4种竹子木质素合成酶PAL的基因克隆和序列分析 |
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引用本文: | 李潞滨,刘蕾,张淑萍,何聪芬,胡桃,庄彩云. 4种竹子木质素合成酶PAL的基因克隆和序列分析[J]. 科技导报(北京), 2009, 27(22): 19-25 |
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作者姓名: | 李潞滨 刘蕾 张淑萍 何聪芬 胡桃 庄彩云 |
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作者单位: | 中国林业科学研究院林业研究所;国家林业局林木培育重点实验室,北京,100091;北京工商大学化学与环境工程学院;植物资源研究开发北京市重点实验室,北京,100048;北京工商大学化学与环境工程学院;植物资源研究开发北京市重点实验室,北京,100048;首都师范大学生命科学学院,北京,100048 |
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基金项目: | "十一五"国家科技支撑计划项目,引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目 |
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摘 要: | 苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine Ammonia—Lyase,PAL;EC4.3。1.5)是木质素生物合成过程的关键酶和限速酶。应用RACE(Rapid—Amplification of cDNA Ends)方法,获得了白哺鸡竹(Phyllostachys dulcis)、高节竹(Phyllostachys prominens)、龙鳞竹(Phyllostachys pubescens heterocycla)、丽水苦竹(Fveioblastus maculosoides Wen)等4种竹子PAL基因的全长序列,并进行了生物信息学分析。结果表明,PAL基因的开放读码框长度为2136bp,共编码712个氨基酸,具有2个外显子和1个内含子。其中高节竹、龙鳞竹、丽水苦竹PAL基因内含子长度为121bp,白哺鸡竹朋L基因内含子长度为84bp。推测其氨基酸序列,并分析PAL蛋白单体的三维结构,结果显示PAL蛋白均含有大量的α螺旋和β折叠结构。基于邻接法的进化树对31个物种的PAL基因的氨基酸序列分析表明。竹类植物PAL基因的保守性较高,与禾本科植物玉米、甘蔗的亲缘关系较近,与双子叶植物辣椒等的亲缘关系较远。
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关 键 词: | 竹 木质素 苯丙氨酸解氨酶 RACE |
Gene Cloning and Sequence Analysis of Phenylalanine Ammonia-Lyase in Bamboo Lignin Synthase |
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Abstract: | |
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Keywords: | RACE bamboo lignin phenylalanine ammonia-lyase rapidamplification of cDNA ends |
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