荷花花瓣总RNA的提取方法

以荷花花瓣为材料,在比较CTAB-LiCl法和Trizol法的基础上,针对荷花花瓣富含多糖、多酚的特点,在RNA提取过程中加入去多糖步骤,改良了CTAB-LiCl法.结果表明,改良CTAB-LiCl法能有效地去除多糖,提取到的RNA 28 SrRNA亮度约为18SrRNA的二倍,A260/A280比值为1.98,A260/A230比值为2.36,RNA产率为685.3ng/μL,说明利用改良CTAB-LiCl法从荷花花瓣中提取的RNA质量好、产率高、完整性好.     

水稻颖果总RNA提取方法的研究

利用TRIZOL试剂快速提取法、异硫氰酸胍法和改良的SDS法提取不同发育时期水稻颖果的总RNA,并通过凝胶电泳、紫外分光光度法检测提取获得的RNA样品的品质.研究结果表明,改良的SDS法提取的RNA具有28SrRNA和18S rRNA 2条清晰的条带,且无降解.其D260/D280为1.84～1.97,具有较高的纯度.其他2种方法获得的RNA品质较差,有降解和弥散现象.将改良的SDS法提取的RNA逆转录成cDNA,作为PCR扩增的模板,可获得清晰的约1.7kb的目的条带.该法提取的RNA用于Northern杂交,可产生特异的杂交信号.这些结果进一步证明了改良的SDS法提取的RNA具有很高的品质与纯度,可以满足下一步分子生物学研究的需要.     

白芥叶片总RNA提取方法的比较研究

以白芥为材料,分别采用柱式植物总RNA抽提纯化试剂盒法、RNAisoPlus法和CTAB-异丙醇法3种方法提取白芥叶片总RNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计及RT-PCR反应进行检测,最后对3种方法得到的结果进行分析比较．结果表明,RNAisoPlus法提取出的总RNA条带与其他方法相比更为清晰,A260／A280比值介于1．9～2．1之间,该方法更适合用于白芥叶片总RNA的提取．     

白刺总RNA提取方法的研究

以不同西伯利亚白刺组织为材料 ,利用TRIZOL试剂快速提取法、异硫氰酸胍法、苯酚法和CTAB法提取白刺总RNA ,通过RNA的产率、纯度、电泳图谱等分析来确立适用于白刺总RNA分离的方法 研究结果表明 ,CTAB法提取的RNA具有 2 8SrRNA、 18SrRNA和 5SrRNA三条较清晰的条带 ,很少有降解 ,其A2 6 0 /A2 80为 1.893～ 1.90 1,A2 6 0 /A2 30为 1.80 7～ 2 .4 87 具有较高的纯度 其他三种方法获得的RNA纯度较低 ,降解严重 ,有较多小分子和盐存在 ,RNA无明显条带出现 ,而是以小分子RNA弥撒状分布 将CTAB法提取的RNA逆转录成cDNA ,使用随机引物进行PCR扩增 ,PCR条带清晰 ,分布均匀 ,背景小 该结果进一步证明了CTAB法提取的RNA具有很高的质量与纯度 ,可以满足下一步的研究     

枸杞果实总RNA提取方法的比较研究

以枸杞果实为植物材料,比较研究Trizol试剂快速提取法、异硫氰酸胍法、TransZol plant试剂盒法、CTAB法和改良CTAB法提取枸杞果实RNA的可行性.结果表明,改良CTAB法能有效地抑制酚类物质、多糖及皂苷等次级代谢产物对RNA的影响,可从枸杞果实获得质量高、完整性好的总RNA;RT-PCR分析显示提取的...     

红景天属植物叶片RNA高效提取的方法

为建立高效提取几种红景天属植物叶片RNA的方法,试验以采自西藏林芝色季拉山的大花红景天为材料,分析了CTAB法,Trizol法,SDS法,尿素法提取叶片RNA的可行性,并利用Nano Drop 1 000、RTPCR和q RT-PCR等手段分析了该方法获得RNA的质量.结果显示,SDS法和CTAB-异丙醇均可得到完整的RNA条带,但是相比于SDS法,后者所提取的RNA产率较高,质量完整,条带清晰.随后对9种不同产地,不同品种的红景天进行RNA的提取,并用Nano Drop 1 000、RT-PCR分析结果.结果显示,所提取RNA的浓度均在200 ng/μL之上,A260/A280均在2.0-2.2之间,A260/A230均大于1.8.此外利用q RT-PCR获得18S内参基因的标准曲线相关系数为0.983.因此证明所提取的RNA的纯度、完整性和产率较高,蛋白、多糖及多酚类物质去除干净.所以CTAB-异丙醇法可以适用于红景天属叶片RNA的提取,为红景天的分子生物学研究奠定了基础.     

萝卜叶片总RNA提取方法比较

获得高质量的RNA是进行RNA相关分子生物学实验和研究的前提.尽管目前已建立了多种真核生物总RNA的提取方法,但这些方法是否适用于提取萝卜(Raphanus sativus L.Var.radiculus Pers.)的总RNA还不清楚.本研究分别采用Trizol法、改进的异硫氰酸胍法和改进的SDS--酸酚法提取萝卜叶片总RNA,并通过分析所得RNA的电泳图谱、得率和纯度来判断这三种方法的优劣, 确定了提取满身红萝卜总RNA的最适方法.实验结果表明,Trizol法和改进SDS酸酚法提取的总RNA中蛋白质和DNA污染比较严重,不能用于下一步实验;而改进的异硫氰酸胍法提取的总RNA得率高、纯度高、完整性好、少降解,完全适合用于Northern blotting,小RNA分离、cDNA文库的构建等分子生物学实验.     

