伴矿景天WRKY基因家族鉴定及镉胁迫响应分析 |
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引用本文: | 王剑超,邱文敏,金康鸣,陆铸畴,韩小娇,卓仁英,刘晓光,何正权.伴矿景天WRKY基因家族鉴定及镉胁迫响应分析[J].南京林业大学学报(自然科学版),2023,47(2):49-60. |
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作者姓名: | 王剑超 邱文敏 金康鸣 陆铸畴 韩小娇 卓仁英 刘晓光 何正权 |
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作者单位: | 1.三峡区域植物遗传与种质创新重点实验室(三峡大学),三峡大学生物与制药学院,湖北 宜昌 4430022.中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江省林木育种技术研究重点实验室,浙江 杭州 3114003.唐山市农业科学研究院,河北 唐山 063001 |
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基金项目: | 国家重点研发计划子课题(2016YFD080080104) |
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摘 要: | 【目的】WRKY转录因子在植物响应非生物胁迫过程中发挥着重要的调控作用,目前超积累植物伴矿景天(Sedum plumbizincicola) WRKY转录因子的研究较少。进行SpWRKY基因家族的全基因组鉴定及其在镉胁迫下的表达模式分析可为后续SpWRKYs基因克隆和耐镉功能分析提供参考。【方法】对伴矿景天WRKY基因家族进行全基因组鉴定和生物信息学分析,利用转录组数据和qRT-PCR技术检测WRKY基因在镉胁迫下的表达模式并进行转基因拟南芥耐镉性的分析。【结果】伴矿景天基因组中共鉴定出77个SpWRKYs,非均匀地分布在各条染色体上;系统进化树分析发现,伴矿景天WRKY成员被分成3大类群(Ⅰ—Ⅲ),第Ⅱ类群又被分成5个亚群(Ⅱa—e);共线性分析发现,伴矿景天WRKY基因家族和拟南芥(Arabidopsis thaliana)之间存在7个共线基因对,和玉吊钟(Kalanchoe fedtschenkoi)之间存在53个共线基因对;SpWRKYs基因之间存在19个片段复制基因对;启动子序列分析发现,SpWRKYs启动子有多种与激素和逆境响应等相关的顺式调控元件;镉胁迫表达分析发现,7个...
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关 键 词: | 伴矿景天 WRKY转录因子 镉胁迫 基因表达 拟南芥转基因 |
收稿时间: | 2022-01-12 |
Comprehensive analysis of WRKY gene family in Sedum plumbizincicola responding to cadmium stress |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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