利用RAPD标记研究桂林桂花品种间的亲缘关系(英文)

<正>采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,从100个随机引物中筛选出扩增效果较好的20个引物,分析桂林市23个桂花品种的基因组多态性。结果表明,20个随机引物共检测到193个位点,其中多态位点为114个,占59.1％。根据扩增结果对这些品种进行聚类分析,并构建出了树状聚类图,可将这些品种划分为4个品种群,与传统分类学结果一致。此项研究表明,以基因型为基础分析桂花品种间的区别是可行的。因此,RAPD技术为解决桂林市的桂花品种分类问题提供了重要依据。     

桂花品种的ISSR-PCR分析

利用ISSR—PCR方法对桂花的54个品种进行了基因组多态性分析,从70个ISSR引物中筛选出13个多态性引物用于正式扩增,共扩增出90条DNA片段,其中多态性DNA带79条,占总扩增片段的87.8％,平均每个引物扩增的DNA带的数目为6.92条。依据扩增结果,应用RAPD Distans软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,利用UPGMA法构建聚类树状图。结果表明:ISSR分析中产生了一些品种特有的指纹图谱,因此ISSR技术在桂花品种和品种群(品系)的鉴定和阐明遗传关系中有很大的应用潜力。利用DNA扩增结果进行聚类分析,把供试桂花的54个品种分为7个大类,并对品种进行了处理及种下品种群的遗传关系进行了探讨。     

桂花品种的ISSR-PCR分析

<正>利用ISSR—PCR方法对桂花的54个品种进行了基因组多态性分析,从70个ISSR引物中筛选出13个多态性引物用于正式扩增,共扩增出90条DNA片段,其中多态性DNA带79条,占总扩增片段的87.8％,平均每个引物扩增的DNA带的数目为6.92条。依据扩增结果,应用RAPD Distans软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,利用UPGMA法构建聚类树状图。结果表明:ISSR分析中产生了一些品种特有的指纹图谱,因此ISSR技术在桂花品种和品种群(品系)的鉴定和阐明遗传关系中有很大的应用潜力。利用DNA扩增结果进行聚类分析,把供试桂花的54个品种分为7个大类,并对品种进行了处理及种下品种群的遗传关系进行了探讨。     

RAPD标记在桂花遗传多样性检测和品种鉴定中的应用

从100个随机引物中筛选出28个多态性稳定的引物,对34个桂花品种、6个桂花野生居群个体、5个木犀属其他种进行了遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析.共检测了231个位点,其中209个位点为多态位点(90.4%).不同品种群的多态性位点频率差异明显,按大小依次排序为银桂品种群＞四季桂品种群、金桂品种群＞丹桂品种群.聚类结果与形态分类结果不完全一致.利用来自引物A11和M18扩增的21条多态性条带构建了桂花品种的DNA指纹图谱,该图谱可以方便地应用于桂花品种的鉴定.不同桂花品种之间存在明显差异.研究结果表明,RAPD技术可用于桂花品种的鉴定和亲缘关系的探讨.     

RAPD标记在桂花遗传多样性检测和品种鉴定中的应用(英文)

<正>从100个随机引物中筛选出28个多态性稳定的引物,对34个桂花品种、6个桂花野生居群个体、5个木犀属其他种进行了遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析。共检测了231个位点,其中209个位点为多态位点(90.4％)。不同品种群的多态性位点频率差异明显,按大小依次排序为:银桂品种群>四季桂品种群、金桂品种群>丹桂品种群。聚类结果与形态分类结果不完全一致。利用来自引物A11和M18扩增的21条多态性条带构建了桂花品种的DNA指纹图谱,该图谱可以方便地应用于桂花品种的鉴定。不同桂花品种之间存在明显差异。研究结果表明,RAPD技术可用于桂花品种的鉴定和亲缘关系的探讨。     

怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.     

草鱼基因组随机扩增多态性引物及多态性位点的筛选

为了建立草鱼基因组DNA多态性分析的指标体系,应用RAPD技术,从180条10碱基随机引物中筛选出了31条能扩增出多态性DNA片段的引物。用这31条多态性引物共扩增出了327条重复性好、带型清晰、分辨率高的谱带。扩增产物的片段大小范围在400—2000bp之间。单一引物扩增条带为5—14条。用这些多态性引物在草鱼基因组DNA中检测到了93个多态性位点,并对这些多态性位点上的等位基因频率进行了统计分析。这31条多态性引物和所检测到的93个多态性位点初步为草鱼基因组的多态性分析提供了可靠的分析指标体系。     

不同性别类型黄瓜品种基因组DNA的提取及RAPD标记的初步研究

采用改良的异丙醇沉淀法成功地提取了11个不同性别类型黄瓜品种的基因组DNA.以此作为PCR扩增反应模板进行RAPD分析,结果从22个10bp随机寡核苷酸引物中筛选出2个引物S23和S91在全雌性品种MT700和其他性别类型的品种之间稳定地扩增出多态性.至于该多态性标记是否与黄瓜雌性性别有关,还有待进一步分析.     

大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术,对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究.从30个RAPD引物当中,筛选出11个具有多态性的引物,共扩增出多态性带224条,多态性条带比率为41.18%,从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物,共扩增出多态性带121条,多态性条带比率为50.21%.对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法,计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0.28和0.32.根据这两种标记的结果,采用UPGMA进行聚类分析,得到与生物学分类地位基本一致的结果.结果表明,在实验稳定性上,ISSR优于RAPD,且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异,RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究.     

