一株产辅酶Q10的光合细菌菌株的分离及鉴定

从水塘污泥中富集分离到一株产CoQ10含量较高的光合细菌菌株,并对其进行系统鉴定.采用了丙酮作为CoQ10的提取溶剂,样品经超声波破碎后,用紫外分光光度法(UV)作为CoQ10的定性定量方法,成本低且快速,可以作为筛选CoQ10含量较高菌株的方法.以此方法筛选得到菌株LZC,其CoQ10产量为9.49μg/mL菌液.16S rDNA序列系统发育分析表明,菌株LZC在系统进化树上与GenBank中序列号为AB251407.1、AB251408.1、AB017799.1、DQ342322.1的红假单胞菌(红细菌)聚为一族,初步确定菌株LZC为生芽红假单胞菌(Rhodobacter blasticus).菌株LZC至少能稳定传代15次.     

高产5-氨基乙酰丙酸光合细菌株hemA基因的克隆与序列分析

对从不同生态环境中分离得到的20株光合细菌,进行5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)的产量检测,结果显示一株分离自广州市云溪公园池塘底泥的菌株R5,其5-ALA 产量最高,达4.92 mg/L.根据GenBank上公布的5-氨基乙酰丙酸合成酶hemA基因序列,设计引物进行hemA基因的克隆.结果表明,菌株R5的hemA基因序列长1 230 bp, 不含HindⅢ酶切位点,G C为64.68%,编码一个409个氨基酸的酶蛋白,分子质量为44.9 ku,与Rhodopseudomonas palustris KUGB306菌株的hemA基因序列相似性为98.6%,氨基酸序列相似性为100%.系统发生树显示,菌株R5与Rhodopseudomonas palustris处在一个分支,显示菌株R5可能是Rhodopseudomonas palustris,这与微生物鉴定实验的结果一致.本研究克隆的高产5-氨基乙酰丙酸菌株的hemA基因,为后期获取高产5-ALA的基因工程菌打下基础.     

一株富含类胡萝卜素光合细菌的分离鉴定

从不同生物环境中分离紫色非硫菌,测定其类胡萝卜素含量,筛选出富含类胡萝卜素的菌株.对该菌株的形态学特征、碳氮源利用情况、最适生长pH值及盐度等生物学特征进行研究;利用PCR技术扩增其16S rRNA基因,测序后进行16S rRNA基因序列分析,研究其分类地位.结果:分离自暨南大学明湖底泥的菌株R2,在所分离的8株紫色非硫菌中,类胡萝卜素质量分数最高,为4.83 mg/g(干菌体),该菌株符合红游动菌属(Rhodoplanes)的生物学特性,其最适生长pH为7.0,盐度为0.2%;16S rRNA基因的分子系统学分析表明,该菌株与红游动菌属的Rhodoplanessp.HA17相似性为99.4%.可确定筛选出一株高产类胡萝卜素的菌株,该菌株属于红游动菌属(Rhodoplanes).     

四川传统烟区烤烟叶面可培养细菌的遗传多样性分析

为认识烤烟(Flue-cured tobaccos)叶面可培养细菌的多样性,挖掘叶面可培养细菌资源.本研究以四川省各传统烟区旺长期烤烟叶片为材料,通过纯培养法及测定菌株的产吲哚乙酸(IAA)能力、溶磷溶钾特性、纤维素降解活性、拮抗病原菌等,并通过反转录重复因子扩增(BOXA1R-PCR)技术、16S rRNA基因测序和系统发育分析研究叶面可培养细菌的遗传多样性和功能特征.结果表明:分离得到的86株叶面细菌中有12株菌株(占总分离菌株的13.95%)具有产IAA的能力,4株产量较高(57μg/mL);有9株(占总分离菌株的10.47%)表现溶磷活性,8株(占总分离菌株的9.30%)表现溶钾活性.基于BOXA1R-PCR图谱选取12株代表菌株进行16S rRNA基因序列测定,系统发育分析显示,86株菌株分别属于节杆菌属(Arthrobacter)、短小芽孢杆菌属(Lysinibacillus)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)、无色杆菌属(Achromobacter)和假单胞菌属(Pseudomona),其中以假单胞菌属(Pseudomonas)为优势菌属.表明四川传统烟区烤烟叶面存在着丰富的细菌资源.     

