基于SSR标记的丛生竹杂种鉴定、遗传分析和指纹图谱构建（英文）

【目的】准确鉴定丛生竹杂交种,分析杂种及其亲本的遗传关系,开发可以利用的指纹图谱。【方法】以孝顺竹(Bambusamultiplex)×麻竹(Dendrocalamuslatiflorus)、孝顺竹(B.multiplex)×粉单竹(B.chungii)两个杂交群体为材料,从已公布的竹子SSR引物中随机选取30对引物进行筛选、检测和分析。【结果】发现6对SSR引物(P8、P9、P18、P19、P20、P27)适于孝顺竹×麻竹组合的杂种鉴定和遗传分析,鉴定结果表明34个子代全部为真实杂种,杂种真实率为100%;另外6对SSR引物(P2、P9、P10、P11、P20、P28)则适于孝顺竹×粉单竹组合的杂种鉴定和遗传分析,鉴定结果表明59个子代中有54个真实杂种,杂种真实率为91.5%。孝顺竹×麻竹的杂种遗传了较多的母本位点,而孝顺竹×粉单竹的杂种则遗传了较多的父本位点。利用SSR引物扩增出的位点分别构建了两个杂交群体的指纹图谱,为品种保护提供了保障。【结论】SSR引物能有效地鉴定丛生竹杂交种的真伪,父母本的遗传位点在不同杂交组合的子代中遗传概率不同,杂交群体指纹图谱的构建可为品种保护提供保障。     

基于SSR标记的丛生竹杂种鉴定、遗传分析和指纹图谱构建

【目的】 准确鉴定丛生竹杂交种,分析杂种及其亲本的遗传关系,开发可以利用的指纹图谱。【方法】 以孝顺竹(Bambusa multiplex)×麻竹(Dendrocalamus latiflorus)、孝顺竹(B. multiplex)×粉单竹(B. chungii)两个杂交群体为材料,从已公布的竹子SSR引物中随机选取30对引物进行筛选、检测和分析。【结果】 发现6对SSR引物(P8、P9、P18、P19、P20、P27)适于孝顺竹×麻竹组合的杂种鉴定和遗传分析,鉴定结果表明34个子代全部为真实杂种,杂种真实率为100%;另外6对SSR引物(P2、P9、P10、P11、P20、P28)则适于孝顺竹×粉单竹组合的杂种鉴定和遗传分析,鉴定结果表明59个子代中有54个真实杂种,杂种真实率为91.5%。孝顺竹×麻竹的杂种遗传了较多的母本位点,而孝顺竹×粉单竹的杂种则遗传了较多的父本位点。利用SSR引物扩增出的位点分别构建了两个杂交群体的指纹图谱,为品种保护提供了保障。【结论】 SSR引物能有效地鉴定丛生竹杂交种的真伪,父母本的遗传位点在不同杂交组合的子代中遗传概率不同,杂交群体指纹图谱的构建可为品种保护提供保障。     

春小麦重组自交系及多种SSR标记构建遗传图谱

 以春小麦重组自交系(RIL)宁春4 号×宁春27 号为作图群体,利用SSR 标记构建小麦遗传连锁图谱。结果表明,用1001对SSR 引物选出亲本间表现多态性的引物307 对,多态性频率为30.7%。利用307 对多态性引物对RIL 群体进行分析,共检测到266 个多态性标记位点。通过χ²检测(P<0.05),有147 个SSR 标记表现为偏分离,偏分离率为55.3%,129 个偏向母本宁春4号,其偏分离位点主要分布在B 和D 基因组上。用Mapmaker 3.0 和Mapdraw 2.1 软件将266 个SSR 位点绘制在小麦遗传连锁图上,该图谱覆盖小麦基因组全长2187.79 cM,标记间的平均遗传距离为8.22 cM。     

