| 蛋白质三维结构预测问题的求解方法 |
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| 引用本文： | 许如初,李红华.蛋白质三维结构预测问题的求解方法[J].华中科技大学学报(自然科学版),2007,35(9):98-100. |
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| 作者姓名： | 许如初 李红华 |
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| 作者单位： | 华中科技大学,计算机科学与技术学院,湖北,武汉,430074 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划)
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国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 对蛋白质结构预测问题进行了描述,根据蛋白质结构预测问题在三维欧氏空间的连续模型,通过拟物策略找到了相应的数学模型.由于引入了弹性势能和嵌入势能,将一个有约束的问题转化为一个无约束的问题,并在梯度下降法求解的基础上,设计出一种变步长梯度下降的求解方法.通过实例检测,变步长梯度下降法比梯度下降法大大节省了计算时间,且所得结果的能量比梯度下降法所得结果的能量更低.
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| 关 键 词： | 蛋白质结构预测 拟物算法 折叠 弹性势能 嵌入势能 蛋白质 三维结构 预测问题 求解方法 protein structure prediction 能量比 结果 时间 计算 实例检测 梯度下降法 变步长 设计 无约束 转化 弹性势能 数学模型 拟物策略 连续模型 三维欧氏空间 |
| 文章编号： | 1671-4512（2007）09-0098-03 |
| 修稿时间： | 2006-09-15 |
The solution to the protein structure prediction |
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| Xu Ruchu,Li Honghua.The solution to the protein structure prediction[J].JOURNAL OF HUAZHONG UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY.NATURE SCIENCE,2007,35(9):98-100. |
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| Authors: | Xu Ruchu Li Honghua |
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| Institution: | College of Computer Science and Technology, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | protein structure prediction quasiphysical algorithm folding elasticity potential energy press potential energy |
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