藏羚羊(AAC)_n微卫星富集文库构建与引物筛选 |
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引用本文: | 徐永涛,;马建滨,;周智红,;谭春敏,;张湑,;郭松长,;都玉蓉.藏羚羊(AAC)_n微卫星富集文库构建与引物筛选[J].青海师范大学学报(自然科学版),2014(1):41-46. |
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作者姓名: | 徐永涛 ;马建滨 ;周智红 ;谭春敏 ;张湑 ;郭松长 ;都玉蓉 |
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作者单位: | [1]青海师范大学生命与地理科学学院,青海西宁810008; [2]中国科学院高原生物适应与进化重点实验室,青海西宁810001 |
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基金项目: | 青海省应用基础研究计划(2013-Z-750;2013-Z-751). |
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摘 要: | 基于磁珠富集法,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AAC)8从藏羚羊(Tibetan antelope)基因组酶切的300~1000bp片段中筛选微卫星位点,纯化的富集片段连接到pCR@2.1载体和转化到Trans5α感受态细胞.随机挑取180个白斑克隆,PCR检测到条带数大于或等于2的阳性克隆为56个,阳性率为31.1%.对阳性克隆测序,获得43条含微卫星座位的序列,微卫星重复次数在5~20次之间.舍弃不适宜设计引物的微卫星座位,试验设计并合成了20对微卫星引物;以3个样点(青海、新疆、西藏)的24个藏羚羊基因组为模板进行PCR扩增,获得8对可得到稳定扩增产物的微卫星引物,其中4对引物的扩增产物具有多态性,座位分别为AAC050、AAC056、AAC165和AAC477.上述引物可用于藏羚羊及近缘物种的遗传多样性、种群遗传结构等研究.
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关 键 词: | 藏羚羊 微卫星 富集文库 (AAC)8探针 引物筛选 |
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