| 细菌种特异性的16SrDNA寡核苷酸探针数据库的初步构建 |
| |
| 引用本文： | 蔡正求,宋未,东秀珠. 细菌种特异性的16SrDNA寡核苷酸探针数据库的初步构建[J]. 首都师范大学学报(自然科学版), 2004, 0(Z1) |
| |
| 作者姓名： | 蔡正求 宋未 东秀珠 |
| |
| 作者单位： | 首都师范大学生物系 北京100037(蔡正求，宋未)，中国科学院微生物研究所 北京100080(东秀珠) |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(批准号:30170035,30370032)，北京市自然科学基金资助项目(批准号:5012004)，北京市重点学科资助项目 |
| |
| 摘 要： | 核酸二级数据库是生物信息学研究的重要领域 ,对生命科学的研究和发展起重要作用 .目前 ,国际核酸序列公共数据库中存在大量的细菌 16SrDNA序列 ,本文利用这些已知细菌的 16SrDNA序列 ,设计了细菌种特异性的寡核苷酸探针 ,将其结果存入二级数据库 ,以计算机网络为载体 ,开发了界面友好的通过WWW浏览器实现对数据库查询的系统 ,其查询结果形象直观 ,为设计细菌的种特异性寡核苷酸探针提供了参考和帮助 ,从而可加速对细菌分类及鉴定的进程 .
|
| 关 键 词： | 细菌 种特异性 16SrDNA 寡核苷酸探针 二级数据库 |
Database Construction of the Species-specific Oligonucleotide Probes Targeted for 16S rDNA of Bacteria |
| |
| Cai Zhengqiu Song Wei Dong Xiuzhu. Database Construction of the Species-specific Oligonucleotide Probes Targeted for 16S rDNA of Bacteria[J]. Journal of Capital Normal University(Natural Science Edition), 2004, 0(Z1) |
| |
| Authors: | Cai Zhengqiu Song Wei Dong Xiuzhu |
| |
| Affiliation: | Cai Zhengqiu1 Song Wei 1 Dong Xiuzhu2 |
| |
| Abstract: | The secondary database that play an important role in the research and development of biology is a vital research subject in the field of bioinformatics.At present,there are enormous 16S rDNA sequences of bacteria available in the Genbank.In this paper the species-specific oligonucleotide probes for various bacteria according to 16S rDNA have been designed and stored into a database.And an user-friendly search system based on computer network has been constructed.This secondary database could be helpful for users to design oligonucleotide probes to classify and identify the bacteria more rapidly. |
| |
| Keywords: | Bacteria species-specific 16S rDNA oligonucleotide probe secondary database |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
