前沿

我国发现DNA第7种碱基 我国科学家最新研究表明,除A、G、T、C4大碱基及2种与C相关的碱基修饰形式外,基因组DNA中还存在第7种碱基。     

前沿

<正>我国发现DNA第7种碱基我国科学家最新研究表明,除A、G、T、C4大碱基及2种与C相关的碱基修饰形式外,基因组DNA中还存在第7种碱基。中国科学院上海生物科学院生化与细胞研究所徐国良研究组及其合作方进行的此项研究     

DNA序列分类的统计分析

采用系统聚类分析方法，对巳知类别的20种DNA序列中4种碱基的含量及各碱基之间的相关性进行了统计分析，发现不同类别的DNA序列中减基的排列具有明显的规律性，由此建立了一种DNA序列分类的方法，并运用统计分析对这种分类方法的合理性给予了检验．     

新基因ZNF325在人类早期胚胎中的表达

锌指蛋白基因家族是人类最大的基因家族之一，目前已知的很多转录调控因子都是锌指蛋白成员^[1]。初步克隆了一个与RBAK基因有着高度同源性的人类C2H2型锌指蛋白新基因，经国际基因命名委员会批准命名为ZNF325，此基因位于染色体7p22，长2697个碱基，含5个外显子，在基因组DNA上长15kb。它编码的蛋白质全长462个氨基酸，含15个C2H2型的锌指。Northern Bolt分析表明该基因在人类早期胚胎的各个组织中普遍表达，在肺和脑中的表达水平最强，但在肝中的表达随着胚胎的发育而逐渐减少。它的结构和表达特征预示着它编码的是一个具DNA结合功能的转录调控因子。     

Ag-DNA的I-V特性及导电机理研究

在扫描隧道显微镜（STM）模式下观测了单根Ag-DNA的细部形貌,发现单根Ag-DNA出现解链并伴有部分碱基呈现混沌现象.测量了梳直在金薄膜电极表面的Ag-DNA及小牛胸腺DNA的电流-电压（I-V）特性曲线,结果表明Ag-DNA束的横向导电能力比纯DNA弱.     

一个人类锌指蛋白家族新基因ZFP28的克隆及表达

Krupple型锌指蛋白是一类具有重要功能的转录调节因子，初步克隆了一个新的人类krupple型锌指蛋白基因，经国际基因命我委员会批准命名为ZFP28。此基因长4076个碱基，含8个外显子，在基因组DNA上长18kb。它编码的蛋白质全长868个氨基酸，含1个信号肽，2个KRAB框和14个C2H2型的锌指。Northem Bolt分析表明该基因在人类早期胚胎的各个组织中普遍表达，在肺和肝中的表达水平最强，其结构和表达特征预示着它编码的是一个具DNA结合功能的转录调控因子。     

基因组翻译起始和终止区域碱基分布的信息熵分析

DNA编码区域起始和终止位置的预测是生物信息学中的一个重要问题,对翻译起始和终止区域的序列特性分析是其中的关键.针对基因组翻译起始和终止区域的碱基分布,如保守性、周期性等问题,提出了一种基于信息熵方法的模型进行分析.对编码起始、终止位点附近区域的信息熵分析结果显示:在原核生物中,其编码区域的信息剩余度呈现非常强的周期为...     

ENA抗体与体液免疫检验在SLE诊断中的应用价值

探讨EAN抗体、抗ds—DNA与体液免疫检测在系统性红斑狼疮（SLE）诊断中的应用．选取58例诊断明确的SLE患者为SI,E组,另取健康人群21例为对照组．清晨空腹采静脉血,用免疫斑点法检测EAN抗体及抗ds—DNA,用散射比浊法在IMMAGE特种蛋白分析仪检测IgG、IgA、IgM、C3、C4．结果显示：SLE患者血清中IgG、IgA水平分别为（21．61±3．79）g／L、（2．96±0．52）g／L,明显高于对照组;C3、C4水平分别为（0．66±0．23）g／L（0．16±0．05）g／L,明显低于对照组．SLE患者组中IgG、IgA、C3及C4阳性率分别为67．2％、51．7％、69．0％、65．5％,对照组阳性率低于5．0％．SI。E患者血清中多种自身抗体呈阳性,抗ds—DNA、抗Sm阳性率分别为37．9％、32．8％,但是对照组中未检出抗ds—DNA、抗Sm、抗nRNP、抗SSA、抗SSB、抗ScL-70、抗Jo-1．结果表明：联合检测ENA抗体、抗ds—DNA和体液免疫有助于指导临床疾病诊断及疗效评估．     

