定量构效关系研究进展及其应用

定量构效关系是目前国际上一个比较活跃的研究领域.本文简要介绍了定量构效关系的发展历史及定量构效关系研究中常用方法等,其中较为详细地介绍了三维定量构效关系中广泛应用的CoMFA方法.综述了定量构效关系在环境污染物分析以及在农药、医药设计中的应用,并对定量构效关系研究的发展趋势进行了展望.     

新型Atorvastatin类HMGR抑制剂的3D-QSAR和分子对接

羟甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是内源性胆固醇合成的重要催化限速酶,通过抑制HMGR的活性可以降低内源性胆固醇的合成.HMGR抑制剂(他汀类)是治疗心血管疾病的最佳药物之一.运用计算机辅助药物设计(CADD)方法,综合三维定量构效关系(3D-QSAR)和分子对接分析研究已合成的HMGR抑制剂的结构与抑制活性之间的关系.根据最优3D-QSAR模型,再结合分子对接分析,设计出新型活性高的HMGR抑制剂分子.     

单环β—内酰胺对大肠杆菌受体作用三维构效关系的比较分子力场分析（CoMFA）

模拟受体活性部位与配体分子间作用的势场模型,从三维空间进一步探讨单环β-内酰胺抗生素构效关系,指导新化合物设计与合成。我们根据活性类似物原理,采用比较分子力场分析（CoMFA）方法,对已知的26个单环β-内酰胺化合物对大肠杆菌作用的构效关系进行了研究。模拟了大肠杆菌青霉素结合蛋白（PBPs)与配体分子间的作用力场和静电力场模型。该模型有利于指导新型β-内酰胺抗生素me-too类药物的设计。     

拓扑指数法在QSPR研究中的应用

目前拓扑指数方法在定量构效关系(QSPR)研究中属活跃领域。简述了Wiener指数、Ran dic-Kier指数、Hosoya指数等拓扑指数,介绍了拓扑指数在定量构效关系研究、物化性质研究、药物设计研究、环境污染预测等方面的应用。表明拓扑指数法在QSPR研究中取得显著效果,具有良好的应用前景和实用价值。     

定量构效关系的原理、方法及其研究进展

介绍了定量构效关系(QSAR/QSPR)的原理、方法,综述了该领域的研究成果及其进展.重点论述了线性的启发式方法与径向基函数神经网络在定量构效关系研究中的应用,展望了该方法在各个学科的应用将会深入发展.     

多态生化和手性药物的研究

综述了我研究室近年来在多肽生化和手性药物领域中的研究进展：①进行了抗癌药物ＡＭＤ类似物的全新设计、化学全合成、与ＤＮＡ结合活性和构效关系研究;②研究了新皮啡肽类似物及其自旋标记衍生物和弧儿受体的天然配基弧啡肽的构效关系;③进行了ＤＮＡ结合蛋白结构域;锌指及其突变体的合成及与寡聚核苷酸结合能力的研究;④将稳定的氮氧自由基标记肽类药物血管紧张素Ⅱ,建立了一种使生物活性肽带上自旋标记的简便方法,用以研究     

一类双氯芬酸类似物环氧合酶抑制剂作用模式的理论研究

基于 1PXX 晶体结构以及以晶体中双氯芬酸 DIF701 为模版的双氯芬酸类似物2型环氧合酶(COX-2) 抑制剂的结构,利用药效团和自组织分子力场分析方法,探讨了 COX-2 与抑制剂的相互作用模式。建立了双氯芬酸药效团模型和 COX-2 抑制剂三维定量构效关系模型,并且两种方法所得的模型吻合;确定的 COX-2 与抑制剂的作用模式,可以指导抑制剂的设计,用于开发抗炎药物。     

拟除虫菊酯类农药中间体分配系数的测定

在研究生物活性物质的定量构效关系(QSAR)及进行农药、药物合成设计中,分系数起着重要作用.本文用分光光度法测定了十多种与拟除虫菊酯合成有关的中间体在正辛醇/水溶剂体系中的分配系数.     

姜黄素类化合物体外抗氧化作用及其构-效关系研究

本文以抗坏血酸为阳性对照药物,通过系列体外抗氧化模型,系统评价姜黄素及其结构类似物单脱甲氧基姜黄素(DMC)、双脱甲氧基姜黄素(BDMC)、二甲氧基姜黄素(BIMC)和双环戊二酮衍生物(CURC)的自由基清除及还原能力,在此基础上探索分析这类化合物抗氧化作用的构-效关系.结果表明,实验考察的姜黄素类似物具有不同程度的还原能力,并能剂量依赖地清除DPPH·、O_2~-·、·OH、ROO·和ABTS·~+自由基,酚羟基、苯环上的甲氧基以及庚二烯-3,5二酮长链共轭结构共同影响这类成分的抗氧化活性,且对不同抗氧化模型的影响存在差异.     

