| 全反式维甲酸对SH-SY5Y细胞全基因组启动子区组蛋白H3乙酰化修饰的影响 |
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| 引用本文： | 方洪波,米洋,张业,沈珝琲.全反式维甲酸对SH-SY5Y细胞全基因组启动子区组蛋白H3乙酰化修饰的影响[J].科学通报,2009,54(1):46-52. |
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| 作者姓名： | 方洪波 米洋 张业 沈珝琲 |
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| 作者单位： | 中国医学科学院基础医学研究所/北京协和医学院基础医学院, 医学分子生物学国家重点实验室, 北京 100005 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(批准号: 90408007和30721063)和国家重点基础研究发展计划(批准号: 2004CB518605)资助项目 |
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| 摘 要： | 为研究全反式维甲酸(all-trans retinoic acid, ATRA, 简称RA)诱导人类神经细胞分化的表观遗传调控机制, 应用染色质免疫沉淀与启动子芯片联合技术(ChIP-on-chip), 对RA诱导24 h后神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞中两万余个基因启动子区的组蛋白H3乙酰化修饰状态进行了高通量检测和分析. 首先分别制备RA处理组和对照组的标记探针, 然后将人类基因组启动子芯片与探针进行杂交, 获得RA诱导SH-SY5Y细胞分化早期全基因组启动子区H3组蛋白乙酰化的数据. 结果分析显示, RA处理导致597个基因启动子的乙酰化程度显著升高、647个基因降低. 本研究结果显示上述技术的高效与可行, 并为深入研究RA诱导分化相关基因的表观遗传调控机制奠定了基础.
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| 关 键 词： | 全反式维甲酸(RA) 染色质免疫沉淀 启动子芯片 细胞分化 组蛋白乙酰化 |
| 收稿时间： | 2008-10-23 |
| 修稿时间： | 2008-11-12 |
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