蜡梅品种的RAPD分析

从200个随机引物中筛选出16个多态性稳定的引物,对38个蜡梅品种进行遗传多样性和亲缘关系RAPD分析.共扩增出154条DNA片段,其中,多态性DNA带98条,占总扩增片段的63.6%.应用Popgene32软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,并利用UPGMA法构建聚类树状图,把供试的38个蜡梅品种分为7个大类,聚类结果与形态分类结果基本一致.结果表明,RAPD标记可用于蜡梅品种鉴定和亲缘关系探讨.     

利用RAPD标记鉴定芥菜(Brasica juncea Cos.)品种(英文)

从６０种１０ｂｐ随机引物中筛选出７种引物,对８个芥菜变种的１６个品种（每个变种有２个品种）进行了随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）鉴定,能快速、灵敏、较为简便获得了１６个芥菜品种的基因组ＤＮＡ指纹图谱．结果表明,不同引物在１６个品种上都有其特征ＤＮＡ带,一般只有１条,少数有２条．在同１个变种的２个品种之间存在着丰富的ＲＡＰＤ标记,通过比较２个品种各自独具的ＲＡＰＤ标记,就可明确地将２个品种区分．在所用的７种引物中,没有１种能同时将８对芥菜品种全部区分开,但用２种或２种以上的引物就完全可以将８对芥菜品种全部区分开．     

25个彩叶桂无性系(品种)的数量分类研究

【目的】通过观测彩叶桂品种的枝叶性状并进行数量分类研究,为彩叶桂品种分类和优良品种选育提供参考依据。【方法】于春季对25个彩叶桂品种进行形态学特征观察,以观测的35个枝叶性状指标数据进行R型聚类分析和主成分分析,去掉相关性较大且累积贡献率较小的性状指标,然后对25个彩叶桂品种进行Q型聚类分析。【结果】R型聚类结果显示:除彩叶桂叶面是否皱缩和侧脉是否隆起,叶片横切面与主脉凹凸度,叶柄颜色与新枝是否双色,成熟叶叶色、成熟叶有无花斑、幼叶色彩类型、叶片色彩类型、幼叶颜色和叶色有较明显的相关性外,各性状相对独立。主成分分析结果显示:共提取11个主成分,累计贡献率为87.618%,前9个主成分累计贡献率为81.157%,主要反映了彩叶桂各阶段色彩表现、叶大小、叶缘锯齿及叶面形态等。Q型聚类结果显示:25个彩叶桂品种按成熟叶叶色分为2大类,又由叶宽分为3类,最后根据叶宽、幼叶色彩类型、叶片横切面、叶形、叶片质地和叶脉色彩等分为10个组。【结论】R型聚类分析、主成分分析和Q型聚类分析表明,叶色、幼叶颜色、成熟叶叶色、叶型、叶面是否皱缩、叶片横切面、叶宽和叶形等性状可作为彩叶桂品种形态学分类的性状指标。综合而言,成熟叶叶色、叶片横切面和叶宽是此次数量分类得出的主要的标准和依据,但是否为该树种最主要的分类标准和依据还需进一步探讨和验证。     

运用AHP法综合评价河南部分桂花品种

运用层次分析法对河南省的17个桂花品种进行了生产加工利用和园林观赏应用方面的综合评价．就花色、花香、花期等12个因子对该17个品种其进行综合考察，按评分标准计算出每一品种的综合分值，将它们划分为四个等级．总体评价表明，四季桂的品种得分相对较低，金桂品种群和丹桂品种群的大部分桂花品种在生产加工利用和园林观赏方面有着较高的利用价值，得分也较高．     

Characterization and molecular marker screening of a rice bacteria-resistant gene Xa-min(t)

To test the resistant spectrum of the Xa-min(t) gene introgressed from Oryza minuta, thirty-four isolates of different bacterial blight pathogen, Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo), from 11 countries were used to inoculate the Xa-min(t) introgression line 78-15. Four rice cultivars, IR24, C64 (IRBB21), Nipponbare and Zhonghua 11 were used as controls. The results showed that the Xa-min(t) gene was broad-spectrum and highly resistant to diverse Xoo isolates. The methods of bulk segregant analysis (BSA), randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and sequence characterized amplified regions (SCAR) were used to analyze F2 individuals of the hybrid IR24×78-15 and molecular genetic markers linked to Xa-min(t) gene were identified. A total of 800 arbitrary decamer oligonucleotide primers were used for RAPD analysis. Two RAPD markers, BE05300 and BE061400, produced by primers BE05 and BE06 respectively, were closely linked to the Xa-min(t) gene. Based on the sequences of these two markers, sequence specific primers were designed and used to screen all F2 plants. One RAPD marker, BE05300, was converted into a stable SCAR marker (ScBE05300). Linkage analysis was carried out using markers ScBE05300 and BE061400 on 948 and 719 F2 individuals of the hybrid IR24×78-15. Our results indicate that the genetic distances from Xa-min(t) to ScBE05300 and BE061400 are 2.2 cM and 3.7 cM respectively on the same side. This study may facilitate the construction of the fine physical map of the Xa-min(t) gene.