| 产活性氧假交替单胞菌GCY全基因组序列分析 |
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| 作者姓名： | 岳昊 吴硕 王竞 李泽龙 顾晨 |
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| 作者单位： | 1. 大连理工大学环境学院;2. 中国电建集团华东勘测设计研究院有限公司 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(21876018,42177375); |
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| 摘 要： | 生物源活性氧(reactive oxygen species, ROS)是环境ROS的重要来源,在生物元素地球化学循环中发挥着重要作用.但目前关于产ROS微生物的生物学信息尚不完善,影响微生物ROS产生的因素也未知.为此从近海沉积物中分离得到一株产胞外ROS的假交替单胞菌GCY(Pseudoalteromonas sp.GCY),利用全基因组测序表征了其潜在生物学功能.结果表明菌株GCY基因组大小为5.47 Mb, GC含量为43.39%,与胞外ROS产生相关的基因包括lodA、lodB和nqrA-F等.此外,氨基酸和Na+被证实影响胞外ROS的产生.进一步通过比较基因组分析,推测具备产胞外ROS能力的微生物在环境中广泛存在.综上,提供了产胞外ROS微生物全基因组分析报告,在分子水平上加深了对生物源ROS产生的理解,为开发利用各种环境中生物源ROS及认知生物源ROS的环境意义提供了重要视角.
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| 关 键 词： | 活性氧(ROS) 微生物 全基因组 影响因素 |
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