无相关性．同时，还结合等位酶种群遗传结构研究结果综合分析了上述东亚飞蝗4种群的遗传多样性及其分化，表明RAPD可检测出更高水平的遗传多样性．     

用45个SNP位点组合对国家啮齿类实验动物种子中心3个封闭群小鼠群体的遗传状况分析

摘要：目的 利用单核苷酸多态性位点对国家啮齿类实验动物种子中心3个封闭群小鼠群体进行群体遗传结构分析。方法 选取文献中45个SNP位点,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对来自国家啮齿类实验动物种子中心北京和上海分中心的ICR各1个群体,上海分中心的1个KM封闭群小鼠样本进行等位基因分型,分析群体遗传结构,并进行群体间遗传差异分析。结果 3个封闭群小鼠有效等位基因数(Ne)、观察杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、平均杂合度(Ha)、多态信息含量(PIC)、香隆信息指数等遗传参数各不相同。同一群体的结果与微卫星DNA和生化位点的结果相比,SNP检测的参数值较低。但将3个群体中单态的SNP位点去除后参数值有所上升,尤其香隆指数值与STR检测结果接近。结论 所选SNP位点可用于封闭群小鼠遗传质量检测,所检测的3个群体遗传多样性用杂合度评价为SKM >BICR >SICR。     

藏羚羊5个微卫星标记的多态性分析

藏羚羊是我国青藏高原的特有物种.为分析藏羚羊独特的遗传变异特征和核DNA遗传多样性,以5个微卫星标记对50只藏羚羊的等位基因多态性进行了研究.研究结果表明:5个微卫星标记共检测到92个等位基因,每个标记的平均等位基因数为18.4个(在16~23之间),平均有效等位基因数为11.1;5个微卫星标记的多态信息含量均在0.8573以上,为高度多态标记,其中L03标记的多态信息含量最高,达0.9372;各标记的观测杂合度在0.4898~0.9091之间,期望杂合度在0.8770~0.9504之间,平均期望杂合度为0.8990,属于高度杂合标记,遗传变异丰富.这些筛选出的多态性微卫星标记可应用于藏羚羊遗传多样性、遗传结构分析及遗传图谱的构建等工作.     

舟山附近海域3个大黄鱼养殖群体遗传多样性的微卫星分析

利用8个微卫星多态标记分析舟山附近海域3个大黄鱼养殖群体共90个体的遗传多样性。结果显示,8个微卫星位点共检测到等位基因64个,各位点等位基因数(A)范围为5~10个,观测杂合度(Ho)的平均值为0.9111,期望杂合度(He)的平均值为0.8108,多态信息含量(PIC)平均值为0.7800,表明所选择的8个微卫星位点均表现出较高的多态性。群体的遗传多样性分析结果显示,3个群体的平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.891 7、0.900 0、0.941 7和0.738 4、0.743 2、0.821 3,Shannon多样性指数分别为1.467 0、1.449 0、1.800 9,表明3个群体的遗传多样性处于较高水平。HardyWeinberg平衡检验发现只有LYC0015和LYC0009位点处于平衡状态(PHW0.05),其余6个位点都不同程度地偏离了平衡。3个群体的聚类分析表明,岱山和朱家尖西岙网箱2个养殖群体亲缘关系较近,而与舟山市水产所耐低温F2代群体亲缘关系较远。     

东亚飞蝗消化系统蛋白质组双向电泳的分析

为了优化东亚飞蝗消化系统双向电泳技术,建立东亚飞蝗消化系统蛋白表达图谱,探讨雌、雄东亚飞蝗消化系统蛋白组分的差异,利用pH值为3~10和pH值为4~7的胶条分别对雌、雄东亚飞蝗消化系统进行双向电泳分析,进行蛋白组学分析.研究结果发现:雌性东亚飞蝗消化系统蛋白种类多于雄性,雌性东亚飞蝗消化系统特异蛋白中偏酸性蛋白数量与偏碱性蛋白相当,而雄性东亚飞蝗消化系统特异蛋白中酸性蛋白多于碱性蛋白.在雌、雄东亚飞蝗消化系统相匹配蛋白中,含量差异达3倍以上的蛋白约占总匹配蛋白的50;.可见,雌、雄东亚飞蝗消化系统蛋白组分存在差异.     

MHC polymorphism pre-dating speciation

Two features distinguish the polymorphism of the major histocompatibility complex (MHC) loci from that of other loci: its high diversity and the large genetic distance between MHC alleles. More than 100 alleles exist in natural populations in the mouse at each of the functional class I and class II alleles, all alleles occurring at frequencies that cannot be explained by recurrent mutations. Some of the alleles differ by approximately 70 nucleotides in the coding region alone and some of the products of the allelic genes differ by more than 50 amino acids. It has generally been assumed that these differences accumulated after species inception. Here, we present evidence for an alternative explanation of the origin of MHC polymorphism: a large part of the MHC polymorphism pre-dates speciation and is passed on from species to species. We describe allelic differences that must have arisen before the separation of mice and rats from a common ancestor more than 10 million years ago.     

应用微卫星标记对海南和广西恒河猴遗传多样性的研究

目的研究微卫星DNA多态性在海南和广西恒河猴遗传多样性中的应用。方法利用11个微卫星位点,对来自这两个地区的恒河猴进行了遗传检测,并通过POPGEN32软件计算各个微卫星座位的等位基因频率、有效等位基因数目(Ne)、多态信息含量(PIC)和遗传杂合度(H)。结果所选择的11个微卫星位点均存在高度的遗传多态性,H为0.6848~0.8785;PIC为0.5826~0.8345;Ne为3.0000~7.1553。以11个微卫星标记为测度,广西恒河猴的Ne、PIC和H的平均值均高于海南猴,分别为4.2583、0.7090、0.7706(广西恒河猴)和4.2054、0.7025、0.7656(海南恒河猴)。结论这种差别可能与地域来源有关。这些研究为微卫星标记分析恒河猴遗传多样性提供理论基础。     

Dynamics of disease resistance polymorphism at the Rpm1 locus of Arabidopsis.

The co-evolutionary 'arms race' is a widely accepted model for the evolution of host-pathogen interactions. This model predicts that variation for disease resistance will be transient, and that host populations generally will be monomorphic at disease-resistance (R-gene) loci. However, plant populations show considerable polymorphism at R-gene loci involved in pathogen recognition. Here we have tested the arms-race model in Arabidopsis thaliana by analysing sequences flanking Rpm1, a gene conferring the ability to recognize Pseudomonas pathogens carrying AvrRpm1 or AvrB. We reject the arms-race hypothesis: resistance and susceptibility alleles at this locus have co-existed for millions of years. To account for the age of alleles and the relative levels of polymorphism within allelic classes, we use coalescence theory to model the long-term accumulation of nucleotide polymorphism in the context of the short-term ecological dynamics of disease resistance. This analysis supports a 'trench warfare' hypothesis, in which advances and retreats of resistance-allele frequency maintain variation for disease resistance as a dynamic polymorphism.