香花槐各组织总RNA提取方法的改良和优化

为探索香花槐各组织总RNA提取的最佳方法,以实验苗圃中的香花槐为实验材料,在比较了Trizol试剂法和常规CTAB法的基础上,建立了香花槐不同组织的最适提取方法.改良CTAB法利用高质量浓度的β-巯基乙醇和合适质量浓度的聚乙烯基吡咯烷酮(PVP)来防止RNA提取过程中多酚的氧化,然后增加苯酚/氯仿抽提次数来去除香花槐叶片和茎皮过多蛋白质.改良Trizol试剂法在根皮中加PVP研磨成白色粉末,可以有效地防止反应液褐化.各组织优化方法经琼脂糖凝胶电泳检测,所提取的总RNA的28S、18S条带清晰明亮,无降解;其A260nm/A280nm值为2.0,表明提取的总RNA质量较好.     

适用于转录组测序的大蒜花器官总RNA的提取方法

为获得高质量的大蒜花器官RNA以用于后续花发育相关基因的研究,以大蒜中多糖多酚含量高的鳞茎为初步实验材料,采用2种试剂盒方法、CTAB法、Trizol法以及改进酸性异硫氰酸胍法提取总RNA,并对提取效果进行比较,筛选出能够得到高质量RNA的天根试剂盒方法和改进酸性异硫氰酸胍法.将改进酸性异硫氰酸胍法进一步用于提取大蒜花器官总RNA,相较于试剂盒方法,获得了质量更好、收率更高的RNA.对提取的大蒜花器官RNA进行完全测序,得到的clean reads占总raw reads比例大于98%,能够满足转录组测序分析的要求.     

苔藓植物DNA不同提取方法的比较分析

以苔藓植物为材料,比较快速提取法、SDS法和改良CTAB法(自行设计)提取苔藓植物总DNA的效果.结果表明:改良CTAB法提取的基因组DNA质量最好(A260/A280为1.83～1.86;A260/A230为2.05～2.50),快速提取法次之(A260/A280为1.64～1.73;A260/A230为1.68～1.77),SDS法较差(A260/A280为1.51～1.61;A260/A230为1.56～1.76).改良CTAB法提取的苔藓植物的DNA适合于作为PCR的模板,并成功地进行了RAPD扩增.     

高质量冬青卫矛DNA提取方法

为了从富含多酚和多糖的冬青卫矛叶片中分离高质量基因组DNA,比较了SDS法、CTAB法、高盐低pH值法及改良的CTAB法等提取DNA的方法,获得了一种以CTAB法为基础的分离高质量完整DNA的简便、快速方法。结果表明,使用该方法从冬青卫矛叶片中分离得到高纯度、高产量的DNA,A260/A280为1.84,1 g鲜叶的DNA产量为213.5μg,表明该方法可有效地从富含多酚和多糖的药用植物组织中提取高质量DNA。     

克隆植物珠芽蓼基因组DNA的提取及RAPD鉴定

高原植物体内所含有的酚类、多糖、色素等次生代谢物质严重影响提取其基因组DNA的得率和纯度,是导致后续分子操作失败的主要原因.运用一种新改进的CTAB法对变色硅胶保存的高原植物珠芽蓼(Polygonumviviparum)叶片进行基因组DNA的提取,采取常温下沉淀DNA,增加洗涤沉淀的体积分数为70%乙醇用量和洗涤时间等措施,有效地去除了酚类、多糖、色素等物质的干扰,减少了褐化现象的发生.样品检测所得DNA片段均在48 kb左右,电泳谱带呈线状,无拖尾现象;紫外分光光度计检测,A260nm/A280nm值在1.7~1.9之间.RAPD扩增结果表明,此方法提取的DNA无论在质量和纯度上都较理想.     

扩展青霉碱性脂肪酶cDNA的克隆和表达

采用TRIzol试剂一步法所抽提的总RNA的D（260）／D（280）值为1.82,甲醛变性电泳呈现真核微生物所特有的28S rRNA和18S rRNA条带。根据扩展青霉所产碱性脂肪酶（Lip PE)N末端20个氨基酸残基序列和真核生物mRNA3‘端具有poly(A)等所提供的生物信息,采用RT－PCR技术和3‘－RACE法扩增了Lip PE成熟肽编码区和3‘非编码区的cDNA,直接将该PCR产物克隆至pUCm-T载体中。序列分析表明,该碱性脂肪酶含有258个氨基酸,其中保守的五肽序列为Gly-His-Ser-Leu-Gly。进一步采用Clot Tech公司的SMART^TM PCR cDNA文库构建试剂盒,扩增、克隆和测定了自转录起始点至编码区的cDNA片段,从而完成了Lip EP完整cDNA的分析测定。最后将编码完整脂肪酶蛋白的cDNA克隆至pGEX-5X-3表达载体中,在大肠杆菌BL21中进行IPTG诱导表达,SDS－PAGE检测结果表明,所表达的GST－Lip EP融合蛋白分子质量约为53ku;免疫印迹（Western Blotting)技术证明了所克隆的cDNA确为编码扩展青霉WMC20718脂肪酶的基因。     

皂土对RNA的有效分离和保护作用的初步研究

皂土-SDS RNA提取方法,是一种能广泛应用的RNA提取方法,能从富含多糖多酚的麻疯树,富含RNase 的动物肝脏,以及霉菌等多种RNA提取困难的动、植物与微生物材料中,成功提取出高质量的RNA,A260/A280在1.8以上．皂土对RNA酶具有高效吸附效应,与RNAsin比较,发现皂土抑制RNA酶强度比进口的同类产品更佳。同时,实验表明此皂土RNA酶抑制剂对RT-PCR等分子生物学后续实验的并无影响。结论：皂土成本低廉,可作为一种有效的RNA抑制剂.