适配体与氧化石墨烯相互作用的原理及应用

适配体是一段由25～80个碱基构成的单链寡核苷酸片段,能够作为分子识别物质与蛋白、抗原、氨基酸等目标分子高亲和力和高特异性结合,具有很好的选择性,已广泛应用在生物传感领域。氧化石墨烯具有独特的光学、表面特性,因此在生物分析等领域具有较好的应用前景。在研究中成功发现氧化石墨烯能够猝灭荧光素的荧光,而加入DNA适配使得猝灭后的荧光强度得以部分恢复。基于此种现象,研究氧化石墨烯、DNA适配体、荧光素三者之间的相互作用,优化实验的条件,建立基于氧化石墨烯的免标记荧光定量检测DNA适配体的手段,有着比较好的效果。本论文为更深层次研究荧光适配体传感器提供了快捷简单的DNA适配体检测方法。     

基于中心法则探究碱基突变影响CTPS细胞蛇组装的综合实验

CTPS细胞蛇是一种无膜细胞器，在细胞中以丝状或环状形式存在．将含有RFP标记的CTPS过表达载体转入Hela细胞中，荧光显微镜下观察红色荧光蛋白形成的丝状或环状结构．通过定点突变关键氨基酸，观察CTPS细胞蛇组装的效果，帮助学生理解分子生物学“中心法则”中DNA碱基序列决定蛋白质一级结构进而决定蛋白质的高级结构，同时激发学生的学习兴趣，培养学生的科学思维，提高综合素质．     

信阳水牛促生长激素释放激素基因第4外显子的PCR扩增及变异检测

本研究以52头中国信阳水牛血样为材料,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-单链构象多态性技术(PCR-SSCP),对信阳水牛的生长素释放激素(GHRH)基因中第4外显子的突变情况进行检测。经SSCP检测发现,不同个体的PCR反应产物银染后有两种不同的带型,分别命名为AA型和AB型。针对不同带型所对应的个体PCR产物进行测序,结果表明,在该基因(GI:194719389)的第4外显子70bp处发现A→G突变,A→G导致Thr转化为Ala,在该基因的第4内含子6bp处发现A→C突变。     

萃取置换技术处理CLT酸废水

CLT酸（化学名称为6-氯-3-氨基甲苯-4-磺酸,分子式为C7H8CINO3S）属颜料中间体,主要用于制造金光红C、橡胶大红和塑料大红等色淀颜料。我国CLT酸的工业生产主要以甲苯为原料,经磺化、氯化、硝化、中和、还原、酸洗6个步骤生产,在合成CLT酸过程中,产生-种高色度、高c0D的有机废水。     

花粉管通道法转柱头外露棉DNA及转化体RAPD分析

提取“异9-3”柱头外露棉总基因组DNA，通过花粉管通道法经微量注射导入抗虫棉707．1的胚囊内，D1代田间筛选到柱头外露的转化植株，遗传分析结果表明转化株柱头外露性状由一对隐性基因控制，50个随机引物进行PCR扩增，33个引物扩增出的DNA在供体、受体和转化体之间呈现出多态性，其中引物S462(TCG GCA CGC A)在供体和转化体之间出现相同产物而受体没有出现扩增产物，该引物有可能作为柱头外露系的分子标记．RAPD分析结果表明转化体与受体有较多相同基因位点，而与供体相同基因位点较少，转化体还有供体和受体都不具有的基因位点，这可能是外源DNA导入时引起碱基突变所致。     

DNA分子中电子局域性质的温度效应

在有限温度下,通过考虑相邻DNA碱基之间的相对扭转角度对其平衡位置的偏离,借助负本征值理论、无限阶微扰理论及传输矩阵方法,研究了DNA分子的电子局域属性对温度的依赖关系.结果表明,电子的态密度、局域长度均存在强烈的温度效应.电子态密度分布随着温度的变化而变化,体现为态密度曲线中峰的高度消长和位置移动以及能隙的位置迁移和宽度增减.研究还发现存在一个临界温度Tc～250 K,当TTc时,局域长度随温度的升高反而增加,分析系统局域性质的这种奇特温度行为是源于该临界温度上下电子输运机理的不同.     

