高致病病毒序列中高AT含量回文结构的研究 |
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引用本文: | 李瑞芳,李宏.高致病病毒序列中高AT含量回文结构的研究[J].内蒙古师范大学学报(自然科学版),2008,37(6). |
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作者姓名: | 李瑞芳 李宏 |
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作者单位: | [1]内蒙古大学物理科学与技术学院,内蒙古呼和浩特010021 [2]内蒙古师范大学物理与电子信息学院,内蒙古呼和浩特010022 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目
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摘 要: | 统计分析了SARS病毒及其他几种冠状病毒全序列、艾滋病病毒全序列、丙型肝炎病毒全序列中,中间间隔S从0~100、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构.通过分析不同S,L的回文结构的频数以及AT含量,发现了一些特殊的回文结构,这些特殊结构的共同特点是AT含量高,而且都处于病毒中编码重要蛋白的序列中.综合考虑3种高致病病毒序列中高AT含量的回文结构的特点及其所处位置的特殊性,推测高AT含量的回文结构是某种具有生物学意义的结构,在病毒的侵入、复制等方面扮演着非常重要的角色.
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关 键 词: | 回文结构 高致病病毒 AT含量 |
Study on AT-rich Palindromes in Several Sequences of High Pathogenic Viruses |
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Abstract: | |
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