杉木EST-SSR与基因组SSR引物开发

利用已经公布的杉木444条EST序列和未公布的杉木基因组文库中1 142条基因序列,进行引物开发效率的比较。去冗余后,利用MISA 搜索SSR 位点,分别得到109个和39个含有SSR的 位点。杉木EST序列中SSR分布密度为964.58个/Mbp,基因组中平均每Mbp出现1 037.24个SSR。在两个独立来源的数据库序列中,六核苷酸重复均为最多的重复类型,且AT-rich的重复类型占较大比例。AGC/CTG是杉木EST序列和基因组库中最多的三碱基重复,通过Primer 3.0分别设计出SSR引物95对和37对。为考察设计引物在杉木不同种源(群体)中的有效性,取12个种源(个体)的优良个体, 利用随机抽取的10个EST-SSR和8个gSSR(基因组SSR)进行引物筛选,结果表明:EST-SSR和gSSR各有4对引物在12个种源(个体)中表现出明显的多态性,多态率分别为40%和50%。8对多态性的SSR引物共扩增出 25 个多态性等位位点,平均每个引物产生 3.125 个多态性等位位点,平均有效的等位位点为2.399 5,PIC平均值为0.519 1; Hot平均为0.307 4。其中gSSR标记在检测群体间存在较大的分化,4个gSSR比4个EST-SSR扩增出更多的等位位点数、平均等位位点数,以及更大的PIC值。     

红花性状标记杂交棉新品种鲁05H9 SSR指纹图谱构建及应用

利用SSR分子标记技术对红花标记杂交棉新品种鲁05H9及其亲本材料进行多态性检测,从多态性高、重复性好的98对SSR核心引物中筛选出12对在双亲间具有多态性的引物、在F1中表现为杂合带的共显性标记。利用该12对引物构建了鲁05H9及其亲本的SSR指纹图谱。利用核心引物组合扩增的方法,可以鉴定鲁05H9的真实性和纯度,对于品种保护、纯度鉴定及杂交种推广具有极其重要的意义。     

贵州西山系列玉米杂交种SSR标记纯度鉴定的研究

以11个贵州西山系列玉米杂交种及相应的15个亲本自交系为材料,采用SSR（Simple Sequence Repeat）分子标记方法,从60对多态性高的引物中分别筛选了双亲互补型特异引物,并利用特异引物进行玉米杂交种纯度鉴定的检验．     

甘蓝型油菜青杂7号实验室快速纯度鉴定技术体系的建立

为了建立准确高效的青杂7号杂交种种子纯度鉴定方法,并促进青杂7号的推广。本研究选用青杂7号的恢复系、不育系及F1杂交种,利用60对SSR引物对其进行分析并利用大田制种群体对标记进行验证。同时对碱裂解DNA快速提取方法进行了优化。结果表明:得到的1对SSR共显性标记P49,该标记的鉴定结果与大田鉴定结果基本一致,但SSR标记检测方法比大田检测更快更准确;优化的DNA快速提取方法提取的DNA可以稳定扩增出清晰可见的条带,可以应用于鉴定油菜杂交种纯度,进一步加快了油菜杂交种纯度鉴定的速度。     

分子标记方法鉴定玉米杂交种哲单20纯度的研究

从30对SSR引物中筛选确定了能够清楚、稳定、准确的鉴别哲单20亲本和杂交种的一对引物phi029对杂交种哲单20进行纯度鉴定,结果与田间鉴定相差甚微,说明SSR技术检验玉米品种哲单20的纯度是可靠可行的.     

