| 人类基因组非冗余Exon/Intron数据库的构建 |
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| 引用本文： | 罗冬梅,金鹰,邓小元,刘海.人类基因组非冗余Exon/Intron数据库的构建[J].华南师范大学学报(自然科学版),2010,0(4). |
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| 作者姓名： | 罗冬梅 金鹰 邓小元 刘海 |
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| 作者单位： | 1.1.华南师范大学生物光子学研究院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金专项项目/科学部主任基金，国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 以Homo.sapiensRefSeq作为原始数据库来构建EID(Exon/Intron Database)可以克服GenBank所带来的冗余问题.通过分析RefSeq基因组数据库中每个CDS(Coding Sequence,编码序列),获得构建EID的相关的数据(基因的定义、基因标识符、基因序列、蛋白质标识符、蛋白质序列、外显子和内含子的数量、大小、总数、非翻译区(UTR)内含子、内含子相位、内含子剪切位点模式).结果表明,人类24条染色体(22条常染色体和2条性染色体,共计2 870 827355 bps)中含有32 157个基因标识符(gene blocks),其中7 398个基因为假基因,4 014个基因发生了可变剪切(Al-ternative Splicing,AS),15 533个基因含有CDS内含子,765个基因含有UTR内含子,2 585个基因不含有内含子,其他的为异常基因.
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| 关 键 词： | 非冗余外显子/内含子数据库 RefSeq H.sapiens 编码序列 非翻译区 |
| 收稿时间： | 2010-04-12 |
CONSTRUCTION OF HUMAN NON-REDUNDANT EXON/INTRON DATABASE |
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| LUO DongMei,JIN Ying,DENG XiaoYuan,LIU Hai.CONSTRUCTION OF HUMAN NON-REDUNDANT EXON/INTRON DATABASE[J].Journal of South China Normal University(Natural Science Edition),2010,0(4). |
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| Authors: | LUO DongMei JIN Ying DENG XiaoYuan LIU Hai |
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| Abstract: | |
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