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具有预后价值的乳腺癌发病关键基因鉴别研究
引用本文:徐久成,李成长. 具有预后价值的乳腺癌发病关键基因鉴别研究[J]. 河南师范大学学报(自然科学版), 2020, 48(2): 27-33. DOI: 10.16366/j.cnki.1000-2367.2020.02.005
作者姓名:徐久成  李成长
作者单位:河南师范大学生命科学学院细胞分化调控省部共建国家重点实验室培育基地,河南新乡453007;河南师范大学计算机与信息工程学院河南省智慧商务与物联网工程实验室,河南新乡453007,河南师范大学生命科学学院细胞分化调控省部共建国家重点实验室培育基地,河南新乡453007;新乡医学院基础医学院生理学与神经生物学教研室,河南新乡453003
摘    要:目的:筛选与乳腺癌发病相关的关键基因,为研究乳腺癌的诊疗提供新的潜在分子靶标.方法:使用GEO2R在线工具比较乳腺癌与正常乳腺组织基因表达情况,进行差异显著性分析,利用基因功能注释工具DAVID对差异基因进行GO和KEGG富集分析.通过STRING数据库构建差异基因的蛋白互作网络,基于最大团中心性(maximal clique centrality,MCC)算法鉴别关键基因,利用Kaplan Meier生存分析验证关键基因对患者生存时间的影响.结果:乳腺癌基因表达差异分析共产生491个差异基因,其中有254个上调,237个下调.GO富集分析表明差异基因显著富集于肿瘤相关的生物学过程、细胞组分和分子功能,KEGG通路富集分析主要集中于PI3K-Akt信号通路、黏附斑和癌症通路.基于MCC算法共选取10个关键基因,其中的4个基因(ISG15,IFIT1,GBP1和IFI27)过表达与患者生存时间显著降低密切相关(P0.05).结论:共鉴别了4个与乳腺癌发病密切相关的关键基因,相关研究结果可为研究乳腺癌的诊疗提供新的潜在分子靶标.

关 键 词:乳腺癌  关键基因  PI3K

Identification of key genes in breast cancer of prognostic value
Xu Jiucheng,Li Chengzhang. Identification of key genes in breast cancer of prognostic value[J]. Journal of Henan Normal University(Natural Science), 2020, 48(2): 27-33. DOI: 10.16366/j.cnki.1000-2367.2020.02.005
Authors:Xu Jiucheng  Li Chengzhang
Abstract:
Keywords:
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