多肽生化和手性药物的研究

综述了我研究室近年来在多肽生化和手性药物领域中的研究进展：①进行了抗癌药物 Ａ Ｍ Ｄ 类似物的全新设计、化学全合成、与 Ｄ Ｎ Ａ 结合活性和构效关系研究； ②研究了新皮啡肽类似物及其自旋标记衍生物和孤儿受体的天然配基孤啡肽的构效关系；③进行了 Ｄ Ｎ Ａ 结合蛋白结构域：锌指及其突变体的合成及与寡聚核苷酸结合能力的研究； ④将稳定的氮氧自由基标记肽类药物血管紧张素Ⅱ，建立了一种使生物活性肽带上自旋标记的简便方法， 用以研究肽类药物与受体间的相互作用及自由基对肽类药物生理活性的影响；⑤为解决许多手性药物合成中的难题，开发了一个构筑手性季碳的新方法； ⑥研究了手性催化剂作用下二乙基锌对醛的不对称加成反应，为手性药物的研制提供了新反应     

药物分子设计与定量构效关系研究进展

介绍了药物分子设计与定量构效关系的发展概况与研究进展（２Ｄ－ＱＳＡＲ，３Ｄ－ＱＳＡＲ，ＭＤ－ＱＳＡＲ），为开发新药及化工、医药的发展提供了信息．     

平面四连杆机构轨迹问题的计算机辅助设计

本文以一个实现轨迹用的平面铰接四杆机构的设计为例,介绍计算机仿真在机构设计中的应用,阐明包括优化设计、计算机仿真以及图形输出等较为完善的机构计算机辅助设计方法。     

B样条曲面的机辅设计与数控加工

文章简要介绍了一个B样条曲面计算机辅助设计与三坐标数控铣削加工程序系统的设计基本思想和方法,分析闸述了在五坐标数控铣床上加工B样条曲面的原理和方法。     

偏转系统的计算机模拟与优化

在偏转系统的计算机辅助设计中应用商用电磁场计算软件ＥＭＡＳ与表面磁荷法相结合计算空间任意一点磁场、用龙格－库塔法计算电子轨迹、用局部优化法进行偏转系统优化的计算方法,该方法在多磁极偏转系统的计算机辅助设计中得到了良好的应用。     

蝶啶类PI3Kγ抑制剂的3D-QSAR研究

研究蝶啶类化合物对PI3Kγ抑制作用的三维定量构效关系。采用CoMFA(比较分子场)方法进行研究,建立CoMFA模型。交叉验证系数q2=0.727,相关系数r2=0.986,F=89.685,标准偏差SD=0.22。结论:蝶啶类PI3Kγ抑制剂CoMFA模型具有较好的预测能力;本实验研究的三维定量构效关系,对此类抑制剂的研制和开发起到重要作用。     

基于变量库的参数驱动新方法

对采用模板图的参数驱动程序中方程组伯解法进行探讨,提出基于变量库的顺序解法,在该方法应实际应用到工程图驱动的过程中,针对工程图中所遇到的问题,进行了分析讨论,并提出了应的解决方案,该方法已在夹具CAD系统中夹具零部件工程图的参数驱动,取得了良好效果。     

基于PRO/ENGINEER的WFCAD系统菜单的开发

运用Pro Engineer软件开发了WFCAD(WeldingFixturesandJigsComputerAidedDesign)系统的菜单 ,以第一、二类杠杆 铰链焊接工装夹具为设计对象 ,就如何采用Pro Engineer的用户化工具包Pro Toolkit的开发步骤和使用方法进行了介绍 ,实现了第一、二类杠杆 铰链焊接工装夹具的计算机辅助设计 .     

CoMFA,CoMSIA,HQSAR方法研究四氢异喹啉衍生物的定量构效关系

应用比较分子场分析法(CoMFA)、比较分子相似性指数法(CoMSIA)和伞息定量构效关系法(HQSAR)对21种四氢异喹啉类选择性雌激素受体调节剂进行了定量构效关系研究.分别考察了不同的叠合方法对场分析方法(CoMFA和CoMSIA)、不同场的组合方式对CoMSIA、不同的碎片参数对HQSAR模型构建的影响.根据CoMFA和CoMSIA模型的等值线图、HQSAR模型的原子贡献图,提出了改进四氢异喹啉类选择性雌激素受体调节剂选择性的方法,为合成新型药物分子提供理论支持.