陕西宁强铅锌尾矿中细菌的分离、鉴定及金属离子耐受性评价

对陕西宁强铅锌尾矿附近土壤中的细菌进行分离,研究铅锌尾矿附近细菌对重金属离子耐受性,为铅锌尾矿污染地区微生物资源的研究提供理论依据。采用稀释涂布法对细菌进行分离纯化,然后进行16S rRNA序列扩增与校准并构建系统发育树。选择4种金属离子(Pb~(2+),Cu~(2+),Hg~(2+),Zn~(2+))对菌株进行耐受性研究。结果表明:从尾矿土壤中共分离纯化出12株细菌,结合形态学与16S rRNA测序结果,所得菌株分属葡萄球菌属(Staphylococcus)、假单胞菌属(Pseudomonas)、土壤球菌属(Agrococcus)、芽孢杆菌属(Bacillus)和红球菌属(Rhodococcus)。其中有10株细菌表现出不同程度耐金属离子Pb~(2+),Cu~(2+),Hg~(2+),Zn~(2+)特性,占总检测菌株的83.33%。特别是L2,L6,L7,L8这4株细菌耐金属离子特性较高,占总检测菌株的33.33%。     

光合细菌分离鉴定及其对草鱼鱼苗养殖水质的影响

从养殖池塘底泥样品中分离纯化得到紫色非硫光合细菌1株,通过观察分离菌株的细胞形态结构和16SrDNA序列分析,鉴定该株光合细菌属于沼泽红假单胞菌(Rhodops eudomonaspalusteris).采用三级扩大培养法生产光合细菌,活菌数达3×10~9 cfu/mL.在草鱼鱼苗养殖池塘投加光合细菌,可维持池塘透明度,明显降低亚硝酸盐和氨氮含量.     

红树林土壤中脂肪酶产生菌的筛选及酶学性质

从福建龙海红树林区土壤中分离获得9株产脂肪酶的细菌,经16S rDNA序列分析表明分别属于红球菌属(Rhodococcus)、库克菌属(Kocuria)、假单胞菌属(Pseudomonas)、芽胞杆菌属(Bacillus)和微小杆菌属(Exiguobacteri-um).对9株细菌所产的脂肪酶进行酶学性质研究,结果显示这些酶的最适作用温度在25~35℃、最适作用pH值在8~10,其中L13菌株所产脂肪酶(L′13)具有适应温度和pH范围较广、对多种金属离子耐受性强、能有效降解不同底物等特点,在环境保护和工业生产方面具有良好的应用前景.     

紫色非硫光合细菌的分离鉴定及其功能研究

从河水、鱼塘底泥等样品中分离到28株紫色非硫光合细菌,分别对其进行鉴定和生理特性研究.结果表明,28株分离菌均属于红假单胞菌属,其中18株为沼泽红假单胞菌(Rps.palustris)、9株为胶质红假单胞菌(Rps.gelatinosa),1株为球形红假单胞菌(Rps.sphaeroides).通过对不同分离株的碳源利用能力、培养条件、脱氢酶活性以及去除养殖水体NH+2-N和COD能力的比较,结果显示不同菌株的生4-N、NO-理功能存在较大差异,大多数菌株体现了降解NO-4-N和COD的特征.在分离菌株中,2-N能力高于NH+H1、H10、F4和PSB-3最适生长pH6.5-8.5,温度30℃,净化水质能力较强;其中PSB-3与实验室已有的选育种—荚膜红假单胞菌(Rps.capsulata)PSB-2相似,能耐3%-5%盐浓度,淡水海水养殖均可适用.     