青海小海绵羊肚菌M12-10转录组SSR信息分析及其分子标记开发

为明确羊肚菌转录组SSR总体特征、开发出适用于分子育种的SSR引物,对分离自青海大通的小海绵羊肚菌M12-10菌丝体高通量转录组测序,采用MISA分析小海绵羊肚菌M12-10转录组SSR位点信息,利用Primer 3.0设计引物,并选择12对引物将19株不同种、不同采集地的野生羊肚菌进行聚类分析。结果表明:高通量测序组装得到153 326个转录本,100 672个SSR位点分布在20 043条Unigenes基因上;SSR发生频率为19.9%,单核苷酸(9 268,46.0%)和三核苷酸(5 183,25.0%)是主要的重复类型,优势重复基元为A/T(33.0%)、GA/AG(12.0%)和TGC/CAG(40.0%);基序长度集中在10～20bp的比例为73.9%,具有高多态性。基于SSR的20 043条Unigene成功设计了14 894对引物,随机筛选的12对SSR引物中4对引物表现稳定可重复的多态性;遗传相似系数为0.55时,19株羊肚菌菌株分为两类;相似系数为0.84时,19株羊肚菌全部分开。故基于小海绵羊肚菌M12-10转录组数据SSR标记开发是可行有效的,筛选的4对高频率、高多态性的SSR引物将有助于开展种质资源评价和遗传多样性分析。     

基于荧光SSR标记的紫薇遗传多样性分析

【目的】以收集的239份紫薇属(Lagerstroemia)种质和1份黄薇属(Heimia)种质为材料,开展种质种间特征分析和紫薇种内资源的遗传多样性分析,为进一步优化紫薇种质资源收集保存及合理利用提供科学依据。【方法】基于16对荧光引物鉴定样品基因型,利用GeneMarker软件进行基因型数据的读取;对239份紫薇属种质和1份黄薇属种质进行特征位点分析;并利用Popgene、Cervus、NTSYS和GenAlEx软件对227份紫薇种质进行遗传多样性参数估算、聚类分析和主成分分析。【结果】紫薇(L.indica)种内的特征位点信息最为丰富,其中15个引物所体现出的特征位点信息中,紫薇都有其独特的位点区别于其他6个种,而在福建紫薇(L.limii)、川黔紫薇(L.excelsa)和尾叶紫薇(L.caudata)中也有部分特异的特征位点是紫薇中没有的;16对紫薇SSR荧光引物共检测出143个等位基因,平均每个位点有8.938个等位基因,平均有效等位基因数(N_e)为3.600,Shannon’s信息指数(I)均值为1.459,观测杂合度(H_o)均...     

The relationship of differential expression of genes in GA biosynthesis and response pathways with heterosis of plant height in a wheat diallel cross

Heterosis in internode elongation and plant height is commonly observed in hybrid plants, but the molecular basis for the increased internode elongation in hybrids is unknown. In this study, midparent heterosis in plant height was determined in a wheat diallel cross involving 16 hybrids and 8 parents, and real-time PCR was used to analyze alterations in gene expression between hybrids and parents. Significant heterosis of plant height and the first internode in length were observed for all 16 hybrids, but the magnitude of heterosis was variable for different cross combinations. Analysis revealed that the heterosis of the first internode was significantly correlated to that of plant height （r = 0.56, P 〈 0.05）, suggesting that the increased elongation of the first internode is the major contributor to the heterosis in plant height. Real-time PCR analysis exhibited that significant difference in heterosis of gene ex- pression was observed among all cross combinations. Moreover, heterosis of the first internode in length was correlated significantly and positively with expression heterosis of KS, GA3ox2-1, GA20ox2, GA20ox1D, GA-MYB and GID1-1, but significantly and negatively with expression heterosis of GAI and GA2ox-1, which is consistent with our recently proposed model of GAs and heterosis in wheat plant height, suggesting the alteration of GA biosynthesis and response pathways might be responsible for the observed heterosis in plant height.     

小麦染色体2DS雌性育性位点遗传多态性分析

小麦雌性不育系XND126属于生态遗传型不育系.通过SSR分子标记分析,在2DS染色体上定位了一个雌性育性主效QTL位点.为了构建高密度遗传图谱并精细定位该主效位点,用2DS参考遗传图谱上的14对SSR标记,研究了59个育性正常的普通小麦品种与XND126的DNA多态性,筛选到不同生态型多态性较高的品种共12个,每个品种多态性标记达12~13个,这些品种可以用作杂交亲本,构建新的QTL精细定位群体.在品种组成的群体中,与主效基因位点最近的标记,表现出有较多的品种与雌性不育系具有差异.     

