DNA序列二维图表示和有关分析 |
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作者姓名: | 刘西奎 李艳 许进 |
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作者单位: | 1. 山东科技大学信息科学与工程学院,泰安,271019;华中科技大学控制科学与工程系,武汉,430074 2. 山东科技大学信息科学与工程学院,泰安,271019 3. 华中科技大学控制科学与工程系,武汉,430074 |
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摘 要: | 在DNA序列研究中,对长DNA序列进行有效表示,可以为DNA序列的分类、分析和比较等研究提供创新性的方法. Nandy,Leong和Mogenthaler,Randic等已经给出了DNA序列的二维或三维图表示. 这些图表示给出了DNA序列的可视化特征. 文中给出了一个改进的DNA序列的图表示:在2维指数坐标系内用4个特定的向量分别表示DNA序列中的4个碱基,从而使DNA序列可以用有向路表示. 给出了一个例子说明该方法的有效性,可以证明该种改进的DNA序列图表示方法具有较低的退化度甚至没有退化.
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关 键 词: | DNA序列 序列 图表示 退化 |
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