第三代测序细菌基因组DNA提取方法的比较

为筛选有效提取细菌菌株总DNA的方法,分别采用SDS法、CTAB-SDS法、试剂盒法和改良试剂盒法对苏云金芽胞杆菌、粘细菌和放线菌进行总DNA的提取、电泳检测、NanoDrop 2000测定、PCR扩增.对放线菌和苏云金芽胞杆菌,用改良试剂盒法所提取的总DNA纯度较高,电泳条带清晰,DNA主带位于23 kb,单位体积菌液所提取到的总DNA较SDS法和CTAB-SDS法高,能满足下游的PCR扩增等分子操作.对待测样品所做的质检报告也证实样品合格,可用于后续建库、测序.而粘细菌提取到的总DNA由于它们的OD260/230在2.0以下,没有达到第三代测序样品的要求.改良试剂盒法所提取到的总DNA大多数可以满足第三代测序技术样品制备的要求.     

氨基酸Schiff碱和羟肟酸混配的钒化合物[VO(C12H13NO3S)(C7H6NO2)]·H2O的合成与表征

合成了配合物[VO(C12H13NO3S)(C7H6NO2)]·H2O(C12H15NO3S=水杨醛缩甲硫氨基酸,C7H7NO2=苯甲酰羟肟酸),并对其进行了元素分析、IR、UV、CV和单晶X射线衍射实验.钒原子具有扭曲的八面体配位构型,三齿配体中的二个氧原子和一个氮原子以及羟肟酸的肟氧原子形成赤道平面,与钒酰键反位配置的是羟肟酸的羰基氧原子.配合物在CH2Cl2、CH3CN和DMF三种溶剂中有着不同的氧化还原行为.     

不同地理种群栗瘿蜂的mtDNA的16S rRNA基因部分序列及其系统进化关系分析

对福建福州、湖南怀化、河北保定、山东泰安、湖南浏阳、广西桂林6个不同地理种群栗瘿蜂的线粒体16S rRNA基因测序,并用Mega 4.0软件进行分析,结果表明:T、C、A、G碱基平均含量分别为42.6%、8.1%、41.5%、7.8%,(A+T)含量(84.1%)明显高于(C+G)含量(15.9%).这6个地理种群遗传距离平均值为0.398 0.保定、泰安、浏阳3个群体亲缘关系较近;而福州、怀化、桂林种群亲缘关系较近.     

绿豆子叶脱分化过程核酸代谢的研究

本文研究了绿豆(Phaseolus raditus L.cv.D317—1)子叶切段在激素诱导下脱分化过程中DNA和RNA代谢的变化。子叶切段在附加1ppm激动素(KT)和4PPm萘乙酸(NAA)的Miller培养基上表现出较高的脱分化能力。DNA含量和RNA含量在离体培养的前7天增加约2倍,随后DNA含量维持不变,而RNA含量仍缓慢增加;利用同位素掺入法测定的DNA和RNA合成速率,在培养早期迅速增加,第5天时分别增加了2倍和4倍,随后虽有所降低,但仍处于较高水平;DNase和RNase(pH4.5,pH7.5)活性在培养早期有所降低,随后不断增强。这些结果表明,绿豆子叶切段的脱分化过程伴随着DNA和RNA代谢的加强,特别是合成作用,这可能是子叶脱分化的主要代谢特征之一。     

文多灵与DNA相互作用的光谱研究

在pH为7．4的Tris—HCl缓冲溶液中，应用紫外光谱法和荧光光谱法对文多灵与鲱鱼精DNA分子间的相互作用进行了研究．研究结果表明，DNA与文多灵存在较强的相互作用，计算了25℃和40℃两个不同温度下文多灵与DNA的结合常数和结合位点数分别为5．26×10^3L／mol、1．0411和7．77×10^3L／mol、1．056．紫外光谱实验结果表明，DNA的加入可使文多灵252nm处的紫外吸收峰发生显著升高和蓝移；荧光探针实验表明文多灵不能使小檗碱-DNA体系的荧光发生猝灭，证明文多灵是以沟槽结合的方式与DNA结合．     

嵌入式实时操作系统μC/OS-在ARM上的移植应用

介绍一种源码公开的嵌入式实时操作系统μC/OS- 及其在ARM7微处理器上的移植过程,以ARM与计算机的串行通信为例,分析了在μC/OS- 基础上开发嵌入式应用程序的基本方法.