| 人类核糖体蛋白加工假基因在进化中的熵变 |
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| 引用本文： | 刘国庆,李宏,王芳平,应智强.人类核糖体蛋白加工假基因在进化中的熵变[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2007,38(6):647-653. |
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| 作者姓名： | 刘国庆 李宏 王芳平 应智强 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金
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教育部高等学校博士学科点专项科研基金 |
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| 摘 要： | 用生物信息学方法计算出人类核糖体蛋白加工假基因(RP加工假基因)的进化距离.假定在统计意义上,不同进化距离的假基因可粗略代表假基因的进化历程.在此假定基础上从信息论的角度去研究假基因在进化中的熵变.结果发现,1) 假基因序列的紧邻碱基关联随进化逐步增强;2) k-mer信息熵中,小k-mer(k=1,2,…,5)信息熵随进化减少,大k-mer(k=7,8)信息熵随进化先迅速减少,随后增加;3) 关联信息熵随进化减少,其中紧邻碱基关联信息熵的减少幅度最明显.这些可能与背景突变压力作用有关.
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| 关 键 词： | 加工假基因 紧邻碱基关联 k-mer信息熵 关联信息熵 背景突变压力 人类 核糖体 蛋白加工 假基因 熵变 Evolution During Protein Human Variation 压力作用 突变 背景 信息熵 增强 关联 碱基 紧邻 基因序列 发现 |
| 文章编号： | 1000-1638（2007）06-0647-07 |
| 收稿时间： | 2007-03-27 |
| 修稿时间： | 2007年3月27日 |
Entropy Variation of the Human Ribosomal Protein Processed Pseudogenes During Evolution |
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| LIU Guo-qing,LI Hong,WANG Fang-ping,YING Zhi-qiang.Entropy Variation of the Human Ribosomal Protein Processed Pseudogenes During Evolution[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,2007,38(6):647-653. |
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| Authors: | LIU Guo-qing LI Hong WANG Fang-ping YING Zhi-qiang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | processed pseudogene adjacent base correlation k-mer information entropy correlation information entropy background mutational pressure |
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