|
|||||
|
|
| 基于蛋白质序列的氨基酸字母表简化 | |
| 引用本文： | 张鑫鹏,王骏,王炜.基于蛋白质序列的氨基酸字母表简化[J].南京大学学报(自然科学版),2022(1):103-114. |
| 作者姓名： | 张鑫鹏 王骏 王炜 |
| 作者单位： | 南京大学物理学院 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金（11774157,11934008）； |
| 摘 要： | 蛋白质的结构和功能特性由其氨基酸序列编码,控制序列结构映射的规则被认为是二级遗传密码,氨基酸字母表的简化可以减少蛋白质序列中的冗余,有助于揭示编码规则.基于氨基酸的单体特征、成对相互作用和相似性,可以简化氨基酸字母表.目前,仅基于蛋白质的序列信息,根据最近邻氨基酸的出现频率构建了一个氨基酸的嵌入表示.在此基础上,提出一... |
| 关 键 词： | 序列信息 氨基酸相互作用 AA2Vec 氨基酸字母表 |