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贵州草海鲫鱼Spo11基因的克隆、生物信息学和表达分析
引用本文:董然然,陈修云,王岗屹,吕昌乾
. 贵州草海鲫鱼Spo11基因的克隆、生物信息学和表达分析
[J]. 重庆师范大学学报(自然科学版), 2018, 0(4): 25
作者姓名:董然然  陈修云  王岗屹  吕昌乾
作者单位:贵州大学 动物科学学院,贵阳 550025
摘    要:【目的】探索环境内分泌干扰物壬基酚(Nonylphenol,NP)对贵州草海鲫鱼(Carassius auratus)Spo11 基因表达的影响。【方法】通过PCR方法克隆实验鱼Spo11 基因,利用生物信息学方法分析SPO11蛋白的氨基酸序列、理化性质和结构特点;并设置1个对照组和低、中、高共3个不同剂量NP处理组,用NP质量浓度分别为0,25,50和100μg·L-1的水体浸浴实验鱼28d后,检测各组实验鱼Spo11 基因的表达情况。【结果】Spo11 基因c DNA序列长度为1471bp(Gen-Bank登录号:MF66470),包括66bp的5′非翻译区、编码383个氨基酸的1152bp的开放阅读框和253bp的3′非翻译区。预测SPO11蛋白质相对分子质量为43.23k Da,等电点IP为6.89,主要由亮氨酸、丝氨酸和缬氨酸组成。该蛋白是含有信号肽的不稳性亲水蛋白,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。与对照组实验鱼的Spo11 基因相对表达量相比,中剂量和高剂量的NP处理组实验鱼Spo11 基因相对表达量均有所升高,与前者的差异均具有统计学意义(p<0.05)。【结论】环境内分泌干扰物NP可以影响贵州草海鲫鱼Spo11 基因的表达。


关 键 词:贵州草海鲫鱼  Spo11基因  基因克隆  生物信息学  壬基酚

Cloning, Bioinformatic, and Expression Analysis of Spo11 Gene of Crucian Carp in Caohai Lake of Guizhou Province
DONG Ranran,CHEN Xiuyun,WANG Gangyi,LÜ Changqian
. Cloning, Bioinformatic, and Expression Analysis of Spo11 Gene of Crucian Carp in Caohai Lake of Guizhou Province
[J]. Journal of Chongqing Normal University:Natural Science Edition, 2018, 0(4): 25
Authors:DONG Ranran,CHEN Xiuyun,WANG Gangyi,LÜ   Changqian
Abstract:
Keywords:
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