水稻籼粳杂种不育基因座Sc的遗传图和物理图精细定位 |
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作者姓名: | 杨存义 陈忠正 庄楚雄 梅曼彤 刘耀光 |
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作者单位: | 华南农业大学生命科学学院,广州,510642;华南农业大学根系生物学中心,广州,510642;华南农业大学生命科学学院,广州,510642 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(973计划),国家高技术研究发展计划(863计划),国家科技专项基金,国家自然科学基金 |
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摘 要: | 杂种不育是水稻籼粳亚种间杂种优势利用的主要障碍.为了克隆1个籼粳杂种不育基因Sc,利用分子标记和近等基因系杂交产生的F2群体对Sc座位进行了精细定位.初步的连锁分析结果表明,Sc座位与第3染色体的4个分子标记以RM218-RG369-Sc-RG227-RG391的关系连锁,其中RG227与Sc座位之间的遗传距离为0.07 cM.用RG227为起始探针筛选籼稻的TAC基因组文库,并通过染色体步移构建了一个覆盖Sc座位的跨度约320kb的克隆重叠群.对可能覆盖Sc的2个TAC克隆M45E14和M90J01进行了部分测序.用TAC克隆序列和RG227序列搜索水稻基因组序列数据库,锚定了粳稻BAC克隆OSJNBb0078P24(148kb)序列.通过比较TAC和BAC克隆的序列,在Sc座位区域发展了6个新的基于PCR的标记.用这些标记进一步把Sc座位定位在一个约46kb的区域内.从定位结果推测该BAC克隆和TAC克隆M45E14包含Sc基因.基因预测分析显示,在此46 kb区域内有6个预测的ORF.
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关 键 词: | 水稻 杂种不育 基因定位 物理图 |
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