定量联结人抗凝血酶的变异及其临床表现

将蛋白质序列转换成数值数据后,建立一种描述性的概率方法分析单基因疾病的基因型与表型之间的关系.先用氨基酸分布概率定量变异的抗凝血酶Ⅲ,然后用交叉影响分析法联结人抗凝血酶Ⅲ的变异及其临床表现,再用贝叶斯公式计算变异条件下抗凝血酶Ⅲ缺乏的发病概率.结果显示当某个人被检测到抗凝血酶Ⅲ变异时将有大于90%的机会患遗传性抗凝血酶Ⅲ缺乏.     

基于概率神经网络的蛋白质亚细胞定位

文章通过对氨基酸词频的分析，应用概率神经网络来自动地进行蛋白质亚细胞定位．对于真核生物蛋白质的预测精度达到了82％。对于原核生物的预测精度则达到了92%．而且对于蛋白质序列N端缺失的情况有很好的鲁棒性．     

自适应遗传算法

自适应遗传算法采用自适应的适应度函数、交叉概率及变异概率代替固定的适应度函数、交叉概率及变异概率,与基本遗传算法相比,结果证明改进的遗传算法显著提高了收敛性能,并且具有很强的自适应能力.     

人血红蛋白β链氨基酸对的变异模式

根据氨基酸对可预测性分析人血红蛋白β链的244个变异,以确定哪些氨基酸对对变异更敏感。结果发现4种变异模式：（1）85.66%的变异发生在不可预测的氨基酸对,（2）绝大多数被替换掉的氨基酸对中包含一个或两个氨基酸对它们的实际频率大于预测频率,（3）79.51%的变异中被替换出的氨基酸对包含一个或两个在正常人β血红蛋白中不存在的氨基酸对,（4）大多数变异缩小了氨基酸对实际频率与预测频率之差。说明变异通常导致人血红蛋白β链的构成更随机、更稳定。     

改进的遗传算法及其仿真

从分析标准遗传算法存在的缺陷入手,提出了一种自适应选择交叉概率、变异概率以及交叉位置非等概率选取的改进的遗传算法并予以仿真,在仿真的基础上对标准遗传算法与改进遗传算法进行性能比较．     

初始种群范围及运行参数对遗传算法解算GPS病态方程的影响

通过实验研究了GPS快速定位病态方程中参数的搜索范围对基线及双差模糊度解算精度的影响,通过GPS基线解算实例研究了种群大小、交叉概率、变异概率及最大进化代数等参数设置对GPS基线及双差模糊度解算精度的影响。计算结果表明,如果测站近似坐标精度达到±0.5m以内,仅利用2个历元的单频载波相位观测数据,利用遗传算法可得到较准确的模糊度浮点解,有利于模糊度的快速固定。种群大小、交叉概率、变异概率及最大进化代数对遗传算法解算精度有一定的影响,通过实验将其分别设置为80,0.75,0.02,400,计算结果表明这些参数的设置是合适的。     

蛋白质亚细胞定位的序列分析

对SWISSPROT(2002年)数据库中经过筛选得到的12类亚细胞序列的氨基酸单个出现的概率、紧邻出现的概率进行统计和比较,结果表明,除个别类之间氨基酸单个出现的概率、紧邻出现的概率比较接近外,在大多数类之间氨基酸单个出现的概率、紧邻出现的概率是有明显区别的.     

双向变异S-概率粗集和它的属性概率性质

利用双向变异S-粗集的属性动态迁移特性,结合知识库中的统计信息,提出了双向变异S-概率粗集.讨论了双向变异S-概率粗集的属性概率性质,为获得动态的决策规则奠定了基础.利用上述讨论,给出了一个具体的应用实例.     

一种改进变异控制策略的遗传算法研究

早熟收敛问题是遗传算法中影响寻优效果的重要因素。分析了变异策略中由经验参考值确定的变异概率对样本多样性的影响，提出了采用自适应变异控制变异算子的方法，阐述了根据进化过程选择变异时机和变异概率的思路。通过实例计算结果的比较，证明了改进自适应变异算法可以有效地解决早熟收敛问题。     

人囊性纤维化跨膜电导调节子蛋白的变异模式研究

【目的】编码囊性纤维化跨膜电导调节子（Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator，CFTR）蛋白的基因突变可引起囊性纤维化，但该蛋白错义点突变的变异模式尚无报道。【方法】先用氨基酸对可预测性为指标将人CFTR蛋白及其178个错义点突变的氨基酸序列转换成标量序列，然后分析变异前后被替换掉的和替换出的氨基酸对的变化。【结果】97．19％的变异发生在不可预测的氨基酸对；87．08％的变异涉及1个或2个被替换掉的氨基酸对，其实际频率大干预测频率；15．17％的变异带来1个或2个替换出的氨基酸对，它们在正常的CFTR蛋白是不存在的；共有122个变异导致替换出的氨基酸对的实际频率小干预测频率。【结论】不可预测的氨基酸对对变异更敏感，变异的趋势是缩小氨基酸对实际频率和预测频率之间的差距，使氨基酸对的构成更加随机化，而人CFTR蛋白的这种退行性变导致了囊性纤维化。     

