稻瘟病菌中侵染初期特异表达的转录因子筛选

稻瘟病是威胁水稻产量的重要病害,弄清楚稻瘟病菌与水稻的互作对于防控稻瘟病具有重要的意义。转录因子是调控基因表达的重要因子,对于调控稻瘟病菌的生长发育和致病性具有重要作用。为了寻找在稻瘟病菌侵染初期特异表达的转录因子,我们首先从稻瘟病菌数据库中找到486个假定的转录因子,然后通过RT-PCR方法筛选出30个在侵染时期特异表达的转录因子。这些转录因子根据结构域的不同可以分为10种类型。具体来讲,9个属于Zn2Cys6类转录因子,4个属于C2H2 zinc finger类转录因子,6个属于HMG类转录因子,携带Transcription factor jumonji和Nucleic acid-binding,OB-fold结构域的转录因子分别含有3个,而携带Winged helix repressor DNA-binding结构域、ss DNA-binding transcriptional regulator结构域、Homeodomain-like结构域、zinc finger MIZ-type结构域和zinc finger DHHC-type结构域的转录因子分别含有1个。