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基于SVM-RFE的水稻抗病基因筛选
作者姓名:付媛  王岩  周柚  张帆  王珏鑫  梁艳春
作者单位:1. 吉林大学 计算机科学与技术学院, 长春 130012; 2. 吉林大学 数学学院, 长春 130012
基金项目:国家自然科学基金(批准号:61073075;60903097); 国家高技术研究发展计划863项目基金(批准号:2009AA02Z307); 教育部博士点基金(批准号:20090061120094); 吉林省青年基金(批准号:20090116)
摘    要:提出一种改进的回归特征消去支持向量机特征选择方法(SVM-RFE)对水稻的抗病基因进行筛选. 实验结果表明: 在预测得到的20个与水稻抗病/敏感相关基因中, 有3个基因与已知的水稻抗病基因紧密相关; 2个基因与已知的水稻抗病基因有一定的相关性. 通过该方法能找到影响水稻生长状态(正常/染病)的基因.

关 键 词:回归特征消去支持向量机   基因筛选   水稻抗病,
收稿时间:2011-02-26
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