一株产天然蓝色素细菌的分离鉴定

为了分离鉴定一株产天然蓝色素的细菌,本文以表面消毒法从牛大力Millettia specisoa Champ植物根中分离可产天然蓝色素的细菌,以通用引物27F/1492R对目标细菌的16SrDNA序列进行PCR扩增、序列对比分析、构建系统发育树,同时对目标细菌进行形态学观察,并采用GEN III MicroStation微生物自动鉴定系统对目标细菌进行Biolog鉴定。序列比对结果表明,目标细菌与Pseudomonas aeruginosa相近,相似率为99%;系统发育树显示,其与菌株Pseudomonas aeruginosa在同一条分支上;形态学鉴定为杆状革兰氏阴性;Biolog鉴定目标细菌为铜绿假单胞菌Pseudomonas aeruginosa。综合形态学、分子、Biolog鉴定结果,鉴定该细菌为铜绿假单胞菌,命名为2016NX1。     

ACC脱氨酶活性细菌XG32的鉴定

采用生理生化、Biolog和16SrDNA序列同源性分析3种方法,对一株分离自植物根际的具ACC(1-aminocyclopropane-1-carboxylate,ACC)脱氨酶活性的细菌菌株XG32进行了鉴定,比较了3种方法在最后确定种属上的重要性.研究认为通过生理生化和16SrDNA序列同源性分析可将菌株XG32鉴定到种,确定该菌株为荧光假单胞菌生物型Ⅳ(Pseudomonas fluorescens biovar Ⅳ).     

利用5-氨基乙酰丙酸脱水酶缺失的重组大肠杆菌合成5-氨基乙酰丙酸

生物法合成5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)大多通过添加5-ALA脱水酶(ALAD)的抑制剂乙酰丙酸(LA)减少5-ALA的降解,造成生产成本增高,发酵工艺复杂.本文利用ALAD缺失的大肠杆菌ZSEc2作为出发菌株,通过紫外诱变的方法,获得可利用外源血红素恢复正常生长的大肠杆菌突变株ZGEc1,并过表达来自沼泽红假单胞菌的5-ALA合成酶(ALAS)基因,最终建立一条不需要添加ALAD抑制剂的5-ALA的生物合成新路线.经过培养基初步优化,重组菌可在胞外积累约1,g/L的5-ALA.     

Subcloning and Sequencing of the Form II Ribulose 1,5-Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase from Rhodopseudomonas palustris

0　IntroductionRibulose 1,5 bisphosphate (RuBP)carboxylase/oxygenase(RubisCO)isoneofkeyenzymesofthere ductive pentose phosphate pathway ,orCalvin Bassham Bensoncycle .RubisCOisabifunctionalen zymethatcatalyzesthefirststepinthecarbondioxideassimilatorypathwayandphotorespiratorypathwayinallphotosyntheticorganisms ,includingplants ,algae ,cyanobacteria ,andmostphotosyntheticbacteria[16 ] .Thus ,itispositionedtoregulatetheflowofcellcar bonthroughtwocompetingmetabolicpathways .Itisreportedtha…     

对虾池中紫色非硫细菌的分离及初步鉴定

利用特异性培养基对采自宁波地区虾池泥水样品进行富集、分离和纯化，得到了11株紫色非硫细菌（PNSB），依据形态特征观察、活细胞吸收光谱测定及碳源利用等实验，初步鉴定这些光合细菌分属于3个属中的4个种，即红假单胞菌属的沼泽红假单胞菌（Rhodopseudomonas palustris）、红细菌属的荚膜红细菌（Rhodobacter capsulatus）、类球红细菌（Rhodobacter sphaeroides）和红微菌属的万尼氏红微菌（Rhodomicrobium vannielii）．     

沼泽红假单孢菌的分离鉴定研究

N菌株是从太原杨家堡污水处理厂污泥中分离获得,纯培养物经形态学、细胞超微结构,生理生化、DNA G+C mol％含量等特征的分析鉴定,以伯杰系统细菌学手册第一版第三卷为根据,确定该菌株为沼泽红假单孢菌。并且根据紫色非硫细菌类群的特点,对其主要分类学特征进行了讨论。     

光合细菌红色类胡萝卜素的制取和研究

本文采用球形红假单胞茵(Rhodopseudomonas Sphaeroides)提取红色类胡萝卜素,作为综合利用这一新的食用天然色素资源.利用类胡萝卜素的有关性质,将光合细菌用有机溶剂抽提,然后再利用类胡萝卜素在碱性环境下的稳定性,用皂化法将其与叶绿素分离,再进一步提纯,可得光合细菌红色类胡萝卜素粗制品.     

