基于SVM-RFE的水稻抗病基因筛选 |
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作者姓名: | 付媛 王岩 周柚 张帆 王珏鑫 梁艳春 |
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作者单位: | 1. 吉林大学 计算机科学与技术学院, 长春 130012; 2. 吉林大学 数学学院, 长春 130012 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(批准号:61073075;60903097); 国家高技术研究发展计划863项目基金(批准号:2009AA02Z307); 教育部博士点基金(批准号:20090061120094); 吉林省青年基金(批准号:20090116) |
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摘 要: | 提出一种改进的回归特征消去支持向量机特征选择方法(SVM-RFE)对水稻的抗病基因进行筛选. 实验结果表明: 在预测得到的20个与水稻抗病/敏感相关基因中, 有3个基因与已知的水稻抗病基因紧密相关; 2个基因与已知的水稻抗病基因有一定的相关性. 通过该方法能找到影响水稻生长状态(正常/染病)的基因.
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关 键 词: | 回归特征消去支持向量机 基因筛选 水稻抗病, |
收稿时间: | 2011-02-26 |
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