多失效模式下基本变量的重要性测度及其解法

基本变量的重要性分析是工程设计及安全评估的一项必要工作．针对工程实际中经常出现的多失效模式可靠性模型,提出了基本变量对多失效模式下多维响应功能函数全局联合概率分布的重要性测度指标——重要性测度1．同时针对可靠性设计的特点,建立了多失效模式下基本变量对多维响应功能函数局部概率分布的两种重要性测度指标,即基本变量对失效域内多维响应概率分布的重要性测度——重要性测度2和对系统失效概率的重要性测度——重要性测度3,推导了其性质,比较了3种重要性测度的异同和适用范围,并给出了一种求解3种重要性测度的标准方法,从该标准方法的求解过程可以看出,在求解基本变量对多维响应功能函数重要性测度1的同时可求得重要性测度2和3,也即在不增加计算量的同时,该标准方法可为设计人员提供更多的参考信息．最后,以数值和工程算例验证了所提指标和方法的正确性和可行性．     

从必需氨基酸含量组成看鱼粉的品质

氨基酸的含量是鉴定鱼粉质量的一个重要的指标 ,针对鱼粉市场上存在的掺假现象 ,我们对鱼粉的必需氨基酸含量的变化范围加以分析 ,并对几个特征性鱼粉的必需氨基酸含量的异常变化进行讨论 ,结合镜检 ,来辨别鱼粉的质量优劣和真伪     

一种改进的自适应遗传算法

在对自适应遗传算法中选择、交叉、变异算子作用分析的基础上,提出一种新的自适应遗传算法,新算法基于实数编码机制,选择操作采用精英选择与轮盘赌相结合,变异和交叉操作采取根据适应度自适应地非线性调整变异和交叉概率的策略,同时提出进化的后期采取先变异后交叉的操作次序.仿真实验表明,新算法有效防止早熟,收敛速度更快,鲁棒性更好且拥有较强的寻优能力.     

四川马海毛的氨基酸分析

用日立835－50型氨基酸分析仪对四川马海毛的氨基酸进行了测试分析。结果表明：四川马海毛与另几种动物纤维所包含的氨基酸种类基本一致，且各氨基酸含量相近；四川马海毛的氨基酸总一为76．19％，比张忠英和薛纪莹老师报道的陕北马海毛低22．02个百分点；高含硫氨基酸总含量为16．71％，低硫的为31．12％，与陕北马洗毛纤维是同样规律；胱氨酸含量为6．32％；四川马海毛氨的含量为0．76％，低于其它几种对比纤维的氨含量。     

甲型流感病毒基质蛋白2家族的跨种属感染和跨亚型变异的统计学证据

从统计学视角分析甲型流感病毒基质蛋白2(M 2)的种属差异和亚型差异。首先,用氨基酸对的可预测性将1129个M 2蛋白质转换成1129标量数据,然后用Ⅰ型ANOVA分析这些数据,寻找是否存在种属和亚型的区别,最后用Ⅱ型ANOVA确定组间和组内的差异,进一步追踪跨种属感染和跨亚型突变的原因。得到3条统计学证据,说明甲型流感病毒可能发生跨种属感染和跨亚型突变,其原因是由于各种属和亚型之间的屏障不够强壮,导致突变易于跨越到其它种属或亚型。     

利用缩减样本空间方法替代贝叶斯公式的计算

条件概率的计算是概率论中极其重要的计算之一,一般有利用定义式计算和缩减样本空间计算两种方法．缩减样本空间计算法在先验概率问题计算上比较浅显易懂,但在后验概率问题上计算一般不采用这个方法,而是使用定义式来计算,后验概率的计算又和贝叶斯公式有较大的关系．着重讨论缩减样本空间计算法在后验概率问题上的应用．从而避免利用贝叶斯公式计算的繁琐过程．     

氯化铒与氨基酸配合物的稳定性研究

用分光光度法测定了稀土铒盐与甘氨酸(Gly,)组氨酸(L-His,)脯氨酸(L-Pro)形成配合物的组成及平衡常数,从而研究了稀土氨基酸配合物的稳定性,并用DFT-B3LYP方法和6-31G(d,p)基组计算了氨基酸中相关原子的净电荷,结果表明,配合物的稳定性主要受配体空间位阻的影响.     

Complete mutagenesis of the HIV-1 protease

Retroviruses encode a protease which needs to be active for the production of infectious virions. A disabling mutation in the protease results in the production of non-infectious virus particles and examination of proteins from these mutant virions reveals unprocessed Gag and Gag-Pol precursor proteins, the substrates of the viral protease. Each amino acid of the HIV-1 protease was individually mutated using a simple mutagenesis procedure which is capable of introducing and identifying missense mutations in each residue of a protein. Phenotypic screening of these mutants in a heterologous assay system reveals three regions within the protease where multiple consecutive amino-acid residues are sensitive to mutation. These results show that random mutagenesis can be used to identify functionally important regions within a protein. Mutants with conditional phenotypes have also been identified within this collection.