| 深海沉积物中产淀粉酶细菌的rep—PCR基因指纹分析 |
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| 引用本文： | 戴世鲲,郑天凌,郑伟,王晓颖.深海沉积物中产淀粉酶细菌的rep—PCR基因指纹分析[J].厦门大学学报(自然科学版),2005,44(6):171-174. |
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| 作者姓名： | 戴世鲲 郑天凌 郑伟 王晓颖 |
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| 作者单位： | [1]厦门大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 [2]厦门大学生命科学学院应用与环境微生物研究所／／近海海洋环境科学国家重点实验室（厦门大学），福建厦门361005 |
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| 摘 要： | 利用淀粉酶筛选培养基平板从27个深海沉积物样品中筛选得到30个具有胞外淀粉酶活性的菌株．其中革兰氏阴性细菌有22株．阳性细菌有8株．对这些细菌的基因组DNA进行ERIC—PCR和BOX—PCR扩增．指纹图谱显示大部分菌株均存在数目不等的各自独特的带型．各特异性扩增的主带型能重复稳定出现．比较两种引物的指纹图谱．显示ERIC—PCR比BOX—PCR具有较丰富的图谱多态性．对产生的指纹图谱进行聚类学分析．30株细菌可分为10组．其中5株细菌分别独立成组．最多的第Ⅱ组包含有8株细菌．而在同一聚类组内的细菌可能是处于进化上亲缘关系较近的位置．研究显示，30株菌具有丰富的种属多样性．揭示了深海微生物资源的丰富和潜力．ERIC—PCR和BOX—PCR技术可用于对深海微生物群落组成和多样性的研究．
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| 关 键 词： | 深海沉积物 指纹分析 R基因 rep 革兰氏阴性细菌 指纹图谱 ERIC 基因组DNA 特异性扩增 PCR扩增 淀粉酶活性 筛选培养基 深海微生物 PCR技术 微生物资源 BOX 亲缘关系 群落组成 多样性 显示 聚类组 多态性 丰富 带型 菌株 |
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