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牦牛GSTK1基因序列特征分析及其组织表达谱构建
引用本文:潘帮婷,熊显荣,于海玲,杨满珍,胡宇磊,朱艳锦,费熙熙,李键.牦牛GSTK1基因序列特征分析及其组织表达谱构建[J].西南民族大学学报(自然科学版),2022(6):598-605.
作者姓名:潘帮婷  熊显荣  于海玲  杨满珍  胡宇磊  朱艳锦  费熙熙  李键
作者单位:1. 西南民族大学畜牧兽医学院;2. 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室;3. 动物科学国家民委重点实验室
基金项目:中央高校基本科研业务费专项资助项目(2022NYXXS039);
摘    要:旨在探讨谷胱甘肽硫转移酶K1(Glutathione S-Transferase Kappa1,GSTK1)基因序列特征.以牦牛为试验对象,通过RT-PCR技术扩增GSTK1基因序列并分析生物信息学,采用RT-qPCR技术构建其在牦牛不同组织中的表达谱.ORF分析显示,牦牛GSTK1基因编码区为618 bp,编码氨基酸为205个.系统发育树分析显示,牦牛与野牦牛(99.68%)、黄牛(99.68%)和野牛(99.40%)之间的同源性最高,与北极熊(87.63%)、野猪(87.25%)和马(87.01%)之间的同源性最低.蛋白预测分析显示,GSTK1蛋白为不稳定的亲水蛋白,存在12个磷酸化位点.高级结构预测分析显示,GSTK1蛋白的主要成分为α-螺旋(50.73%)、无规卷曲(40.00%)和延伸链(9.27%).组织表达分析发现GSTK1在所检测牦牛卵巢、小肠、脾、肝、肾、肌肉、肺和心组织中均有表达,其中表达量最高的组织是肝,表达量最低的组织是脾和心,且与其他组织差异显著(P<0.05).本研究获得了牦牛GSTK1基因的序列特征及组织表达谱,为进一步挖掘牦牛GSTK1基因的功能提...

关 键 词:牦牛  GSTK1基因  序列特征  生物信息学  组织表达谱
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