小西葫芦黄花叶病毒石河子分离物的分子变异

为了研究小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)石河子分离物的分子变异情况,本研究采用ELISA及一步法RT-PCR对2010-2014年采自石河子地区的30个葫芦科植物样品进行ZYMV检测,从阳性样品中通过一步法RT-PCR克隆其ZYMV分离物的CP基因,经PCR-SSCP分析,将带型一致的ZYMV分离物进行归类,每种类型中选取1个代表性的分离物进行CP基因测序,分析其核苷酸及推导的氨基酸序列的差异。结果显示:2种检测方法的检出率分别为63.33%和83.33%;根据ZYMV CP基因SSCP带型,将21个分离物分为5种不同的类型;其5个代表性分离物的CP核苷酸序列相似性为93.0%-99.8%,在系统进化树中位于2个不同的亚组;氨基酸序列的相似性为96.1%-99.6%,变异主要集中在N端的前41个氨基酸。这表明ZYMV石河子分离物间存在一定程度的分子变异。