红假单胞菌的分离及菌种保存试验研究

从不同来源的样品中分离出四株光合细菌 ,经鉴定均属于红假单胞菌 ,同时分别采用液体种自然条件下、液体种蜡封、穿刺物蜡封、砂土管等方法对其菌种进行了保存试验研究 ,最后得出两种最佳保存方法 :蜡封液体试管种法和试管穿刺蜡封法     

光合细菌的色素分析及蛋白质测定研究

光合细菌含有丰富的营养成分和生物活性物质,对其色素及蛋白质含量的分析,为其在食品领域应用奠定基础.研究采用平板画线法与液体培养法从某养殖池塘底泥中分离、纯化出5株光合细菌,进行了形态观察及菌种16S rDNA鉴定.采用Varian Cary 50紫外光谱分析仪进行色素分析与蛋白质的测定,并对类胡萝卜素稳定性进行了分析.结果表明分离纯化的光合细菌革兰氏反应为阴性,菌落为棕红色,光照厌氧和黑暗好氧条件下均可生长.16S rDNA基因的分子系统学分析表明,菌株与GenBank中的沼泽红假单胞菌菌株的同源性为99%,初步确定筛选出的菌株为沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris).菌株含有的色素主要是类胡萝卜素和细菌叶绿素a,类胡萝卜素在低温或低光照条件下,具有一定的稳定性,但在高温、加热时间过长或太阳光直射时色素迅速分解褪色.此外,菌株的蛋白质含量相对较高,是一种优质的蛋白源.光合细菌富含类胡萝卜素,并且可以作为一种高效的蛋白源,在食品及其他行业上的应用前景十分广阔.     

Bacteriophytochrome controls photosystem synthesis in anoxygenic bacteria

Plants use a set of light sensors to control their growth and development in response to changes in ambient light. In particular, phytochromes exert their regulatory activity by switching between a biologically inactive red-light-absorbing form (Pr) and an active far-red-light absorbing form (Pfr). Recently, biochemical and genetic studies have demonstrated the occurrence of phytochrome-like proteins in photosynthetic and non-photosynthetic bacteria--but little is known about their functions. Here we report the discovery of a bacteriophytochrome located downstream from the photosynthesis gene cluster in a Bradyrhizobium strain symbiont of Aeschynomene. The synthesis of the complete photosynthetic apparatus is totally under the control of this bacteriophytochrome. A similar behaviour is observed for the closely related species Rhodopseudomonas palustris, but not for the more distant anoxygenic photosynthetic bacteria of the genus Rhodobacter, Rubrivivax or Rhodospirillum. Unlike other (bacterio)phytochromes, the carboxy-terminal domain of this bacteriophytochrome contains no histidine kinase features. This suggests a light signalling pathway involving direct protein-protein interaction with no phosphorelay cascade. This specific mechanism of regulation may represent an important ecological adaptation to optimize the plant-bacteria interaction.     

A new class of homoserine lactone quorum-sensing signals

Quorum sensing is a term used to describe cell-to-cell communication that allows cell-density-dependent gene expression. Many bacteria use acyl-homoserine lactone (acyl-HSL) synthases to generate fatty acyl-HSL quorum-sensing signals, which function with signal receptors to control expression of specific genes. The fatty acyl group is derived from fatty acid biosynthesis and provides signal specificity, but the variety of signals is limited. Here we show that the photosynthetic bacterium Rhodopseudomonas palustris uses an acyl-HSL synthase to produce p-coumaroyl-HSL by using environmental p-coumaric acid rather than fatty acids from cellular pools. The bacterium has a signal receptor with homology to fatty acyl-HSL receptors that responds to p-coumaroyl-HSL to regulate global gene expression. We also found that p-coumaroyl-HSL is made by other bacteria including Bradyrhizobium sp. and Silicibacter pomeroyi. This discovery extends the range of possibilities for acyl-HSL quorum sensing and raises fundamental questions about quorum sensing within the context of environmental signalling.