用流式细胞仪和RAPD快速鉴定柑橘体细胞杂种

利用流式细胞仪和随机扩增多态DNA（RAPD）方法对获得的3例柑橘体细胞杂种进行鉴定,结果表明,两者相结合可快速有效地鉴定体细胞杂种．所检测的3个组合共9株再生植株,有8株是四倍体体细胞杂种,1株为二倍体叶肉亲本型杂种．体细胞杂种一般表现为具有双亲的特征带,且综合双亲的所有带,但在部分杂种中检测到了双亲都没有的新带,也发现有丢失亲本的特征带或共有带的现象,说明融合后染色体发生了重组和交换;有的引物只检测到叶肉亲本的特征带,根据柑橘叶肉细胞无论单独培养还是共培养均不能再生的事实,可推测其为体细胞杂种或二倍体叶肉亲本型胞质杂种．对这两种方法相结合用于体细胞杂种鉴定的可行性进行了讨论．     

Molecular identification of asymmetric somatic hybrids between wheat and Italian ryegrass

Sexual incompatibility between common wheat and Italian ryegrass was an obstacle for transferring useful traits from italian ryegrass to wheat. In order to use those desirable genetic resources to improve wheat and to create new cytoplasmic germplasm, the protoplasts of wheat and Italian ryegrass were successfully electrofused and the somatic hybrid plants were regenerated. Examination with 6 restriction enzymes, 13 probes including 9 mtDNA probes (H454, Pst24, B30, Pro I, 490, B342, pHJ2-7-1, B376, 7), 3 cpDNA probes (pHvc p1, pHvc p5 and pHvc p8) and one nuclear DNA probe-- pTA71 (rDNA) in total 73 enzyme/ probe combinations revealed rich polymorphism between the fusion partners. RFLP analysis indicated that approximately 93.4% of the regenerated plants were true somatic hybrids. AFLP analysis implied that the somatic hybrids were highly asymmetric. The RFLP analysis using mt- and cpDNA specific probes also demonstrated the non-coexistence of mitochondria and chloroplasts from the fusion partners in the somatic hybrid cells.     

不同基因型小麦成熟胚盾片组织培养效果研究

不同基因型及其外植体的愈伤组织诱导和植株分化研究是建立高效植株再生和遗传转化系统的基本条件。文章首次以去胚的成熟胚盾片为外植体材料,对10个小麦基因型进行了离体操作。结果显示:愈伤组织诱导率平均可达96.5%,10个基因型的愈伤组织都能分化出绿苗,分化频率最高可达10.5%,没有白苗化现象;根的分化与绿点、绿苗的分化之间具有显著的相关性;鄂恩1号的植株再生能力显著优于其它基因型,其植株再生系统已具备了遗传转化的基本要求。     

Comparative Studies on the Molecular Genetic Diversities among Haliotis discus hannai,H.discus discus and Their Hybrids

0　IntroductionAsagroupofthemostimportantmarineunivalvegastropods ,thegenusabalonehasmorethan 1 0speciescultivatedintheworldnowadays .However,themajorityofspeciesgrowslowly ,challengingtheircultivation .Manystudies ,includingtriploidizationofH .discushan nai (Zhang ,1 998) ,gynogenesisofH .discushannai(Fujino ,1 990 )andgrowthhormonegenetransformationofH .rufescens (Power,1 996 ) ,werecarriedouttowardthedevelopmentoffastgrowingvarieties .Unfortunately ,theseapproacheshavenotbroughtprofoundc…     

黄瓜亲本间分子遗传距离与杂种优势的相关性

选用10个黄瓜亲本,通过RAPD分析计算其分子遗传距离,然后配制遗传距离大,中,小的杂交组合15个,田间测定它们的16个园艺性状,对所得园艺性状数据进行统计分析,并计算园艺性状与分子遗传距离间各种相关曲线的相关系数,结果发现,黄瓜园艺性状与分子遗传距离间的各种相关曲线中,以抛物线的相关系数最优,其中座瓜率,收获始期与分子遗传距离的抛物线相关系数存在着显著相关性。